MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007775	TCA	2	6	182105	182110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604908
4002	NC_007775	CGT	2	6	182115	182120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604908
4003	NC_007775	GGC	2	6	182167	182172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604908
4004	NC_007775	GCG	2	6	182238	182243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604908
4005	NC_007775	CGG	3	9	182448	182456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604908
4006	NC_007775	CTG	2	6	182479	182484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604908
4007	NC_007775	ACC	2	6	182492	182497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604908
4008	NC_007775	CCA	2	6	182505	182510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604908
4009	NC_007775	GCA	2	6	182523	182528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604908
4010	NC_007775	CTG	2	6	182533	182538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604908
4011	NC_007775	G	6	6	182602	182607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_007775	GTCT	2	8	182741	182748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_007775	C	6	6	182793	182798	0 %	0 %	0 %	100 %	86604909
4014	NC_007775	GAT	2	6	182815	182820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604909
4015	NC_007775	TTGC	2	8	182847	182854	0 %	50 %	25 %	25 %	86604909
4016	NC_007775	GCG	2	6	182947	182952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604909
4017	NC_007775	CGGT	2	8	182971	182978	0 %	25 %	50 %	25 %	86604909
4018	NC_007775	GGC	2	6	183090	183095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604909
4019	NC_007775	T	6	6	183136	183141	0 %	100 %	0 %	0 %	86604909
4020	NC_007775	G	6	6	183145	183150	0 %	0 %	100 %	0 %	86604909
4021	NC_007775	CTAC	2	8	183174	183181	25 %	25 %	0 %	50 %	86604909
4022	NC_007775	ACC	2	6	183245	183250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604909
4023	NC_007775	GGT	2	6	183309	183314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604909
4024	NC_007775	CTG	2	6	183381	183386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604909
4025	NC_007775	TG	3	6	183385	183390	0 %	50 %	50 %	0 %	86604909
4026	NC_007775	TGGA	2	8	183392	183399	25 %	25 %	50 %	0 %	86604909
4027	NC_007775	GGC	2	6	183441	183446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604909
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4029	NC_007775	GCC	2	6	183513	183518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604909
4030	NC_007775	GTG	2	6	183574	183579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604909
4031	NC_007775	CCAG	2	8	183605	183612	25 %	0 %	25 %	50 %	86604909
4032	NC_007775	GGGA	2	8	183685	183692	25 %	0 %	75 %	0 %	86604909
4033	NC_007775	GCT	2	6	183699	183704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604909
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4040	NC_007775	GCT	2	6	183954	183959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604909
4041	NC_007775	CGG	2	6	183998	184003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604909
4042	NC_007775	GGT	2	6	184029	184034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604909
4043	NC_007775	GGA	2	6	184117	184122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_007775	C	7	7	184146	184152	0 %	0 %	0 %	100 %	86604910
4045	NC_007775	CTGC	2	8	184160	184167	0 %	25 %	25 %	50 %	86604910
4046	NC_007775	TGG	2	6	184178	184183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604910
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4051	NC_007775	GCT	2	6	184423	184428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604910
4052	NC_007775	TGG	2	6	184505	184510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604910
4053	NC_007775	AGC	2	6	184566	184571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604910
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4055	NC_007775	ACC	2	6	184655	184660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604910
4056	NC_007775	TGG	2	6	184686	184691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604910
4057	NC_007775	GCC	2	6	184741	184746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604910
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4059	NC_007775	GGT	2	6	184762	184767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604910
4060	NC_007775	CCCG	2	8	184868	184875	0 %	0 %	25 %	75 %	86604910
4061	NC_007775	CAC	2	6	184885	184890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604910
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4063	NC_007775	ACT	2	6	184953	184958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604910
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4065	NC_007775	CCG	2	6	185041	185046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604910
4066	NC_007775	CAG	2	6	185092	185097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604910
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4072	NC_007775	ATG	2	6	185348	185353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604910
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4080	NC_007775	ACT	2	6	185580	185585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86604910
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4083	NC_007775	T	6	6	185702	185707	0 %	100 %	0 %	0 %	86604911
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4089	NC_007775	GCCAG	2	10	185849	185858	20 %	0 %	40 %	40 %	86604911
4090	NC_007775	CTCCAC	2	12	185872	185883	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	86604911
4091	NC_007775	GCG	2	6	185907	185912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604911
4092	NC_007775	ACC	2	6	185946	185951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604911
4093	NC_007775	CGG	2	6	186071	186076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604911
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4095	NC_007775	CAG	2	6	186169	186174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604911
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4097	NC_007775	GCG	2	6	186203	186208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604911
4098	NC_007775	AAG	2	6	186228	186233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604911
4099	NC_007775	GCTG	2	8	186237	186244	0 %	25 %	50 %	25 %	86604911
4100	NC_007775	GTA	2	6	186430	186435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604911
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4102	NC_007775	GTC	2	6	186481	186486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604911
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4104	NC_007775	G	6	6	186525	186530	0 %	0 %	100 %	0 %	86604911
4105	NC_007775	TGA	2	6	186531	186536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604911
4106	NC_007775	CGT	2	6	186543	186548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604911
4107	NC_007775	GC	3	6	186589	186594	0 %	0 %	50 %	50 %	86604911
4108	NC_007775	A	6	6	186629	186634	100 %	0 %	0 %	0 %	86604911
4109	NC_007775	CTC	2	6	186697	186702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604911
4110	NC_007775	GGA	2	6	186748	186753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604911
4111	NC_007775	GTC	2	6	186757	186762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604911
4112	NC_007775	GGT	2	6	186849	186854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604911
4113	NC_007775	GAC	2	6	186871	186876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604911
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4120	NC_007775	CGG	2	6	187288	187293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604911
4121	NC_007775	CTC	2	6	187327	187332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604911
4122	NC_007775	TCCG	2	8	187449	187456	0 %	25 %	25 %	50 %	86604911
4123	NC_007775	GGA	2	6	187460	187465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_007775	CTA	2	6	187505	187510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4126	NC_007775	CG	3	6	187655	187660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_007775	TAAC	2	8	187665	187672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_007775	GGA	2	6	187675	187680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4498	NC_007775	CTC	2	6	203564	203569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604924
4499	NC_007775	GA	3	6	203643	203648	50 %	0 %	50 %	0 %	86604924
4500	NC_007775	CGC	2	6	203677	203682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604924

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