MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. JA-3-3Ab chromosome

Total Repeats: 63161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007775	GGT	2	6	226964	226969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604947
5002	NC_007775	CGG	2	6	227023	227028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604947
5003	NC_007775	TGG	2	6	227032	227037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604947
5004	NC_007775	CCA	2	6	227041	227046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604947
5005	NC_007775	GAC	2	6	227120	227125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604947
5006	NC_007775	TGG	2	6	227181	227186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604947
5007	NC_007775	GTA	2	6	227195	227200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604947
5008	NC_007775	GCT	2	6	227292	227297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604947
5009	NC_007775	TCC	2	6	227370	227375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604947
5010	NC_007775	GGT	2	6	227396	227401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604947
5011	NC_007775	CGG	2	6	227419	227424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604947
5012	NC_007775	CGC	2	6	227449	227454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604947
5013	NC_007775	GAG	2	6	227514	227519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_007775	AGGGG	2	10	227553	227562	20 %	0 %	80 %	0 %	86604948
5015	NC_007775	CGT	2	6	227766	227771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5016	NC_007775	CCA	3	9	227871	227879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604948
5017	NC_007775	CTG	2	6	227889	227894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5018	NC_007775	C	7	7	227895	227901	0 %	0 %	0 %	100 %	86604948
5019	NC_007775	GTG	2	6	227912	227917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604948
5020	NC_007775	C	8	8	227934	227941	0 %	0 %	0 %	100 %	86604948
5021	NC_007775	GCC	2	6	228029	228034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5022	NC_007775	AGA	2	6	228189	228194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604948
5023	NC_007775	CAG	2	6	228292	228297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5024	NC_007775	TGG	2	6	228312	228317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604948
5025	NC_007775	GGA	2	6	228322	228327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604948
5026	NC_007775	GCC	3	9	228362	228370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5027	NC_007775	CCA	2	6	228423	228428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604948
5028	NC_007775	GCC	2	6	228443	228448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5029	NC_007775	GCTC	2	8	228449	228456	0 %	25 %	25 %	50 %	86604948
5030	NC_007775	CGT	2	6	228468	228473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5031	NC_007775	CAC	2	6	228481	228486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604948
5032	NC_007775	GCA	2	6	228489	228494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5033	NC_007775	GCC	2	6	228495	228500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5034	NC_007775	CTC	2	6	228526	228531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86604948
5035	NC_007775	TGGGCC	2	12	228533	228544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86604948
5036	NC_007775	CGC	2	6	228546	228551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5037	NC_007775	CAC	3	9	228592	228600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604948
5038	NC_007775	CTG	3	9	228622	228630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5039	NC_007775	GTT	2	6	228640	228645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604948
5040	NC_007775	GTT	2	6	228676	228681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86604948
5041	NC_007775	CGC	2	6	228709	228714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5042	NC_007775	CTG	2	6	228741	228746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604948
5043	NC_007775	CGG	3	9	228753	228761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604948
5044	NC_007775	CGC	2	6	228789	228794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604948
5045	NC_007775	ACC	2	6	228886	228891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604948
5046	NC_007775	CAG	2	6	228970	228975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_007775	CAG	2	6	228984	228989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_007775	C	7	7	229023	229029	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5049	NC_007775	GCT	2	6	229356	229361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604950
5050	NC_007775	TTC	2	6	229362	229367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5051	NC_007775	ACC	2	6	229408	229413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604950
5052	NC_007775	ACC	2	6	229469	229474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604950
5053	NC_007775	GCA	2	6	229530	229535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604950
5054	NC_007775	TCT	2	6	229559	229564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5055	NC_007775	CCA	3	9	229616	229624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604950
5056	NC_007775	TTC	2	6	229726	229731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5057	NC_007775	CAC	2	6	229749	229754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604950
5058	NC_007775	AGGT	2	8	229774	229781	25 %	25 %	50 %	0 %	86604950
5059	NC_007775	CTT	2	6	229854	229859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5060	NC_007775	CTT	2	6	229917	229922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5061	NC_007775	TCT	2	6	230018	230023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604950
