MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_007775	CGG	2	6	699648	699653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_007775	G	7	7	699704	699710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_007775	CG	3	6	699902	699907	0 %	0 %	50 %	50 %	86605404
15004	NC_007775	GAG	2	6	699978	699983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605404
15005	NC_007775	CAG	2	6	700017	700022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15006	NC_007775	CTG	2	6	700032	700037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15007	NC_007775	TGG	2	6	700075	700080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605404
15008	NC_007775	CGG	2	6	700147	700152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605404
15009	NC_007775	CT	3	6	700204	700209	0 %	50 %	0 %	50 %	86605404
15010	NC_007775	CTG	2	6	700239	700244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15011	NC_007775	GCC	2	6	700306	700311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605404
15012	NC_007775	CTGGG	2	10	700314	700323	0 %	20 %	60 %	20 %	86605404
15013	NC_007775	GCC	2	6	700350	700355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605404
15014	NC_007775	GCA	2	6	700553	700558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15015	NC_007775	TGG	2	6	700615	700620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605404
15016	NC_007775	CTG	2	6	700659	700664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15017	NC_007775	GCT	3	9	700763	700771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15018	NC_007775	CTG	4	12	700782	700793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605404
15019	NC_007775	TGG	2	6	700852	700857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605404
15020	NC_007775	CT	3	6	700994	700999	0 %	50 %	0 %	50 %	86605404
15021	NC_007775	AAGG	2	8	701160	701167	50 %	0 %	50 %	0 %	86605405
15022	NC_007775	CAG	2	6	701210	701215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15023	NC_007775	TGG	2	6	701278	701283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605405
15024	NC_007775	TGT	2	6	701386	701391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605405
15025	NC_007775	CCA	2	6	701416	701421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605405
15026	NC_007775	GCC	2	6	701491	701496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605405
15027	NC_007775	TCG	2	6	701547	701552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15028	NC_007775	CAG	2	6	701588	701593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15029	NC_007775	TCCC	2	8	701689	701696	0 %	25 %	0 %	75 %	86605405
15030	NC_007775	CAG	2	6	701699	701704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15031	NC_007775	T	6	6	701716	701721	0 %	100 %	0 %	0 %	86605405
15032	NC_007775	CTC	2	6	701756	701761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605405
15033	NC_007775	GCT	2	6	701782	701787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15034	NC_007775	CTG	2	6	701795	701800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605405
15035	NC_007775	CAA	2	6	701901	701906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_007775	ATG	2	6	701959	701964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_007775	TCC	2	6	702041	702046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15038	NC_007775	CAC	2	6	702184	702189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605406
15039	NC_007775	TCA	2	6	702237	702242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605406
15040	NC_007775	CCA	2	6	702267	702272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605406
15041	NC_007775	CAGC	2	8	702291	702298	25 %	0 %	25 %	50 %	86605406
15042	NC_007775	CAA	2	6	702309	702314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605406
15043	NC_007775	GTT	2	6	702325	702330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605406
15044	NC_007775	AGGT	2	8	702332	702339	25 %	25 %	50 %	0 %	86605406
15045	NC_007775	GCC	2	6	702349	702354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605406
15046	NC_007775	TTC	2	6	702442	702447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605406
15047	NC_007775	ATC	2	6	702521	702526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605406
15048	NC_007775	GAAA	2	8	702537	702544	75 %	0 %	25 %	0 %	86605406
15049	NC_007775	GGAAGA	2	12	702600	702611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_007775	CAGCG	2	10	702661	702670	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15051	NC_007775	CAC	2	6	702772	702777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15052	NC_007775	GCG	2	6	702808	702813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_007775	CCG	2	6	702948	702953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15054	NC_007775	GGA	2	6	703033	703038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_007775	GA	3	6	703037	703042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_007775	GCC	2	6	703137	703142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605407
15057	NC_007775	AGG	2	6	703225	703230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605407
15058	NC_007775	CCA	2	6	703236	703241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605407
15059	NC_007775	TAGCT	2	10	703315	703324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15060	NC_007775	GAA	2	6	703415	703420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_007775	TTG	2	6	703421	703426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_007775	TGC	2	6	703529	703534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15063	NC_007775	TACCA	2	10	703554	703563	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15064	NC_007775	T	6	6	703581	703586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_007775	TCT	2	6	703750	703755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605408
15066	NC_007775	CTT	2	6	703772	703777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605408
15067	NC_007775	C	8	8	703811	703818	0 %	0 %	0 %	100 %	86605408
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15071	NC_007775	GAGTT	2	10	703928	703937	20 %	40 %	40 %	0 %	86605408
15072	NC_007775	AGC	2	6	703950	703955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605408
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15081	NC_007775	CA	3	6	704275	704280	50 %	0 %	0 %	50 %	86605409
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15088	NC_007775	GGT	2	6	704462	704467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605409
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15090	NC_007775	CTG	2	6	704661	704666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605409
15091	NC_007775	GTG	2	6	704721	704726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605409
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15093	NC_007775	C	6	6	704817	704822	0 %	0 %	0 %	100 %	86605409
15094	NC_007775	TGC	2	6	704900	704905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605409
15095	NC_007775	CTG	2	6	704932	704937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605409
15096	NC_007775	TGTT	2	8	704972	704979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_007775	GTC	2	6	705042	705047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_007775	TAC	2	6	705049	705054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_007775	TGCTT	2	10	705063	705072	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15100	NC_007775	GTA	2	6	705119	705124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_007775	ATT	2	6	705147	705152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_007775	TTA	2	6	705169	705174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_007775	AACC	2	8	705200	705207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15104	NC_007775	T	6	6	705224	705229	0 %	100 %	0 %	0 %	86605410
15105	NC_007775	CAAG	2	8	705341	705348	50 %	0 %	25 %	25 %	86605410
15106	NC_007775	GCTGGC	2	12	705377	705388	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_007775	CA	3	6	705407	705412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15108	NC_007775	GTAGG	2	10	705434	705443	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_007775	TTC	2	6	705487	705492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605411
15110	NC_007775	GGA	2	6	705586	705591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605411
15111	NC_007775	CAT	2	6	705634	705639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605411
15112	NC_007775	GA	3	6	705653	705658	50 %	0 %	50 %	0 %	86605411
15113	NC_007775	TTC	2	6	705668	705673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605411
15114	NC_007775	A	6	6	705690	705695	100 %	0 %	0 %	0 %	86605411
15115	NC_007775	GGT	2	6	705700	705705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605411
15116	NC_007775	CCCA	2	8	705884	705891	25 %	0 %	0 %	75 %	86605411
15117	NC_007775	CAG	2	6	705894	705899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605411
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15119	NC_007775	ATG	2	6	705924	705929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605411
15120	NC_007775	TGC	2	6	706032	706037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605411
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15122	NC_007775	TCA	2	6	706215	706220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605411
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15124	NC_007775	TTTAC	2	10	706332	706341	20 %	60 %	0 %	20 %	86605411
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15495	NC_007775	CAG	3	9	723778	723786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15496	NC_007775	TGG	2	6	723799	723804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15497	NC_007775	GCC	2	6	723916	723921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15498	NC_007775	GGGC	2	8	724025	724032	0 %	0 %	75 %	25 %	86605432
15499	NC_007775	GGT	2	6	724137	724142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605432
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