MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_007613	GCTACT	2	12	1043175	1043186	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	82543560
21503	NC_007613	GACT	2	8	1043199	1043206	25 %	25 %	25 %	25 %	82543560
21504	NC_007613	AAAT	2	8	1043217	1043224	75 %	25 %	0 %	0 %	82543560
21505	NC_007613	AGA	2	6	1043233	1043238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543560
21506	NC_007613	TAT	2	6	1043239	1043244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543560
21507	NC_007613	ATT	2	6	1043306	1043311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543560
21508	NC_007613	TCA	2	6	1043346	1043351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543560
21509	NC_007613	TA	3	6	1043432	1043437	50 %	50 %	0 %	0 %	82543560
21510	NC_007613	CATT	2	8	1043474	1043481	25 %	50 %	0 %	25 %	82543560
21511	NC_007613	G	6	6	1043507	1043512	0 %	0 %	100 %	0 %	82543560
21512	NC_007613	A	7	7	1043586	1043592	100 %	0 %	0 %	0 %	82543561
21513	NC_007613	T	8	8	1043638	1043645	0 %	100 %	0 %	0 %	82543561
21514	NC_007613	GAC	2	6	1043646	1043651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543561
21515	NC_007613	TGA	2	6	1043684	1043689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543561
21516	NC_007613	AG	3	6	1043790	1043795	50 %	0 %	50 %	0 %	82543561
21517	NC_007613	GC	3	6	1043822	1043827	0 %	0 %	50 %	50 %	82543561
21518	NC_007613	AGG	2	6	1043833	1043838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543561
21519	NC_007613	GCC	2	6	1043899	1043904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543561
21520	NC_007613	CAG	2	6	1043976	1043981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543561
21521	NC_007613	GAA	2	6	1044006	1044011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543561
21522	NC_007613	GGC	2	6	1044014	1044019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543561
21523	NC_007613	TGAAA	2	10	1044074	1044083	60 %	20 %	20 %	0 %	82543561
21524	NC_007613	GAG	2	6	1044084	1044089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543561
21525	NC_007613	GAT	2	6	1044102	1044107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543561
21526	NC_007613	AGA	2	6	1044168	1044173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21527	NC_007613	GGGC	2	8	1044266	1044273	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21528	NC_007613	AGTC	2	8	1044288	1044295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21529	NC_007613	GTCA	2	8	1044374	1044381	25 %	25 %	25 %	25 %	82543562
21530	NC_007613	CTG	2	6	1044395	1044400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543562
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21532	NC_007613	ATTC	2	8	1044610	1044617	25 %	50 %	0 %	25 %	82543562
21533	NC_007613	TCC	2	6	1044807	1044812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543562
21534	NC_007613	AGG	2	6	1044900	1044905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543562
21535	NC_007613	CAG	2	6	1044964	1044969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543562
21536	NC_007613	CTG	2	6	1044983	1044988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543562
21537	NC_007613	TTGT	2	8	1045157	1045164	0 %	75 %	25 %	0 %	82543562
21538	NC_007613	TGT	2	6	1045218	1045223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543562
21539	NC_007613	TGT	2	6	1045278	1045283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543562
21540	NC_007613	ATT	2	6	1045296	1045301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543562
21541	NC_007613	ATC	2	6	1045418	1045423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543562
21542	NC_007613	ACAG	2	8	1045506	1045513	50 %	0 %	25 %	25 %	82543562
21543	NC_007613	AT	3	6	1045533	1045538	50 %	50 %	0 %	0 %	82543562
21544	NC_007613	TCAC	2	8	1045581	1045588	25 %	25 %	0 %	50 %	82543562
21545	NC_007613	TA	3	6	1045592	1045597	50 %	50 %	0 %	0 %	82543562
21546	NC_007613	TCA	2	6	1045716	1045721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543562
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21548	NC_007613	ATT	2	6	1045880	1045885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543562
21549	NC_007613	G	7	7	1045939	1045945	0 %	0 %	100 %	0 %	82543562
21550	NC_007613	ATT	2	6	1045946	1045951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543562
21551	NC_007613	ATA	2	6	1045962	1045967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543562
21552	NC_007613	ATA	2	6	1046009	1046014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21553	NC_007613	TAAAA	2	10	1046018	1046027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21554	NC_007613	A	7	7	1046086	1046092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21555	NC_007613	GTTA	2	8	1046148	1046155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21556	NC_007613	TGC	2	6	1046264	1046269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21557	NC_007613	T	6	6	1046282	1046287	0 %	100 %	0 %	0 %	82543563
21558	NC_007613	TAC	2	6	1046306	1046311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543563
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21562	NC_007613	CAGG	2	8	1046551	1046558	25 %	0 %	50 %	25 %	82543563
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21569	NC_007613	GAA	2	6	1046809	1046814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21572	NC_007613	CAT	2	6	1046914	1046919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21574	NC_007613	TGC	2	6	1046971	1046976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543564
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21585	NC_007613	TGGC	2	8	1047517	1047524	0 %	25 %	50 %	25 %	82543565
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21592	NC_007613	GGA	2	6	1047936	1047941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21593	NC_007613	AGA	2	6	1047965	1047970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21602	NC_007613	CAC	2	6	1048369	1048374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543567
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21606	NC_007613	CTGC	2	8	1048492	1048499	0 %	25 %	25 %	50 %	82543567
21607	NC_007613	CCG	2	6	1048538	1048543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543567
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21619	NC_007613	GGC	2	6	1049292	1049297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21621	NC_007613	T	7	7	1049369	1049375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21983	NC_007613	GGGGA	2	10	1066217	1066226	20 %	0 %	80 %	0 %	82543585
21984	NC_007613	GAA	2	6	1066238	1066243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543585
21985	NC_007613	AATG	2	8	1066306	1066313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21986	NC_007613	CCA	2	6	1066333	1066338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21987	NC_007613	A	6	6	1066394	1066399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21988	NC_007613	GTC	2	6	1066411	1066416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21989	NC_007613	GCA	2	6	1066422	1066427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21990	NC_007613	A	6	6	1066459	1066464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21991	NC_007613	CGC	2	6	1066471	1066476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21992	NC_007613	T	6	6	1066523	1066528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21993	NC_007613	GTG	3	9	1066552	1066560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21994	NC_007613	ATC	2	6	1066592	1066597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21995	NC_007613	TCACT	2	10	1066703	1066712	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21996	NC_007613	CGA	2	6	1066747	1066752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21997	NC_007613	CGA	2	6	1066778	1066783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21998	NC_007613	GTCA	2	8	1066792	1066799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21999	NC_007613	TGC	2	6	1066899	1066904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22000	NC_007613	TCG	2	6	1066922	1066927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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