MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007775	GGC	2	6	530444	530449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229
11502	NC_007775	GCT	2	6	530498	530503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11503	NC_007775	TTGG	2	8	530600	530607	0 %	50 %	50 %	0 %	86605229
11504	NC_007775	GAG	2	6	530615	530620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605229
11505	NC_007775	CTT	2	6	530629	530634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605229
11506	NC_007775	GCA	2	6	530659	530664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11507	NC_007775	GGA	2	6	530668	530673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605229
11508	NC_007775	CTG	2	6	530699	530704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11509	NC_007775	CGC	2	6	530733	530738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
11510	NC_007775	CAG	2	6	530954	530959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11511	NC_007775	TTG	2	6	530985	530990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
11512	NC_007775	GCC	2	6	531003	531008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
11513	NC_007775	GGCC	2	8	531061	531068	0 %	0 %	50 %	50 %	86605229
11514	NC_007775	CAC	2	6	531071	531076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11515	NC_007775	CTTGGA	2	12	531152	531163	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	86605229
11516	NC_007775	CAT	2	6	531245	531250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605229
11517	NC_007775	AGA	3	9	531268	531276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605229
11518	NC_007775	GTA	2	6	531311	531316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605229
11519	NC_007775	TCC	2	6	531327	531332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
11520	NC_007775	TCC	2	6	531336	531341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
11521	NC_007775	CCAGC	2	10	531344	531353	20 %	0 %	20 %	60 %	86605229
11522	NC_007775	CCA	2	6	531478	531483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11523	NC_007775	CAC	2	6	531552	531557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11524	NC_007775	CCAG	2	8	531592	531599	25 %	0 %	25 %	50 %	86605229
11525	NC_007775	CTC	2	6	531656	531661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
11526	NC_007775	AGC	2	6	531667	531672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11527	NC_007775	GCC	2	6	531675	531680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
11528	NC_007775	AGC	2	6	531714	531719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11529	NC_007775	CTC	2	6	531770	531775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
11530	NC_007775	CAG	2	6	531785	531790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11531	NC_007775	CAC	2	6	531812	531817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11532	NC_007775	TTG	2	6	531885	531890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
11533	NC_007775	TGG	2	6	531912	531917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605229
11534	NC_007775	TCG	2	6	531999	532004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11535	NC_007775	GAT	2	6	532007	532012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605229
11536	NC_007775	CGGG	2	8	532121	532128	0 %	0 %	75 %	25 %	86605229
11537	NC_007775	TGG	2	6	532129	532134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605229
11538	NC_007775	CCA	3	9	532135	532143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11539	NC_007775	CTGG	2	8	532148	532155	0 %	25 %	50 %	25 %	86605229
11540	NC_007775	CGG	2	6	532159	532164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229
11541	NC_007775	TGT	2	6	532207	532212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605229
11542	NC_007775	CTG	2	6	532231	532236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11543	NC_007775	TCG	2	6	532338	532343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11544	NC_007775	GTCCA	2	10	532362	532371	20 %	20 %	20 %	40 %	86605229
11545	NC_007775	GCC	2	6	532384	532389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
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11548	NC_007775	CAC	3	9	532586	532594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
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11550	NC_007775	GCA	2	6	532657	532662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11551	NC_007775	TCC	2	6	532716	532721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605229
11552	NC_007775	CTGG	2	8	532763	532770	0 %	25 %	50 %	25 %	86605229
11553	NC_007775	GCA	2	6	532791	532796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11554	NC_007775	CCAGG	2	10	532809	532818	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_007775	CGG	2	6	532863	532868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_007775	GA	3	6	532921	532926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_007775	GA	3	6	532934	532939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_007775	CTG	2	6	532964	532969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605230
11559	NC_007775	GGGT	2	8	532971	532978	0 %	25 %	75 %	0 %	86605230
11560	NC_007775	C	6	6	533004	533009	0 %	0 %	0 %	100 %	86605230
11561	NC_007775	G	6	6	533065	533070	0 %	0 %	100 %	0 %	86605230
11562	NC_007775	GGCT	2	8	533103	533110	0 %	25 %	50 %	25 %	86605230
11563	NC_007775	CAA	2	6	533306	533311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605230
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11565	NC_007775	CAA	2	6	533354	533359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605230
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11569	NC_007775	TGT	2	6	533553	533558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605231
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11572	NC_007775	GGA	2	6	533721	533726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605232
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11575	NC_007775	CAA	2	6	533827	533832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605232
11576	NC_007775	GCC	2	6	533907	533912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11577	NC_007775	GCT	2	6	533928	533933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_007775	GA	3	6	533954	533959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_007775	GCC	2	6	534071	534076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605233
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11584	NC_007775	GTA	2	6	534218	534223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605233
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11587	NC_007775	GGC	2	6	534341	534346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605233
11588	NC_007775	GCT	2	6	534354	534359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605233
11589	NC_007775	CAG	2	6	534377	534382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605233
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11593	NC_007775	CTG	2	6	534590	534595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605233
11594	NC_007775	ACA	2	6	534619	534624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605233
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11600	NC_007775	CCT	2	6	534829	534834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605234
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11603	NC_007775	GCT	2	6	534938	534943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605234
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11605	NC_007775	CT	3	6	535005	535010	0 %	50 %	0 %	50 %	86605235
11606	NC_007775	CCTA	2	8	535023	535030	25 %	25 %	0 %	50 %	86605235
11607	NC_007775	AAT	2	6	535068	535073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	86605235
11608	NC_007775	GAA	2	6	535164	535169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605236
11609	NC_007775	GCC	2	6	535201	535206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605236
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11611	NC_007775	GCA	2	6	535333	535338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605236
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11613	NC_007775	CGG	2	6	535436	535441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605236
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11615	NC_007775	AGC	2	6	535523	535528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605236
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11617	NC_007775	CAA	2	6	535592	535597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605236
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