MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_007613	CAG	2	6	627920	627925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543172
13003	NC_007613	ATA	2	6	627943	627948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543172
13004	NC_007613	AAT	2	6	627960	627965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543172
13005	NC_007613	GCT	2	6	628009	628014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543172
13006	NC_007613	TGA	2	6	628045	628050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543172
13007	NC_007613	AGAA	2	8	628058	628065	75 %	0 %	25 %	0 %	82543172
13008	NC_007613	CAT	3	9	628101	628109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543172
13009	NC_007613	GCC	2	6	628110	628115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543172
13010	NC_007613	CGC	2	6	628203	628208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543172
13011	NC_007613	TGG	2	6	628247	628252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543172
13012	NC_007613	GAC	2	6	628256	628261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543172
13013	NC_007613	GGC	2	6	628296	628301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543172
13014	NC_007613	AGAA	2	8	628350	628357	75 %	0 %	25 %	0 %	82543172
13015	NC_007613	ACC	2	6	628359	628364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543172
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13017	NC_007613	CGA	2	6	628417	628422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543172
13018	NC_007613	ATT	2	6	628425	628430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543172
13019	NC_007613	TCT	2	6	628432	628437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543172
13020	NC_007613	GT	3	6	628453	628458	0 %	50 %	50 %	0 %	82543172
13021	NC_007613	ATT	2	6	628492	628497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_007613	CAT	2	6	628515	628520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_007613	GA	3	6	628550	628555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_007613	ATT	2	6	628568	628573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_007613	CAT	2	6	628621	628626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543173
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13027	NC_007613	GCA	2	6	628753	628758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543173
13028	NC_007613	GCC	2	6	628763	628768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543173
13029	NC_007613	GCG	2	6	628854	628859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543173
13030	NC_007613	TTA	2	6	628872	628877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543173
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13032	NC_007613	GCA	2	6	629073	629078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_007613	AACA	2	8	629097	629104	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13034	NC_007613	GA	3	6	629130	629135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_007613	ACG	2	6	629298	629303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543174
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13038	NC_007613	TGG	2	6	629448	629453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543174
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13040	NC_007613	TGC	2	6	629670	629675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543174
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13054	NC_007613	CAA	2	6	630440	630445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13055	NC_007613	A	6	6	630444	630449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_007613	CCG	2	6	630521	630526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543175
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13065	NC_007613	TCG	2	6	630919	630924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543175
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13070	NC_007613	CAGA	2	8	631154	631161	50 %	0 %	25 %	25 %	82543175
13071	NC_007613	CGT	2	6	631166	631171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543175
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13075	NC_007613	ATA	2	6	631277	631282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13088	NC_007613	TCG	2	6	632032	632037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543176
13089	NC_007613	CAT	2	6	632090	632095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543176
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13091	NC_007613	CCTGAT	2	12	632294	632305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	82543176
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13093	NC_007613	AAAGT	2	10	632375	632384	60 %	20 %	20 %	0 %	82543176
13094	NC_007613	GTT	2	6	632421	632426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543176
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13096	NC_007613	CGA	2	6	632608	632613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543177
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13100	NC_007613	GC	3	6	632788	632793	0 %	0 %	50 %	50 %	82543177
13101	NC_007613	TCAG	2	8	632820	632827	25 %	25 %	25 %	25 %	82543177
13102	NC_007613	GCTG	2	8	632910	632917	0 %	25 %	50 %	25 %	82543177
13103	NC_007613	GAA	2	6	632921	632926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543177
13104	NC_007613	ACG	2	6	632951	632956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543177
13105	NC_007613	TGA	3	9	633001	633009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543177
13106	NC_007613	TCTT	2	8	633081	633088	0 %	75 %	0 %	25 %	82543177
13107	NC_007613	CAA	2	6	633133	633138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543177
13108	NC_007613	GAT	2	6	633193	633198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543177
13109	NC_007613	GCT	2	6	633202	633207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543177
13110	NC_007613	GAA	2	6	633243	633248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543177
13111	NC_007613	CCG	2	6	633297	633302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543177
13112	NC_007613	TGT	2	6	633307	633312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543177
13113	NC_007613	CAC	2	6	633332	633337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543177
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13120	NC_007613	GC	3	6	633672	633677	0 %	0 %	50 %	50 %	82543178
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13122	NC_007613	AACC	2	8	633736	633743	50 %	0 %	0 %	50 %	82543178
