MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_007613	GCG	2	6	679943	679948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543226
14002	NC_007613	GAT	2	6	680015	680020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543226
14003	NC_007613	CGGT	2	8	680032	680039	0 %	25 %	50 %	25 %	82543226
14004	NC_007613	GC	3	6	680054	680059	0 %	0 %	50 %	50 %	82543226
14005	NC_007613	TGAT	2	8	680143	680150	25 %	50 %	25 %	0 %	82543226
14006	NC_007613	CG	3	6	680302	680307	0 %	0 %	50 %	50 %	82543226
14007	NC_007613	GGA	2	6	680327	680332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543226
14008	NC_007613	AGA	2	6	680339	680344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543226
14009	NC_007613	GCC	2	6	680349	680354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543226
14010	NC_007613	ACA	2	6	680377	680382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543226
14011	NC_007613	CTG	2	6	680385	680390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14012	NC_007613	AGC	2	6	680395	680400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14013	NC_007613	GAT	2	6	680432	680437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543226
14014	NC_007613	ACT	2	6	680470	680475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543226
14015	NC_007613	CCG	2	6	680511	680516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543226
14016	NC_007613	CCTG	2	8	680531	680538	0 %	25 %	25 %	50 %	82543226
14017	NC_007613	GCT	2	6	680546	680551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14018	NC_007613	GTC	2	6	680553	680558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14019	NC_007613	GGC	2	6	680589	680594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543226
14020	NC_007613	TGG	2	6	680629	680634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543226
14021	NC_007613	CGG	2	6	680759	680764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543226
14022	NC_007613	TGG	2	6	680770	680775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543226
14023	NC_007613	GGT	2	6	680780	680785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543226
14024	NC_007613	TGA	2	6	680843	680848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543226
14025	NC_007613	TCT	2	6	680849	680854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543226
14026	NC_007613	AGCG	2	8	680869	680876	25 %	0 %	50 %	25 %	82543226
14027	NC_007613	AACG	2	8	680883	680890	50 %	0 %	25 %	25 %	82543226
14028	NC_007613	CAC	2	6	680900	680905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543226
14029	NC_007613	GAA	2	6	680946	680951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543226
14030	NC_007613	GCGT	2	8	680962	680969	0 %	25 %	50 %	25 %	82543226
14031	NC_007613	TGG	2	6	681097	681102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543226
14032	NC_007613	AAG	2	6	681121	681126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543226
14033	NC_007613	CGTT	2	8	681144	681151	0 %	50 %	25 %	25 %	82543226
14034	NC_007613	CAG	2	6	681270	681275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14035	NC_007613	CGC	2	6	681301	681306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543226
14036	NC_007613	TTG	2	6	681397	681402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543226
14037	NC_007613	GCA	2	6	681443	681448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543226
14038	NC_007613	TGA	2	6	681472	681477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543226
14039	NC_007613	GAA	2	6	681504	681509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543226
14040	NC_007613	GTT	2	6	681548	681553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543226
14041	NC_007613	GAA	2	6	681579	681584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_007613	TGA	2	6	681588	681593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_007613	AT	3	6	681648	681653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_007613	CGC	2	6	681691	681696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14045	NC_007613	AAC	2	6	681707	681712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_007613	AAC	2	6	681801	681806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543227
14047	NC_007613	CCT	2	6	681847	681852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543227
14048	NC_007613	CCG	2	6	681874	681879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543227
14049	NC_007613	CGA	2	6	681898	681903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543227
14050	NC_007613	T	6	6	681920	681925	0 %	100 %	0 %	0 %	82543227
14051	NC_007613	GCTT	2	8	681952	681959	0 %	50 %	25 %	25 %	82543227
14052	NC_007613	ACTCA	2	10	681986	681995	40 %	20 %	0 %	40 %	82543227
14053	NC_007613	GCG	2	6	682034	682039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543227
14054	NC_007613	CAG	3	9	682061	682069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543227
14055	NC_007613	AAT	2	6	682106	682111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543227
14056	NC_007613	TAA	3	9	682172	682180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543227
14057	NC_007613	CAG	2	6	682304	682309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543227
14058	NC_007613	GCC	2	6	682409	682414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543227
14059	NC_007613	GTTG	2	8	682462	682469	0 %	50 %	50 %	0 %	82543227
14060	NC_007613	GCC	2	6	682499	682504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543227
