MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007775	AG	3	6	505898	505903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_007775	GGTTTT	2	12	505962	505973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605206
11003	NC_007775	CCT	2	6	505979	505984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605206
11004	NC_007775	TGT	2	6	506019	506024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605206
11005	NC_007775	AGT	2	6	506070	506075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605206
11006	NC_007775	ACGTTC	2	12	506120	506131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	86605206
11007	NC_007775	CGG	2	6	506250	506255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605206
11008	NC_007775	TG	3	6	506287	506292	0 %	50 %	50 %	0 %	86605206
11009	NC_007775	A	6	6	506305	506310	100 %	0 %	0 %	0 %	86605206
11010	NC_007775	CGC	2	6	506359	506364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605206
11011	NC_007775	CCG	3	9	506458	506466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605206
11012	NC_007775	GCT	2	6	506525	506530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605207
11013	NC_007775	GAG	2	6	506541	506546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86605207
11014	NC_007775	GGT	2	6	506548	506553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605207
11015	NC_007775	GGCC	2	8	506628	506635	0 %	0 %	50 %	50 %	86605207
11016	NC_007775	CAA	2	6	506728	506733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86605207
11017	NC_007775	GCA	2	6	506754	506759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605207
11018	NC_007775	GCCC	2	8	506784	506791	0 %	0 %	25 %	75 %	86605207
11019	NC_007775	CCA	2	6	506853	506858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605207
11020	NC_007775	GCC	2	6	506873	506878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11021	NC_007775	GCC	2	6	507000	507005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11022	NC_007775	GCC	2	6	507037	507042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11023	NC_007775	AGC	2	6	507053	507058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605207
11024	NC_007775	ACC	2	6	507059	507064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605207
11025	NC_007775	C	6	6	507063	507068	0 %	0 %	0 %	100 %	86605207
11026	NC_007775	GCC	2	6	507089	507094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11027	NC_007775	CAC	2	6	507103	507108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605207
11028	NC_007775	GCC	2	6	507112	507117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11029	NC_007775	CCA	2	6	507135	507140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605207
11030	NC_007775	GCC	2	6	507144	507149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605207
11031	NC_007775	GCCGAT	2	12	507413	507424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	86605207
11032	NC_007775	AGC	2	6	507517	507522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_007775	GCA	2	6	507547	507552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605208
11034	NC_007775	TCG	2	6	507577	507582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605208
11035	NC_007775	C	6	6	507675	507680	0 %	0 %	0 %	100 %	86605208
11036	NC_007775	TGG	2	6	507712	507717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605208
11037	NC_007775	GA	3	6	507721	507726	50 %	0 %	50 %	0 %	86605208
11038	NC_007775	TCA	2	6	507784	507789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86605208
11039	NC_007775	CTG	2	6	507825	507830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605208
11040	NC_007775	GTG	2	6	507864	507869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605208
11041	NC_007775	CGG	2	6	508001	508006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605208
11042	NC_007775	GCC	2	6	508007	508012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605208
11043	NC_007775	ACCT	2	8	508143	508150	25 %	25 %	0 %	50 %	86605208
11044	NC_007775	CAG	2	6	508181	508186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605209
11045	NC_007775	CGC	2	6	508187	508192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605209
11046	NC_007775	GGC	2	6	508205	508210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605209
11047	NC_007775	CCA	2	6	508225	508230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605209
11048	NC_007775	TCC	2	6	508306	508311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605209
11049	NC_007775	GCC	2	6	508325	508330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605209
11050	NC_007775	CCG	2	6	508414	508419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605209
11051	NC_007775	CCT	2	6	508428	508433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86605209
11052	NC_007775	AGC	2	6	508467	508472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605209
11053	NC_007775	GAA	2	6	508541	508546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605209
11054	NC_007775	TTG	2	6	508569	508574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605209
11055	NC_007775	C	6	6	508575	508580	0 %	0 %	0 %	100 %	86605209
11056	NC_007775	CGC	2	6	508597	508602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605209
11057	NC_007775	TGC	2	6	508608	508613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605209
11058	NC_007775	GCA	2	6	508643	508648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605209
11059	NC_007775	CT	3	6	508673	508678	0 %	50 %	0 %	50 %	86605209
11060	NC_007775	ACCT	2	8	508682	508689	25 %	25 %	0 %	50 %	86605209
11061	NC_007775	G	6	6	508708	508713	0 %	0 %	100 %	0 %	86605209
11062	NC_007775	ATCC	2	8	508714	508721	25 %	25 %	0 %	50 %	86605209
11063	NC_007775	CTG	2	6	508737	508742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605209
11064	NC_007775	GAA	2	6	508785	508790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86605209
11065	NC_007775	A	7	7	508789	508795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_007775	GAG	2	6	508796	508801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_007775	CTC	2	6	508808	508813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_007775	GCCC	2	8	508842	508849	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11069	NC_007775	AGG	2	6	508865	508870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_007775	AG	3	6	508877	508882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_007775	CAACC	2	10	508927	508936	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11072	NC_007775	AAGCC	2	10	508952	508961	40 %	0 %	20 %	40 %	86605210
11073	NC_007775	TGC	2	6	508964	508969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605210
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11080	NC_007775	A	7	7	509228	509234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_007775	GCA	2	6	509253	509258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_007775	ACC	2	6	509302	509307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_007775	AGGA	2	8	509407	509414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_007775	CGCT	2	8	509440	509447	0 %	25 %	25 %	50 %	86605211
11085	NC_007775	TCCT	2	8	509604	509611	0 %	50 %	0 %	50 %	86605211
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11092	NC_007775	GCT	2	6	509887	509892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605212
11093	NC_007775	GGT	2	6	509990	509995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605212
11094	NC_007775	GAAA	2	8	510022	510029	75 %	0 %	25 %	0 %	86605212
11095	NC_007775	TGG	2	6	510046	510051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605212
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11103	NC_007775	CGG	2	6	510461	510466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605213
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11105	NC_007775	CTGG	2	8	510514	510521	0 %	25 %	50 %	25 %	86605213
11106	NC_007775	GAT	2	6	510523	510528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605213
11107	NC_007775	GCC	2	6	510566	510571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605213
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11110	NC_007775	C	6	6	510859	510864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11111	NC_007775	GAC	2	6	510891	510896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_007775	TCC	2	6	510908	510913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11113	NC_007775	CAG	2	6	510953	510958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11116	NC_007775	GAC	2	6	511224	511229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605214
11117	NC_007775	TTG	2	6	511238	511243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86605214
11118	NC_007775	GCT	2	6	511361	511366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605214
11119	NC_007775	GAT	2	6	511416	511421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86605214
11120	NC_007775	GGC	2	6	511423	511428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605214
11121	NC_007775	CAG	2	6	511444	511449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86605214
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11495	NC_007775	CTT	2	6	530206	530211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86605229
11496	NC_007775	CCA	2	6	530263	530268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86605229
11497	NC_007775	GCC	2	6	530313	530318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86605229
11498	NC_007775	GGT	2	6	530399	530404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86605229
11499	NC_007775	GCT	2	6	530413	530418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86605229
11500	NC_007775	CGG	2	6	530428	530433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86605229

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