MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_007775	TGG	3	9	749080	749088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605451
16003	NC_007775	GCG	2	6	749121	749126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_007775	CTG	2	6	749139	749144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16005	NC_007775	TCT	2	6	749153	749158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_007775	CTG	2	6	749159	749164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_007775	CCA	2	6	749215	749220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605452
16008	NC_007775	TCG	2	6	749236	749241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605452
16009	NC_007775	TGG	3	9	749290	749298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605452
16010	NC_007775	CAG	2	6	749365	749370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605452
16011	NC_007775	CT	3	6	749457	749462	0 %	50 %	0 %	50 %	86605452
16012	NC_007775	CCCCAC	2	12	749498	749509	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	86605452
16013	NC_007775	GCG	2	6	749535	749540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605452
16014	NC_007775	CCCCAC	2	12	749543	749554	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	86605452
16015	NC_007775	A	6	6	749613	749618	100 %	0 %	0 %	0 %	86605452
16016	NC_007775	TGG	2	6	749669	749674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605452
16017	NC_007775	GCC	2	6	749715	749720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605452
16018	NC_007775	C	8	8	749739	749746	0 %	0 %	0 %	100 %	86605452
16019	NC_007775	GGC	2	6	749798	749803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605452
16020	NC_007775	GGT	2	6	749804	749809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605452
16021	NC_007775	CAC	2	6	749864	749869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605452
16022	NC_007775	CTC	2	6	749970	749975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605452
16023	NC_007775	CGG	2	6	750050	750055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605452
16024	NC_007775	TGG	2	6	750127	750132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605452
16025	NC_007775	GCG	2	6	750140	750145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605452
16026	NC_007775	GGA	2	6	750161	750166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605452
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16028	NC_007775	CCAA	2	8	750241	750248	50 %	0 %	0 %	50 %	86605452
16029	NC_007775	GCT	2	6	750270	750275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605452
16030	NC_007775	GTG	2	6	750285	750290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605452
16031	NC_007775	GCCATC	2	12	750306	750317	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86605452
16032	NC_007775	ACC	2	6	750349	750354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605452
16033	NC_007775	CTT	2	6	750383	750388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605452
16034	NC_007775	GTT	2	6	750404	750409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605452
16035	NC_007775	TGT	2	6	750502	750507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_007775	CAGC	2	8	750675	750682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_007775	GC	3	6	750687	750692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_007775	GCT	2	6	750778	750783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_007775	AGG	2	6	750865	750870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_007775	ATCT	2	8	751009	751016	25 %	50 %	0 %	25 %	86605453
16041	NC_007775	GTTC	2	8	751022	751029	0 %	50 %	25 %	25 %	86605453
16042	NC_007775	GGA	2	6	751070	751075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605453
16043	NC_007775	GTC	2	6	751121	751126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605453
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16047	NC_007775	TAGC	2	8	751365	751372	25 %	25 %	25 %	25 %	86605453
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16051	NC_007775	TGG	2	6	751624	751629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605453
16052	NC_007775	GTA	2	6	751653	751658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605453
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16054	NC_007775	AAC	2	6	751748	751753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605453
16055	NC_007775	CTG	2	6	751776	751781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605453
16056	NC_007775	CTG	2	6	751785	751790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605453
16057	NC_007775	AGC	2	6	751810	751815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605453
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16059	NC_007775	AGT	2	6	752026	752031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605453
16060	NC_007775	TGC	2	6	752032	752037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605453
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16065	NC_007775	GCCT	2	8	752373	752380	0 %	25 %	25 %	50 %	86605453
16066	NC_007775	CAGGAG	2	12	752403	752414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	86605453
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16073	NC_007775	GCA	2	6	752802	752807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16075	NC_007775	AG	3	6	752827	752832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_007775	GAA	2	6	752864	752869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16079	NC_007775	TGCCTA	2	12	752897	752908	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16081	NC_007775	GCA	2	6	752925	752930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605454
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16083	NC_007775	GATC	2	8	753034	753041	25 %	25 %	25 %	25 %	86605454
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16101	NC_007775	GA	3	6	753886	753891	50 %	0 %	50 %	0 %	86605455
16102	NC_007775	CAG	2	6	753895	753900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605455
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16119	NC_007775	A	6	6	754731	754736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_007775	GGC	3	9	754798	754806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605456
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