MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007613	CGA	2	6	603908	603913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12502	NC_007613	A	6	6	603951	603956	100 %	0 %	0 %	0 %	82543153
12503	NC_007613	CTT	2	6	604385	604390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543153
12504	NC_007613	CGC	2	6	604438	604443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543153
12505	NC_007613	GAA	2	6	604500	604505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543153
12506	NC_007613	GGT	2	6	604601	604606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543153
12507	NC_007613	TG	3	6	604651	604656	0 %	50 %	50 %	0 %	82543153
12508	NC_007613	TGC	2	6	604669	604674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12509	NC_007613	CTC	2	6	604706	604711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543153
12510	NC_007613	CG	3	6	604712	604717	0 %	0 %	50 %	50 %	82543153
12511	NC_007613	TGC	2	6	604798	604803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12512	NC_007613	GTC	2	6	604804	604809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12513	NC_007613	CGT	2	6	604827	604832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12514	NC_007613	CTG	2	6	604860	604865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12515	NC_007613	GAA	2	6	604893	604898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543153
12516	NC_007613	GCCA	2	8	604919	604926	25 %	0 %	25 %	50 %	82543153
12517	NC_007613	CGA	2	6	604937	604942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12518	NC_007613	TTA	2	6	604991	604996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543153
12519	NC_007613	CTG	2	6	605001	605006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12520	NC_007613	CGT	2	6	605013	605018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12521	NC_007613	GCA	2	6	605099	605104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543153
12522	NC_007613	CAGC	2	8	605171	605178	25 %	0 %	25 %	50 %	82543153
12523	NC_007613	GCC	2	6	605227	605232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543153
12524	NC_007613	CGG	2	6	605248	605253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543153
12525	NC_007613	CAA	2	6	605283	605288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543153
12526	NC_007613	AATA	2	8	605317	605324	75 %	25 %	0 %	0 %	82543153
12527	NC_007613	CCTG	2	8	605365	605372	0 %	25 %	25 %	50 %	82543154
12528	NC_007613	A	6	6	605408	605413	100 %	0 %	0 %	0 %	82543154
12529	NC_007613	TGA	2	6	605434	605439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543154
12530	NC_007613	CAG	2	6	605490	605495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543154
12531	NC_007613	CAG	2	6	605639	605644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543154
12532	NC_007613	AAC	2	6	605663	605668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543154
12533	NC_007613	GCTG	2	8	605698	605705	0 %	25 %	50 %	25 %	82543154
12534	NC_007613	GTGG	2	8	605744	605751	0 %	25 %	75 %	0 %	82543154
12535	NC_007613	GCT	2	6	605822	605827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543154
12536	NC_007613	CGG	2	6	605829	605834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543154
12537	NC_007613	CTG	2	6	605909	605914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543154
12538	NC_007613	GGT	2	6	606058	606063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543154
12539	NC_007613	CGC	2	6	606159	606164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543154
12540	NC_007613	GAA	2	6	606223	606228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543154
12541	NC_007613	GGT	2	6	606287	606292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543154
12542	NC_007613	TCACCA	2	12	606297	606308	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	82543154
12543	NC_007613	GGT	2	6	606311	606316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543154
12544	NC_007613	GT	3	6	606315	606320	0 %	50 %	50 %	0 %	82543154
12545	NC_007613	ATC	2	6	606344	606349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543154
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12548	NC_007613	CTG	3	9	606536	606544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543154
12549	NC_007613	GTA	2	6	606550	606555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543154
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12551	NC_007613	TAC	2	6	606903	606908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543155
12552	NC_007613	CG	3	6	606911	606916	0 %	0 %	50 %	50 %	82543155
12553	NC_007613	AGA	2	6	606921	606926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543155
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12555	NC_007613	GCGG	2	8	606997	607004	0 %	0 %	75 %	25 %	82543155
12556	NC_007613	AGA	2	6	607026	607031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543155
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12558	NC_007613	CGT	2	6	607183	607188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543155
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12563	NC_007613	GAACT	2	10	607573	607582	40 %	20 %	20 %	20 %	82543155
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12571	NC_007613	ATC	2	6	607822	607827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543155
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12580	NC_007613	TAC	2	6	608129	608134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543156
12581	NC_007613	CGTG	2	8	608162	608169	0 %	25 %	50 %	25 %	82543156
12582	NC_007613	TGC	2	6	608177	608182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543156
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12585	NC_007613	CGG	2	6	608624	608629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543156
12586	NC_007613	GAA	3	9	608637	608645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543156
12587	NC_007613	GCT	2	6	608784	608789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543156
12588	NC_007613	AAAT	2	8	608859	608866	75 %	25 %	0 %	0 %	82543156
12589	NC_007613	TAA	2	6	608872	608877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12590	NC_007613	CGC	2	6	608889	608894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12591	NC_007613	ATG	2	6	608949	608954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_007613	T	6	6	608958	608963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_007613	GAT	2	6	608975	608980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543157
12594	NC_007613	CGAT	2	8	609167	609174	25 %	25 %	25 %	25 %	82543157
12595	NC_007613	TCT	2	6	609180	609185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543157
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12599	NC_007613	TTGC	2	8	609289	609296	0 %	50 %	25 %	25 %	82543157
12600	NC_007613	CA	3	6	609320	609325	50 %	0 %	0 %	50 %	82543157
12601	NC_007613	GAA	2	6	609357	609362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543157
12602	NC_007613	TG	3	6	609402	609407	0 %	50 %	50 %	0 %	82543157
12603	NC_007613	TCA	2	6	609434	609439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543157
12604	NC_007613	CTT	2	6	609477	609482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543157
12605	NC_007613	CTG	2	6	609520	609525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543157
12606	NC_007613	AAT	2	6	609747	609752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_007613	ATACA	2	10	609757	609766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12608	NC_007613	AAT	2	6	609767	609772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_007613	TCAA	2	8	609774	609781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12610	NC_007613	ATG	2	6	609856	609861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543158
12611	NC_007613	GAC	2	6	609867	609872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543158
12612	NC_007613	TGCGT	2	10	609888	609897	0 %	40 %	40 %	20 %	82543158
12613	NC_007613	GC	3	6	609904	609909	0 %	0 %	50 %	50 %	82543158
12614	NC_007613	TGC	2	6	609954	609959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543158
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12617	NC_007613	GCG	2	6	610084	610089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543158
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12619	NC_007613	CTG	2	6	610165	610170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543158
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12621	NC_007613	TATGCA	2	12	610197	610208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82543158
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12745	NC_007613	CTG	3	9	617245	617253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543160
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12992	NC_007613	TGA	2	6	627541	627546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543172
12993	NC_007613	TTCA	2	8	627567	627574	25 %	50 %	0 %	25 %	82543172
12994	NC_007613	TGG	2	6	627617	627622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543172
12995	NC_007613	CAA	2	6	627669	627674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543172
12996	NC_007613	TCA	2	6	627716	627721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543172
12997	NC_007613	CCAT	2	8	627737	627744	25 %	25 %	0 %	50 %	82543172
12998	NC_007613	ACG	2	6	627792	627797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543172
12999	NC_007613	TTCAG	2	10	627799	627808	20 %	40 %	20 %	20 %	82543172
13000	NC_007613	ATTC	2	8	627842	627849	25 %	50 %	0 %	25 %	82543172

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