MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saccharophagus degradans 2-40

Total Repeats: 101515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007912	TG	3	6	58	63	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007912	TCT	2	6	127	132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007912	TCT	2	6	193	198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007912	GTTG	2	8	235	242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007912	GTTGT	2	10	303	312	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007912	TTTG	2	8	348	355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007912	GCA	2	6	481	486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019650
8	NC_007912	ATTGG	2	10	535	544	20 %	40 %	40 %	0 %	90019650
9	NC_007912	TGT	2	6	579	584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019650
10	NC_007912	CCG	2	6	588	593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90019650
11	NC_007912	ACCA	2	8	656	663	50 %	0 %	0 %	50 %	90019650
12	NC_007912	TGC	2	6	670	675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019650
13	NC_007912	A	6	6	681	686	100 %	0 %	0 %	0 %	90019650
14	NC_007912	GCA	2	6	688	693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019650
15	NC_007912	CAG	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019650
16	NC_007912	ATT	2	6	805	810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019650
17	NC_007912	CTG	2	6	813	818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019650
18	NC_007912	TAA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019650
19	NC_007912	ACA	2	6	846	851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90019650
20	NC_007912	GGGCA	2	10	890	899	20 %	0 %	60 %	20 %	90019650
21	NC_007912	TGT	2	6	976	981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019650
22	NC_007912	GCTTG	2	10	997	1006	0 %	40 %	40 %	20 %	90019650
23	NC_007912	GGT	2	6	1037	1042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019650
24	NC_007912	TA	3	6	1060	1065	50 %	50 %	0 %	0 %	90019650
25	NC_007912	GGTA	2	8	1105	1112	25 %	25 %	50 %	0 %	90019650
26	NC_007912	TG	3	6	1121	1126	0 %	50 %	50 %	0 %	90019650
27	NC_007912	GGT	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019650
28	NC_007912	TTG	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019650
29	NC_007912	TTA	2	6	1225	1230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019650
30	NC_007912	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019650
31	NC_007912	TTC	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019650
32	NC_007912	AGG	2	6	1293	1298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	90019650
33	NC_007912	TTC	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019650
34	NC_007912	ATT	2	6	1343	1348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019650
35	NC_007912	AGCAG	2	10	1480	1489	40 %	0 %	40 %	20 %	90019650
36	NC_007912	ACG	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019650
37	NC_007912	CGTG	2	8	1549	1556	0 %	25 %	50 %	25 %	90019650
38	NC_007912	TTG	2	6	1649	1654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019650
39	NC_007912	AGTA	2	8	1672	1679	50 %	25 %	25 %	0 %	90019650
40	NC_007912	GTA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019650
41	NC_007912	AC	3	6	1805	1810	50 %	0 %	0 %	50 %	90019650
42	NC_007912	TGG	2	6	1840	1845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019650
43	NC_007912	CA	3	6	1853	1858	50 %	0 %	0 %	50 %	90019650
44	NC_007912	AGA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019650
45	NC_007912	CAC	2	6	1948	1953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019650
46	NC_007912	TA	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007912	GTT	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007912	AG	3	6	2049	2054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007912	A	6	6	2078	2083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007912	GTTG	2	8	2189	2196	0 %	50 %	50 %	0 %	90019651
51	NC_007912	CGT	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019651
52	NC_007912	ATTG	2	8	2243	2250	25 %	50 %	25 %	0 %	90019651
53	NC_007912	AAG	2	6	2361	2366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019651
54	NC_007912	AT	3	6	2374	2379	50 %	50 %	0 %	0 %	90019651
55	NC_007912	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019651
56	NC_007912	GCA	2	6	2509	2514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019651
57	NC_007912	GCA	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019651
58	NC_007912	TAC	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90019651
59	NC_007912	TGT	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019651
60	NC_007912	CAAT	2	8	2692	2699	50 %	25 %	0 %	25 %	90019651
61	NC_007912	GCTT	2	8	2761	2768	0 %	50 %	25 %	25 %	90019651
62	NC_007912	AGA	2	6	2777	2782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019651
63	NC_007912	ACT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90019651
64	NC_007912	GC	3	6	2924	2929	0 %	0 %	50 %	50 %	90019651
65	NC_007912	TTCT	2	8	2962	2969	0 %	75 %	0 %	25 %	90019651
66	NC_007912	TCT	2	6	2993	2998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019651
67	NC_007912	TAT	2	6	3020	3025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019651
68	NC_007912	AAC	2	6	3030	3035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90019651
69	NC_007912	AAG	3	9	3043	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019651
70	NC_007912	AGGT	2	8	3094	3101	25 %	25 %	50 %	0 %	90019651
71	NC_007912	CTAC	2	8	3113	3120	25 %	25 %	0 %	50 %	90019651
72	NC_007912	AGA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019651
73	NC_007912	GTA	2	6	3225	3230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019651
74	NC_007912	TCC	2	6	3269	3274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_007912	TC	3	6	3305	3310	0 %	50 %	0 %	50 %	90019652