13123	NC_007613	TACG	2	8	633751	633758	25 %	25 %	25 %	25 %	82543178
13124	NC_007613	GCA	2	6	633769	633774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543178
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13126	NC_007613	GCA	2	6	633973	633978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543178
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13156	NC_007613	GCC	2	6	635938	635943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13241	NC_007613	GGGC	2	8	640622	640629	0 %	0 %	75 %	25 %	82543185
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13243	NC_007613	TGT	2	6	640749	640754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543185
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13245	NC_007613	CAGA	2	8	640791	640798	50 %	0 %	25 %	25 %	82543185
13246	NC_007613	GAA	2	6	640844	640849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543185
13247	NC_007613	GTA	2	6	640857	640862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543185
13248	NC_007613	TGA	2	6	640866	640871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543185
13249	NC_007613	CAA	2	6	640892	640897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543185
13250	NC_007613	CAT	2	6	640928	640933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543185
13251	NC_007613	CGCTGG	2	12	640953	640964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	82543185
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13254	NC_007613	GAC	2	6	641117	641122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543185
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13264	NC_007613	CGG	2	6	641684	641689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543186
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13267	NC_007613	TTA	2	6	641817	641822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543186
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13271	NC_007613	CAGT	2	8	642207	642214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13272	NC_007613	AATT	2	8	642276	642283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13273	NC_007613	GTG	2	6	642288	642293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13274	NC_007613	AATT	2	8	642310	642317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13275	NC_007613	TCCC	2	8	642334	642341	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13276	NC_007613	CGTC	2	8	642343	642350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13277	NC_007613	CTG	2	6	642419	642424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13279	NC_007613	T	7	7	642575	642581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13280	NC_007613	GTG	2	6	642628	642633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13281	NC_007613	GA	3	6	642636	642641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13282	NC_007613	T	6	6	642662	642667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13283	NC_007613	GTT	2	6	642668	642673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13284	NC_007613	TCC	2	6	642700	642705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13285	NC_007613	GCC	2	6	642715	642720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13286	NC_007613	CTTCA	2	10	642840	642849	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13287	NC_007613	TCT	2	6	642880	642885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13288	NC_007613	CAA	2	6	642935	642940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543187
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13323	NC_007613	T	6	6	645157	645162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13324	NC_007613	TCA	2	6	645268	645273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13329	NC_007613	TGT	2	6	645425	645430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13330	NC_007613	TAGCAA	2	12	645510	645521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13351	NC_007613	TTG	2	6	646733	646738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13352	NC_007613	T	7	7	646782	646788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13353	NC_007613	TGG	2	6	646823	646828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13354	NC_007613	TGA	2	6	646848	646853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13355	NC_007613	TTA	2	6	646861	646866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13356	NC_007613	AGCG	2	8	646900	646907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13357	NC_007613	CCA	2	6	646948	646953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13358	NC_007613	ACC	2	6	646954	646959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13359	NC_007613	GGT	2	6	647020	647025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13360	NC_007613	CAG	2	6	647046	647051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13361	NC_007613	TGA	2	6	647153	647158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13362	NC_007613	GAT	2	6	647208	647213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_007613	ATGA	2	8	647249	647256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13364	NC_007613	T	7	7	647262	647268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13365	NC_007613	TCAT	2	8	647310	647317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13366	NC_007613	GGT	2	6	647349	647354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13367	NC_007613	TTG	2	6	647355	647360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13368	NC_007613	TA	3	6	647382	647387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13369	NC_007613	T	7	7	647408	647414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13493	NC_007613	CCG	2	6	654904	654909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13494	NC_007613	CTG	2	6	655110	655115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13495	NC_007613	AAC	2	6	655172	655177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13496	NC_007613	ATT	2	6	655199	655204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_007613	GCT	2	6	655245	655250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_007613	GCT	2	6	655349	655354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13499	NC_007613	GAT	2	6	655390	655395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543203
13500	NC_007613	GCTGAT	2	12	655565	655576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82543203

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