MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007775	GGC	2	6	650933	650938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605353
14002	NC_007775	GACC	2	8	650951	650958	25 %	0 %	25 %	50 %	86605353
14003	NC_007775	TCA	2	6	650962	650967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605353
14004	NC_007775	AGC	2	6	651039	651044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605353
14005	NC_007775	CCA	2	6	651055	651060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605353
14006	NC_007775	CAA	2	6	651062	651067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605353
14007	NC_007775	AGCC	2	8	651068	651075	25 %	0 %	25 %	50 %	86605353
14008	NC_007775	GCT	2	6	651127	651132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605353
14009	NC_007775	ACC	2	6	651210	651215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605353
14010	NC_007775	CAG	3	9	651245	651253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605353
14011	NC_007775	AGCC	2	8	651343	651350	25 %	0 %	25 %	50 %	86605354
14012	NC_007775	CAG	2	6	651351	651356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14013	NC_007775	CAC	2	6	651366	651371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14014	NC_007775	GGT	2	6	651405	651410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605354
14015	NC_007775	CCT	2	6	651427	651432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605354
14016	NC_007775	CAC	2	6	651459	651464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14017	NC_007775	CCA	2	6	651470	651475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14018	NC_007775	ATG	2	6	651508	651513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605354
14019	NC_007775	CAC	2	6	651516	651521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14020	NC_007775	CAG	2	6	651570	651575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14021	NC_007775	GCC	3	9	651611	651619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605354
14022	NC_007775	GCC	2	6	651721	651726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605354
14023	NC_007775	ATC	2	6	651730	651735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605354
14024	NC_007775	CAT	2	6	651756	651761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605354
14025	NC_007775	CAT	2	6	651777	651782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605354
14026	NC_007775	GCTC	2	8	651806	651813	0 %	25 %	25 %	50 %	86605354
14027	NC_007775	CTG	2	6	651816	651821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14028	NC_007775	CAC	2	6	651891	651896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14029	NC_007775	GCC	2	6	651898	651903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605354
14030	NC_007775	CTG	2	6	651930	651935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14031	NC_007775	GGC	2	6	651970	651975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605354
14032	NC_007775	CCA	2	6	651980	651985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14033	NC_007775	GCC	2	6	652025	652030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605354
14034	NC_007775	C	6	6	652042	652047	0 %	0 %	0 %	100 %	86605354
14035	NC_007775	AGC	2	6	652132	652137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14036	NC_007775	GT	3	6	652156	652161	0 %	50 %	50 %	0 %	86605354
14037	NC_007775	GGGCCA	2	12	652238	652249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86605354
14038	NC_007775	C	6	6	652258	652263	0 %	0 %	0 %	100 %	86605354
14039	NC_007775	C	6	6	652275	652280	0 %	0 %	0 %	100 %	86605354
14040	NC_007775	CAC	3	9	652362	652370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14041	NC_007775	GGCC	2	8	652460	652467	0 %	0 %	50 %	50 %	86605354
14042	NC_007775	CCA	2	6	652481	652486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14043	NC_007775	CCTG	2	8	652519	652526	0 %	25 %	25 %	50 %	86605354
14044	NC_007775	ACC	2	6	652657	652662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14045	NC_007775	AGGT	2	8	652693	652700	25 %	25 %	50 %	0 %	86605354
14046	NC_007775	CAGAGC	2	12	652752	652763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14047	NC_007775	C	7	7	652770	652776	0 %	0 %	0 %	100 %	86605354
14048	NC_007775	CAG	2	6	652788	652793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
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14052	NC_007775	CCA	2	6	652988	652993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14053	NC_007775	CCA	2	6	653018	653023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605354
14054	NC_007775	CAG	2	6	653028	653033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605354
14055	NC_007775	CCG	2	6	653048	653053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605354
14056	NC_007775	GCCAC	2	10	653105	653114	20 %	0 %	20 %	60 %	86605354
14057	NC_007775	TCC	2	6	653171	653176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_007775	A	6	6	653224	653229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_007775	CTAG	2	8	653300	653307	25 %	25 %	25 %	25 %	86605355
14060	NC_007775	ACAG	2	8	653335	653342	50 %	0 %	25 %	25 %	86605355
14061	NC_007775	TCG	2	6	653461	653466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605355
14062	NC_007775	CAG	2	6	653486	653491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_007775	TGG	2	6	653595	653600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605356
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14065	NC_007775	GA	3	6	653816	653821	50 %	0 %	50 %	0 %	86605357
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14068	NC_007775	GCC	2	6	653874	653879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605357
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14071	NC_007775	CGA	3	9	653960	653968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605357
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14073	NC_007775	GA	3	6	654105	654110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_007775	GAT	2	6	654119	654124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_007775	TGA	2	6	654195	654200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_007775	GGTG	2	8	654244	654251	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_007775	T	6	6	654316	654321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_007775	GGA	2	6	654353	654358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_007775	TGG	2	6	654453	654458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605358
14080	NC_007775	TCCTG	2	10	654514	654523	0 %	40 %	20 %	40 %	86605358
14081	NC_007775	GGT	2	6	654577	654582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605358
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14089	NC_007775	TGG	2	6	655119	655124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605358
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14094	NC_007775	CTT	2	6	655450	655455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605358
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14096	NC_007775	GC	3	6	655519	655524	0 %	0 %	50 %	50 %	86605358
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14099	NC_007775	GCT	2	6	655744	655749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605358
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14102	NC_007775	TGG	2	6	655836	655841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605358
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14106	NC_007775	GGC	2	6	655956	655961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_007775	T	6	6	656065	656070	0 %	100 %	0 %	0 %	86605359
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14109	NC_007775	GCT	2	6	656125	656130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14110	NC_007775	GGC	2	6	656165	656170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_007775	TTGTTT	2	12	656221	656232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_007775	C	6	6	656271	656276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14113	NC_007775	CTG	2	6	656321	656326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_007775	TGC	2	6	656467	656472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_007775	TGC	2	6	656520	656525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605360
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14119	NC_007775	GGCGCA	2	12	656632	656643	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	86605360
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14123	NC_007775	CATGC	2	10	656783	656792	20 %	20 %	20 %	40 %	86605360
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14240	NC_007775	GCA	2	6	662422	662427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605367
14241	NC_007775	GAC	2	6	662564	662569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605367
14242	NC_007775	TACCC	2	10	662586	662595	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14243	NC_007775	CAGA	2	8	662714	662721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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