MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus RF122

Total Repeats: 65646

< Previous12...2223242526272829303132...131132Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007622	AGA	2	6	547840	547845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750249
13002	NC_007622	AAAGA	2	10	547865	547874	80 %	0 %	20 %	0 %	82750249
13003	NC_007622	ATGA	2	8	547875	547882	50 %	25 %	25 %	0 %	82750249
13004	NC_007622	TGAAA	2	10	547950	547959	60 %	20 %	20 %	0 %	82750249
13005	NC_007622	GTTATA	2	12	547970	547981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_007622	GT	3	6	548007	548012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_007622	TTAA	2	8	548035	548042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_007622	AATA	2	8	548044	548051	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_007622	TCA	2	6	548069	548074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_007622	TTA	2	6	548103	548108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_007622	AGA	2	6	548400	548405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13012	NC_007622	TGC	2	6	548430	548435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13013	NC_007622	AAG	2	6	548492	548497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13014	NC_007622	CGTT	2	8	548537	548544	0 %	50 %	25 %	25 %	82750250
13015	NC_007622	GTTC	2	8	548581	548588	0 %	50 %	25 %	25 %	82750250
13016	NC_007622	A	6	6	548609	548614	100 %	0 %	0 %	0 %	82750250
13017	NC_007622	ATG	2	6	548639	548644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13018	NC_007622	CAA	2	6	548645	548650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82750250
13019	NC_007622	GTG	2	6	548663	548668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82750250
13020	NC_007622	TGT	2	6	548700	548705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13021	NC_007622	TTG	2	6	548786	548791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13022	NC_007622	TTA	2	6	548863	548868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750250
13023	NC_007622	ACC	2	6	548898	548903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82750250
13024	NC_007622	ACAA	2	8	548989	548996	75 %	0 %	0 %	25 %	82750250
13025	NC_007622	A	6	6	548995	549000	100 %	0 %	0 %	0 %	82750250
13026	NC_007622	TCAA	2	8	549023	549030	50 %	25 %	0 %	25 %	82750250
13027	NC_007622	GAA	2	6	549079	549084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13028	NC_007622	TCG	2	6	549099	549104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13029	NC_007622	CGA	2	6	549111	549116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13030	NC_007622	TCAA	2	8	549198	549205	50 %	25 %	0 %	25 %	82750250
13031	NC_007622	GAT	2	6	549226	549231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13032	NC_007622	CAG	2	6	549296	549301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13033	NC_007622	CTT	2	6	549324	549329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82750250
13034	NC_007622	TTA	2	6	549334	549339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750250
13035	NC_007622	GAT	2	6	549358	549363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13036	NC_007622	CGT	2	6	549382	549387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13037	NC_007622	TAC	2	6	549407	549412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82750250
13038	NC_007622	CAA	2	6	549499	549504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82750250
13039	NC_007622	TTAA	2	8	549505	549512	50 %	50 %	0 %	0 %	82750250
13040	NC_007622	CGT	2	6	549613	549618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13041	NC_007622	TGG	2	6	549636	549641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82750250
13042	NC_007622	ACT	2	6	549683	549688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82750250
13043	NC_007622	GATT	2	8	549740	549747	25 %	50 %	25 %	0 %	82750250
13044	NC_007622	GAA	2	6	549865	549870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13045	NC_007622	TGT	2	6	549879	549884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13046	NC_007622	GAT	2	6	549928	549933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13047	NC_007622	A	6	6	549980	549985	100 %	0 %	0 %	0 %	82750250
13048	NC_007622	GTT	2	6	550015	550020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13049	NC_007622	CAG	2	6	550022	550027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13050	NC_007622	ATG	2	6	550055	550060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13051	NC_007622	TGA	2	6	550112	550117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13052	NC_007622	TTG	2	6	550133	550138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13053	NC_007622	GCA	2	6	550159	550164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13054	NC_007622	CGT	2	6	550240	550245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13055	NC_007622	CAAC	2	8	550335	550342	50 %	0 %	0 %	50 %	82750250
13056	NC_007622	TGT	2	6	550365	550370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82750250
13057	NC_007622	GTA	2	6	550438	550443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13058	NC_007622	GAA	2	6	550582	550587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13059	NC_007622	GAA	2	6	550732	550737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13060	NC_007622	GAA	2	6	550849	550854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13061	NC_007622	CGA	2	6	550857	550862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13062	NC_007622	TA	3	6	550898	550903	50 %	50 %	0 %	0 %	82750250
13063	NC_007622	TG	3	6	550940	550945	0 %	50 %	50 %	0 %	82750250
13064	NC_007622	GAA	2	6	550987	550992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13065	NC_007622	CTTA	2	8	551000	551007	25 %	50 %	0 %	25 %	82750250
13066	NC_007622	CGGA	2	8	551009	551016	25 %	0 %	50 %	25 %	82750250
13067	NC_007622	CGAT	2	8	551021	551028	25 %	25 %	25 %	25 %	82750250
13068	NC_007622	GCT	2	6	551101	551106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750250
13069	NC_007622	ACGATG	2	12	551153	551164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	82750250
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13071	NC_007622	GAA	2	6	551179	551184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750250