76	NC_007912	CAG	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019652
77	NC_007912	AGGT	2	8	3541	3548	25 %	25 %	50 %	0 %	90019652
78	NC_007912	CCA	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019652
79	NC_007912	ATA	2	6	3642	3647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019652
80	NC_007912	CTTTG	2	10	3659	3668	0 %	60 %	20 %	20 %	90019652
81	NC_007912	AAC	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90019652
82	NC_007912	TGC	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019652
83	NC_007912	GGC	2	6	3851	3856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90019652
84	NC_007912	CG	3	6	4022	4027	0 %	0 %	50 %	50 %	90019652
85	NC_007912	CAG	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019652
86	NC_007912	GAT	2	6	4212	4217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019652
87	NC_007912	TGGC	2	8	4259	4266	0 %	25 %	50 %	25 %	90019652
88	NC_007912	AAT	2	6	4396	4401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019652
89	NC_007912	ATA	2	6	4432	4437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019653
90	NC_007912	GAA	2	6	4443	4448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
91	NC_007912	CTC	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	90019653
92	NC_007912	GTAT	2	8	4516	4523	25 %	50 %	25 %	0 %	90019653
93	NC_007912	CGA	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
94	NC_007912	CAC	2	6	4554	4559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019653
95	NC_007912	CGA	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
96	NC_007912	TGGC	2	8	4600	4607	0 %	25 %	50 %	25 %	90019653
97	NC_007912	GT	3	6	4702	4707	0 %	50 %	50 %	0 %	90019653
98	NC_007912	GCA	2	6	4710	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
99	NC_007912	TGA	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019653
100	NC_007912	CGG	2	6	4778	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90019653
101	NC_007912	GTT	2	6	4806	4811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019653
102	NC_007912	TCG	2	6	4844	4849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019653
103	NC_007912	TGG	2	6	4850	4855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019653
104	NC_007912	CAC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019653
105	NC_007912	GA	3	6	4915	4920	50 %	0 %	50 %	0 %	90019653
106	NC_007912	TGA	2	6	5057	5062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019653
107	NC_007912	AGA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
108	NC_007912	TTG	2	6	5113	5118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019653
109	NC_007912	GAA	2	6	5178	5183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
110	NC_007912	GGTGTA	2	12	5187	5198	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	90019653
111	NC_007912	CAA	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90019653
112	NC_007912	TGG	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019653
113	NC_007912	TGC	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019653
114	NC_007912	AAAG	2	8	5351	5358	75 %	0 %	25 %	0 %	90019653
115	NC_007912	GAC	2	6	5379	5384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
116	NC_007912	CAG	2	6	5482	5487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
117	NC_007912	AAG	2	6	5539	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
118	NC_007912	ATG	2	6	5565	5570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019653
119	NC_007912	GC	3	6	5604	5609	0 %	0 %	50 %	50 %	90019653
120	NC_007912	CGT	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	90019653
121	NC_007912	CA	3	6	5759	5764	50 %	0 %	0 %	50 %	90019653
122	NC_007912	TTA	2	6	5851	5856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019653
123	NC_007912	ATT	2	6	5919	5924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	90019653
124	NC_007912	TTAC	2	8	5970	5977	25 %	50 %	0 %	25 %	90019653
125	NC_007912	CTT	3	9	5978	5986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019653
126	NC_007912	ACC	2	6	6035	6040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019653
127	NC_007912	GCAA	2	8	6061	6068	50 %	0 %	25 %	25 %	90019653
128	NC_007912	GAT	2	6	6087	6092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019653
129	NC_007912	TAAC	2	8	6109	6116	50 %	25 %	0 %	25 %	90019653
130	NC_007912	TGA	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019653
131	NC_007912	AGA	2	6	6260	6265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
132	NC_007912	AGC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
133	NC_007912	GTG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019653
134	NC_007912	AC	3	6	6378	6383	50 %	0 %	0 %	50 %	90019653
135	NC_007912	GTT	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019653
136	NC_007912	TTG	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	90019653
137	NC_007912	GCAT	2	8	6514	6521	25 %	25 %	25 %	25 %	90019653
138	NC_007912	GCAA	2	8	6583	6590	50 %	0 %	25 %	25 %	90019653
139	NC_007912	AAG	2	6	6607	6612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019653
140	NC_007912	A	6	6	6639	6644	100 %	0 %	0 %	0 %	90019653
141	NC_007912	AGC	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019653
142	NC_007912	ACC	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019653
143	NC_007912	CGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	90019653
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147	NC_007912	A	6	6	6939	6944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007912	TAA	2	6	6980	6985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007912	GA	3	6	7027	7032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007912	TAA	2	6	7039	7044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019654
151	NC_007912	TAG	2	6	7053	7058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019654