14061	NC_007613	CCA	2	6	682533	682538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543227
14062	NC_007613	GTG	3	9	682545	682553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543227
14063	NC_007613	TGA	2	6	682589	682594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543227
14064	NC_007613	GA	3	6	682593	682598	50 %	0 %	50 %	0 %	82543227
14065	NC_007613	CCG	2	6	682620	682625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543227
14066	NC_007613	CAGC	2	8	682648	682655	25 %	0 %	25 %	50 %	82543227
14067	NC_007613	TCT	2	6	682763	682768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_007613	TGA	2	6	682801	682806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_007613	TA	3	6	682870	682875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_007613	CCA	2	6	683013	683018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14071	NC_007613	GAAG	2	8	683023	683030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_007613	ACTG	2	8	683077	683084	25 %	25 %	25 %	25 %	82543228
14073	NC_007613	TAC	2	6	683105	683110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543228
14074	NC_007613	TG	3	6	683131	683136	0 %	50 %	50 %	0 %	82543228
14075	NC_007613	CTGC	2	8	683155	683162	0 %	25 %	25 %	50 %	82543228
14076	NC_007613	GCG	2	6	683181	683186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543228
14077	NC_007613	CG	3	6	683232	683237	0 %	0 %	50 %	50 %	82543228
14078	NC_007613	AGG	2	6	683275	683280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543228
14079	NC_007613	CGC	2	6	683294	683299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543228
14080	NC_007613	ATC	2	6	683312	683317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543228
14081	NC_007613	ACG	2	6	683334	683339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543228
14082	NC_007613	CAC	2	6	683359	683364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543228
14083	NC_007613	CGCC	2	8	683449	683456	0 %	0 %	25 %	75 %	82543228
14084	NC_007613	TGC	2	6	683512	683517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543228
14085	NC_007613	ATC	2	6	683574	683579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543228
14086	NC_007613	CCA	2	6	683734	683739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543228
14087	NC_007613	GA	3	6	683796	683801	50 %	0 %	50 %	0 %	82543228
14088	NC_007613	TCC	2	6	683861	683866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543228
14089	NC_007613	GGC	2	6	683900	683905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543228
14090	NC_007613	CTG	2	6	683921	683926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543228
14091	NC_007613	GCG	2	6	683969	683974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543228
14092	NC_007613	GAA	2	6	683983	683988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543228
14093	NC_007613	ACA	2	6	684012	684017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543228
14094	NC_007613	GGC	2	6	684047	684052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543228
14095	NC_007613	GA	3	6	684067	684072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_007613	TCG	2	6	684136	684141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543229
14097	NC_007613	GAA	2	6	684146	684151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543229
14098	NC_007613	AAG	2	6	684189	684194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543229
14099	NC_007613	GAAA	2	8	684226	684233	75 %	0 %	25 %	0 %	82543229
14100	NC_007613	CGCTA	2	10	684236	684245	20 %	20 %	20 %	40 %	82543229
14101	NC_007613	CGA	2	6	684277	684282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543229
14102	NC_007613	GGT	2	6	684305	684310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543229
14103	NC_007613	TGC	2	6	684348	684353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543229
14104	NC_007613	GTT	2	6	684355	684360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543229
14105	NC_007613	TGT	2	6	684399	684404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543229
14106	NC_007613	CAA	2	6	684460	684465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543229
14107	NC_007613	ATC	2	6	684524	684529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543229
14108	NC_007613	TCCA	2	8	684567	684574	25 %	25 %	0 %	50 %	82543229
14109	NC_007613	GAA	2	6	684580	684585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543229
14110	NC_007613	CGC	2	6	684615	684620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543230
14111	NC_007613	TGG	2	6	684635	684640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543230
14112	NC_007613	CGTG	2	8	684663	684670	0 %	25 %	50 %	25 %	82543230
14113	NC_007613	GCGG	2	8	684675	684682	0 %	0 %	75 %	25 %	82543230
14114	NC_007613	GAT	2	6	684717	684722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543230
14115	NC_007613	CCA	2	6	684735	684740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543230
14116	NC_007613	GGC	2	6	684783	684788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543230
14117	NC_007613	GCC	2	6	684899	684904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543230
14118	NC_007613	GGC	2	6	684954	684959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543230
14119	NC_007613	GCG	2	6	685034	685039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543230
14120	NC_007613	GAT	2	6	685069	685074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543230
14121	NC_007613	T	7	7	685083	685089	0 %	100 %	0 %	0 %	82543231
