MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_007613	TCG	2	6	1017691	1017696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543535
21003	NC_007613	CAA	2	6	1017750	1017755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543535
21004	NC_007613	CGC	2	6	1017933	1017938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21005	NC_007613	CG	3	6	1018058	1018063	0 %	0 %	50 %	50 %	82543536
21006	NC_007613	GCG	2	6	1018143	1018148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543536
21007	NC_007613	CGC	2	6	1018253	1018258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543536
21008	NC_007613	CAG	2	6	1018310	1018315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543536
21009	NC_007613	GTTCA	2	10	1018418	1018427	20 %	40 %	20 %	20 %	82543536
21010	NC_007613	CAC	2	6	1018492	1018497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543536
21011	NC_007613	TGC	2	6	1018542	1018547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543536
21012	NC_007613	CG	3	6	1018603	1018608	0 %	0 %	50 %	50 %	82543536
21013	NC_007613	AGT	2	6	1018668	1018673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543536
21014	NC_007613	CAA	2	6	1018739	1018744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543536
21015	NC_007613	ATTA	2	8	1018912	1018919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_007613	AAT	2	6	1018985	1018990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543537
21017	NC_007613	GC	3	6	1019087	1019092	0 %	0 %	50 %	50 %	82543537
21018	NC_007613	CG	3	6	1019131	1019136	0 %	0 %	50 %	50 %	82543537
21019	NC_007613	CGA	2	6	1019200	1019205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543537
21020	NC_007613	GCC	2	6	1019249	1019254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543537
21021	NC_007613	GTG	2	6	1019274	1019279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543537
21022	NC_007613	CAA	2	6	1019327	1019332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543537
21023	NC_007613	TGA	2	6	1019386	1019391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543537
21024	NC_007613	GC	4	8	1019402	1019409	0 %	0 %	50 %	50 %	82543537
21025	NC_007613	GCT	2	6	1019422	1019427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543537
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21028	NC_007613	GCA	2	6	1019464	1019469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543537
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21033	NC_007613	GCGG	2	8	1019603	1019610	0 %	0 %	75 %	25 %	82543537
21034	NC_007613	A	6	6	1019612	1019617	100 %	0 %	0 %	0 %	82543537
21035	NC_007613	ACC	2	6	1019641	1019646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543537
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21042	NC_007613	GAT	2	6	1019935	1019940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543538
21043	NC_007613	CAGG	2	8	1019992	1019999	25 %	0 %	50 %	25 %	82543538
21044	NC_007613	AGATG	2	10	1020070	1020079	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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21046	NC_007613	AATT	2	8	1020092	1020099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_007613	T	6	6	1020141	1020146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21048	NC_007613	AG	3	6	1020198	1020203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_007613	GCA	2	6	1020216	1020221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21050	NC_007613	T	7	7	1020277	1020283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_007613	GT	3	6	1020300	1020305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21052	NC_007613	CT	3	6	1020334	1020339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21053	NC_007613	GTG	2	6	1020401	1020406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_007613	CTG	2	6	1020413	1020418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21055	NC_007613	GTT	2	6	1020499	1020504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_007613	TGGC	2	8	1020521	1020528	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21057	NC_007613	GCC	2	6	1020536	1020541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21058	NC_007613	GGT	2	6	1020614	1020619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21061	NC_007613	GAA	2	6	1020739	1020744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21062	NC_007613	TGG	2	6	1020789	1020794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21063	NC_007613	GGAC	2	8	1020800	1020807	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21064	NC_007613	CG	3	6	1020824	1020829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21065	NC_007613	CAA	2	6	1020923	1020928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21072	NC_007613	ATA	2	6	1021243	1021248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_007613	TCA	2	6	1021293	1021298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21075	NC_007613	GC	3	6	1021352	1021357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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21081	NC_007613	CCTGA	2	10	1021600	1021609	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21082	NC_007613	ATC	2	6	1021641	1021646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21086	NC_007613	A	6	6	1021880	1021885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21087	NC_007613	AC	3	6	1021895	1021900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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21091	NC_007613	AGCT	2	8	1022206	1022213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21092	NC_007613	CGG	2	6	1022266	1022271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21094	NC_007613	CGG	2	6	1022383	1022388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21095	NC_007613	GCG	2	6	1022460	1022465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21096	NC_007613	GCTG	2	8	1022489	1022496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21097	NC_007613	TGT	2	6	1022649	1022654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543539
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21099	NC_007613	GCCA	2	8	1022743	1022750	25 %	0 %	25 %	50 %	82543539
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21104	NC_007613	ATCAC	2	10	1022940	1022949	40 %	20 %	0 %	40 %	82543539
21105	NC_007613	T	6	6	1022990	1022995	0 %	100 %	0 %	0 %	82543539
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21107	NC_007613	AGGA	2	8	1023216	1023223	50 %	0 %	50 %	0 %	82543540
21108	NC_007613	ATGGAA	2	12	1023230	1023241	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	82543540
21109	NC_007613	CAT	2	6	1023266	1023271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543540
21110	NC_007613	GCA	2	6	1023291	1023296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543540
21111	NC_007613	CCA	2	6	1023349	1023354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21112	NC_007613	AT	3	6	1023362	1023367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21113	NC_007613	CGA	2	6	1023503	1023508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21114	NC_007613	CAC	2	6	1023526	1023531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21115	NC_007613	ATCAC	2	10	1023542	1023551	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21116	NC_007613	TGTTGG	2	12	1023590	1023601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21117	NC_007613	TGAA	2	8	1023722	1023729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21118	NC_007613	TTTTTA	2	12	1023769	1023780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	82543541
21119	NC_007613	TGC	2	6	1023799	1023804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543541
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21122	NC_007613	TCCT	2	8	1023872	1023879	0 %	50 %	0 %	50 %	82543541
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21124	NC_007613	A	6	6	1024100	1024105	100 %	0 %	0 %	0 %	82543542
21125	NC_007613	GTGAT	2	10	1024146	1024155	20 %	40 %	40 %	0 %	82543542
21126	NC_007613	GCTG	2	8	1024212	1024219	0 %	25 %	50 %	25 %	82543542
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21144	NC_007613	GGT	2	6	1025137	1025142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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21241	NC_007613	GCC	2	6	1030070	1030075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543547
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21485	NC_007613	CCGA	2	8	1041989	1041996	25 %	0 %	25 %	50 %	82543559
21486	NC_007613	AGA	2	6	1042229	1042234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543560
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21488	NC_007613	TGA	2	6	1042455	1042460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543560
21489	NC_007613	TGG	2	6	1042476	1042481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543560
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