MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_007775	CTG	2	6	553958	553963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605257
12003	NC_007775	T	7	7	553998	554004	0 %	100 %	0 %	0 %	86605258
12004	NC_007775	GAA	2	6	554161	554166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605258
12005	NC_007775	ACA	2	6	554253	554258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605259
12006	NC_007775	ATC	2	6	554273	554278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605259
12007	NC_007775	GTG	2	6	554282	554287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605259
12008	NC_007775	CGC	2	6	554302	554307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605259
12009	NC_007775	ACA	2	6	554331	554336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605259
12010	NC_007775	CCG	2	6	554340	554345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605259
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12012	NC_007775	TGG	2	6	554514	554519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605259
12013	NC_007775	TGG	2	6	554559	554564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605259
12014	NC_007775	GGC	2	6	554612	554617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605259
12015	NC_007775	GGC	2	6	554653	554658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605259
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12017	NC_007775	GGT	3	9	554758	554766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605259
12018	NC_007775	CGG	2	6	554853	554858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605259
12019	NC_007775	CGG	3	9	554934	554942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605259
12020	NC_007775	CGCTG	2	10	554943	554952	0 %	20 %	40 %	40 %	86605259
12021	NC_007775	GGT	2	6	554995	555000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605259
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12026	NC_007775	CCAG	2	8	555210	555217	25 %	0 %	25 %	50 %	86605259
12027	NC_007775	CCAT	2	8	555243	555250	25 %	25 %	0 %	50 %	86605259
12028	NC_007775	GGC	2	6	555325	555330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12029	NC_007775	TCAG	2	8	555380	555387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12030	NC_007775	A	6	6	555395	555400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12032	NC_007775	TAGG	2	8	555457	555464	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_007775	TGC	2	6	555486	555491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12034	NC_007775	CCTT	2	8	555527	555534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12035	NC_007775	CTAG	2	8	555538	555545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12036	NC_007775	TAA	2	6	555578	555583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12037	NC_007775	GAC	2	6	555597	555602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12042	NC_007775	GCT	2	6	555880	555885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605260
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12053	NC_007775	GCT	2	6	556429	556434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605260
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12071	NC_007775	ATT	2	6	557303	557308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12120	NC_007775	GCA	2	6	559812	559817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605263
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12243	NC_007775	CG	3	6	565153	565158	0 %	0 %	50 %	50 %	86605267
12244	NC_007775	CACAG	2	10	565194	565203	40 %	0 %	20 %	40 %	86605267
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12494	NC_007775	CCAA	2	8	577006	577013	50 %	0 %	0 %	50 %	86605279
12495	NC_007775	GCC	2	6	577071	577076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605279
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12497	NC_007775	GAG	2	6	577099	577104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605279
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12499	NC_007775	GCC	2	6	577143	577148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605279
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