5062	NC_007775	AGC	2	6	230116	230121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604950
5063	NC_007775	AACC	2	8	230134	230141	50 %	0 %	0 %	50 %	86604950
5064	NC_007775	CTG	2	6	230289	230294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604950
5065	NC_007775	GTA	2	6	230316	230321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86604950
5066	NC_007775	TCTT	2	8	230332	230339	0 %	75 %	0 %	25 %	86604950
5067	NC_007775	GCA	2	6	230541	230546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_007775	TGT	2	6	230588	230593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_007775	TTCCC	2	10	230618	230627	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5070	NC_007775	GGT	2	6	230768	230773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604951
5071	NC_007775	TTC	2	6	230787	230792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604951
5072	NC_007775	GCC	2	6	230872	230877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604951
5073	NC_007775	CTG	2	6	230883	230888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604951
5074	NC_007775	AGG	3	9	230893	230901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604951
5075	NC_007775	GCC	2	6	230913	230918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604951
5076	NC_007775	TCGC	2	8	230924	230931	0 %	25 %	25 %	50 %	86604951
5077	NC_007775	G	6	6	230959	230964	0 %	0 %	100 %	0 %	86604951
5078	NC_007775	CGC	2	6	230978	230983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604951
5079	NC_007775	GCT	4	12	231026	231037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604951
5080	NC_007775	TGG	2	6	231055	231060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604951
5081	NC_007775	CGG	2	6	231175	231180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604951
5082	NC_007775	GA	3	6	231236	231241	50 %	0 %	50 %	0 %	86604951
5083	NC_007775	GTG	2	6	231273	231278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604951
5084	NC_007775	CGG	2	6	231296	231301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86604951
5085	NC_007775	CTG	2	6	231348	231353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604951
5086	NC_007775	CT	3	6	231433	231438	0 %	50 %	0 %	50 %	86604951
5087	NC_007775	G	6	6	231519	231524	0 %	0 %	100 %	0 %	86604952
5088	NC_007775	TTC	2	6	231529	231534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604952
5089	NC_007775	GAA	2	6	231553	231558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604952
5090	NC_007775	ATCCG	2	10	231563	231572	20 %	20 %	20 %	40 %	86604952
5091	NC_007775	AC	4	8	231605	231612	50 %	0 %	0 %	50 %	86604952
5092	NC_007775	CCG	2	6	231711	231716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86604952
5093	NC_007775	GCT	3	9	231750	231758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604952
5094	NC_007775	TCTA	2	8	231855	231862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5095	NC_007775	CTG	2	6	231878	231883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_007775	AGCT	2	8	231894	231901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_007775	CGG	2	6	231916	231921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_007775	TC	3	6	231932	231937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_007775	AGC	2	6	231954	231959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_007775	CAA	2	6	231969	231974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_007775	CACC	2	8	231975	231982	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5102	NC_007775	AAT	2	6	232019	232024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_007775	AAT	2	6	232043	232048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_007775	TAC	2	6	232071	232076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_007775	CAAAG	2	10	232121	232130	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5106	NC_007775	GTA	2	6	232141	232146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_007775	GAC	2	6	232148	232153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007775	CAG	2	6	232282	232287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604953
5109	NC_007775	CAG	3	9	232319	232327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604953
5110	NC_007775	GGCC	2	8	232486	232493	0 %	0 %	50 %	50 %	86604954
5111	NC_007775	AGAA	2	8	232567	232574	75 %	0 %	25 %	0 %	86604954
5112	NC_007775	CTG	2	6	232650	232655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604954
5113	NC_007775	CGA	2	6	232694	232699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604954
5114	NC_007775	CGA	2	6	232814	232819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604955
5115	NC_007775	GGT	2	6	232856	232861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86604955
5116	NC_007775	GAA	2	6	232932	232937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86604955
5117	NC_007775	GCT	2	6	233013	233018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604955
5118	NC_007775	CCA	2	6	233023	233028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86604955
5119	NC_007775	GGA	2	6	233042	233047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86604955
5120	NC_007775	GCA	2	6	233063	233068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86604955
5121	NC_007775	CTG	2	6	233172	233177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86604955
5122	NC_007775	CTT	2	6	233183	233188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86604955
5123	NC_007775	CCTG	2	8	233249	233256	0 %	25 %	25 %	50 %	86604955
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5125	NC_007775	TGCTG	2	10	233318	233327	0 %	40 %	40 %	20 %	86604955
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5500	NC_007775	AGCGGG	2	12	251397	251408	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	86604971

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