14122	NC_007613	TGG	2	6	685107	685112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543231
14123	NC_007613	GCGCTG	2	12	685196	685207	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82543231
14124	NC_007613	CTGA	2	8	685265	685272	25 %	25 %	25 %	25 %	82543231
14125	NC_007613	CGA	2	6	685276	685281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543231
14126	NC_007613	TTC	2	6	685289	685294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543231
14127	NC_007613	CCG	2	6	685295	685300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543231
14128	NC_007613	TTG	3	9	685333	685341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543232
14129	NC_007613	TGGC	2	8	685377	685384	0 %	25 %	50 %	25 %	82543232
14130	NC_007613	TTG	2	6	685513	685518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543232
14131	NC_007613	GCA	2	6	685627	685632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543232
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14135	NC_007613	TCA	2	6	685854	685859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14136	NC_007613	GGCT	2	8	685947	685954	0 %	25 %	50 %	25 %	82543233
14137	NC_007613	TTG	2	6	685999	686004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543233
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14147	NC_007613	CCG	2	6	686601	686606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543233
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14149	NC_007613	AATATT	2	12	686782	686793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14150	NC_007613	T	6	6	686792	686797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14151	NC_007613	TGG	2	6	686907	686912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14152	NC_007613	CAA	2	6	686976	686981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14153	NC_007613	TTA	3	9	686999	687007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14154	NC_007613	TGTA	2	8	687011	687018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14155	NC_007613	TAAG	2	8	687024	687031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14156	NC_007613	CAA	2	6	687037	687042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14157	NC_007613	AT	3	6	687068	687073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14159	NC_007613	TGG	2	6	687090	687095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14162	NC_007613	TCCT	2	8	687216	687223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14163	NC_007613	GTG	2	6	687241	687246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14164	NC_007613	A	6	6	687444	687449	100 %	0 %	0 %	0 %	82543234
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14174	NC_007613	ATG	2	6	688007	688012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14177	NC_007613	CTT	2	6	688237	688242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14227	NC_007613	GTA	2	6	690254	690259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14231	NC_007613	ATA	2	6	690476	690481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14232	NC_007613	GC	3	6	690609	690614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14233	NC_007613	GTA	2	6	690651	690656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_007613	GC	3	6	690679	690684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14235	NC_007613	GAT	2	6	690741	690746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14237	NC_007613	CCA	2	6	690780	690785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14238	NC_007613	CACAT	2	10	690868	690877	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14239	NC_007613	CGG	2	6	690897	690902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14240	NC_007613	CGC	2	6	690923	690928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14241	NC_007613	GC	3	6	691127	691132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14242	NC_007613	TTG	2	6	691266	691271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_007613	AGTA	2	8	691385	691392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_007613	TTC	2	6	691401	691406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14245	NC_007613	GA	3	6	691409	691414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_007613	CAA	2	6	691428	691433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543236
14247	NC_007613	GCT	2	6	691496	691501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543236
14248	NC_007613	GGT	2	6	691502	691507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543236
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14360	NC_007613	GCT	2	6	697054	697059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543241
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14363	NC_007613	TCT	2	6	697263	697268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543241
14364	NC_007613	AGT	2	6	697279	697284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543241
14365	NC_007613	GGC	2	6	697316	697321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543241
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14367	NC_007613	GCA	2	6	697374	697379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543241
14368	NC_007613	T	6	6	697388	697393	0 %	100 %	0 %	0 %	82543241
14369	NC_007613	ATT	2	6	697424	697429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543241
14370	NC_007613	TGAT	2	8	697456	697463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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