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153	NC_007912	ATTTTG	2	12	7224	7235	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	90019654
154	NC_007912	GAT	2	6	7256	7261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019654
155	NC_007912	AAC	2	6	7318	7323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	90019654
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158	NC_007912	ACT	2	6	7448	7453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90019654
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160	NC_007912	AAT	2	6	7585	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007912	TGCAG	2	10	7603	7612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_007912	TGC	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_007912	TAA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007912	TAA	2	6	7683	7688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007912	AGG	2	6	7713	7718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007912	CT	3	6	7801	7806	0 %	50 %	0 %	50 %	90019655
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169	NC_007912	TGGT	2	8	7948	7955	0 %	50 %	50 %	0 %	90019655
170	NC_007912	GC	4	8	8014	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	90019655
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172	NC_007912	GCAG	2	8	8095	8102	25 %	0 %	50 %	25 %	90019655
173	NC_007912	AGA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019655
174	NC_007912	GTG	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019655
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176	NC_007912	A	6	6	8351	8356	100 %	0 %	0 %	0 %	90019655
177	NC_007912	A	6	6	8369	8374	100 %	0 %	0 %	0 %	90019655
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219	NC_007912	TGA	2	6	10320	10325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019657
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228	NC_007912	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_007912	T	7	7	10742	10748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_007912	T	6	6	12204	12209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_007912	ATTA	2	8	12252	12259	50 %	50 %	0 %	0 %	90019659
259	NC_007912	ATC	2	6	12268	12273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	90019659
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262	NC_007912	AGCC	2	8	12392	12399	25 %	0 %	25 %	50 %	90019659
263	NC_007912	GC	3	6	12482	12487	0 %	0 %	50 %	50 %	90019659
264	NC_007912	CGG	2	6	12534	12539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90019659
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266	NC_007912	AAG	2	6	12629	12634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	90019659
267	NC_007912	TGG	2	6	12701	12706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019660
268	NC_007912	T	6	6	12810	12815	0 %	100 %	0 %	0 %	90019660
269	NC_007912	CAC	2	6	12890	12895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	90019660
270	NC_007912	GC	3	6	12897	12902	0 %	0 %	50 %	50 %	90019660
271	NC_007912	AAT	2	6	12948	12953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	90019660
272	NC_007912	TCT	2	6	12967	12972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019660
273	NC_007912	CTTG	2	8	12998	13005	0 %	50 %	25 %	25 %	90019660
274	NC_007912	CG	3	6	13013	13018	0 %	0 %	50 %	50 %	90019660
275	NC_007912	TCTA	2	8	13026	13033	25 %	50 %	0 %	25 %	90019660
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277	NC_007912	T	6	6	13093	13098	0 %	100 %	0 %	0 %	90019660
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279	NC_007912	A	6	6	13134	13139	100 %	0 %	0 %	0 %	90019660
280	NC_007912	T	6	6	13192	13197	0 %	100 %	0 %	0 %	90019660
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284	NC_007912	AAT	2	6	13395	13400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_007912	TGC	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_007912	ATCA	2	8	13455	13462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
287	NC_007912	AGC	2	6	13572	13577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	90019661
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386	NC_007912	TGT	2	6	18557	18562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_007912	GGT	2	6	18684	18689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
389	NC_007912	TAT	2	6	18735	18740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_007912	CG	3	6	18741	18746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
391	NC_007912	TTA	2	6	18747	18752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_007912	AGT	2	6	18758	18763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
393	NC_007912	TTA	2	6	18791	18796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_007912	AT	4	8	18803	18810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_007912	TA	3	6	18875	18880	50 %	50 %	0 %	0 %	90019665
396	NC_007912	T	6	6	18921	18926	0 %	100 %	0 %	0 %	90019665
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398	NC_007912	TGG	2	6	18985	18990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	90019665
399	NC_007912	TGA	3	9	19039	19047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	90019665
400	NC_007912	TGAAGA	2	12	19085	19096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	90019665
401	NC_007912	AAGCT	2	10	19098	19107	40 %	20 %	20 %	20 %	90019665
402	NC_007912	TTC	2	6	19124	19129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	90019665
403	NC_007912	GGC	2	6	19199	19204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90019665
404	NC_007912	A	6	6	19302	19307	100 %	0 %	0 %	0 %	90019665
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406	NC_007912	GGC	2	6	19418	19423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	90019666
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