13072	NC_007622	ATG	2	6	551219	551224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13073	NC_007622	TGA	2	6	551298	551303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
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13078	NC_007622	GTTTAG	2	12	551576	551587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	82750250
13079	NC_007622	TGA	2	6	551637	551642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
13080	NC_007622	GAT	2	6	551644	551649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750250
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13084	NC_007622	TGA	2	6	551765	551770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_007622	TAAA	2	8	551796	551803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_007622	ATCA	2	8	551809	551816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13087	NC_007622	AGG	2	6	551841	551846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_007622	TTGA	2	8	551855	551862	25 %	50 %	25 %	0 %	82750251
13089	NC_007622	AAT	2	6	551867	551872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750251
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13091	NC_007622	A	6	6	551939	551944	100 %	0 %	0 %	0 %	82750251
13092	NC_007622	CGT	2	6	552116	552121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750251
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13098	NC_007622	TAT	2	6	552300	552305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750251
13099	NC_007622	ATT	2	6	552324	552329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750251
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13102	NC_007622	GAT	2	6	552529	552534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750251
13103	NC_007622	ATC	2	6	552551	552556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82750251
13104	NC_007622	CCA	2	6	552557	552562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82750251
13105	NC_007622	TGG	2	6	552589	552594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82750251
13106	NC_007622	CAA	2	6	552603	552608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82750251
13107	NC_007622	CGT	2	6	552629	552634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750251
13108	NC_007622	TAAT	2	8	552636	552643	50 %	50 %	0 %	0 %	82750251
13109	NC_007622	AAT	2	6	552647	552652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750251
13110	NC_007622	TTA	2	6	552665	552670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750251
13111	NC_007622	TAT	2	6	552688	552693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750251
13112	NC_007622	AAG	2	6	552720	552725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750251
13113	NC_007622	GTC	2	6	552750	552755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750251
13114	NC_007622	GTC	2	6	552759	552764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750251
13115	NC_007622	ACTT	2	8	552843	552850	25 %	50 %	0 %	25 %	82750251
13116	NC_007622	GAT	2	6	553034	553039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750251
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13120	NC_007622	AGT	2	6	553315	553320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750251
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13122	NC_007622	TAA	2	6	553402	553407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82750251
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13310	NC_007622	AAT	2	6	560621	560626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13311	NC_007622	TGA	2	6	560627	560632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13312	NC_007622	GACT	2	8	560635	560642	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13315	NC_007622	CTC	2	6	560707	560712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13317	NC_007622	AATT	2	8	560788	560795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13318	NC_007622	TACAGC	2	12	560848	560859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82750257
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13347	NC_007622	ATGA	2	8	562066	562073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13348	NC_007622	TA	3	6	562141	562146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13349	NC_007622	AAATCA	2	12	562252	562263	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	82750258
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13352	NC_007622	AGC	2	6	562343	562348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750258
13353	NC_007622	CAAT	2	8	562387	562394	50 %	25 %	0 %	25 %	82750258
13354	NC_007622	ACG	2	6	562411	562416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750258
13355	NC_007622	AACA	2	8	562423	562430	75 %	0 %	0 %	25 %	82750258
13356	NC_007622	ATCA	2	8	562468	562475	50 %	25 %	0 %	25 %	82750258
13357	NC_007622	GCT	2	6	562494	562499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82750258
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13362	NC_007622	GAT	2	6	562620	562625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82750258
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13364	NC_007622	CAATA	2	10	562662	562671	60 %	20 %	0 %	20 %	82750258
13365	NC_007622	ATGG	2	8	562704	562711	25 %	25 %	50 %	0 %	82750258
13366	NC_007622	AGA	2	6	562748	562753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750258
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13492	NC_007622	TTGGTG	2	12	568230	568241	0 %	50 %	50 %	0 %	82750262
13493	NC_007622	CATCA	2	10	568242	568251	40 %	20 %	0 %	40 %	82750262
13494	NC_007622	ATT	2	6	568258	568263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750262
13495	NC_007622	ATT	2	6	568265	568270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750262
13496	NC_007622	TGG	2	6	568294	568299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82750262
13497	NC_007622	AGA	2	6	568330	568335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82750262
13498	NC_007622	GTGC	2	8	568343	568350	0 %	25 %	50 %	25 %	82750262
13499	NC_007622	GCA	2	6	568394	568399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82750262
13500	NC_007622	TTA	2	6	568403	568408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82750262

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