MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007613	AGA	2	6	557193	557198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543115
11502	NC_007613	ACG	2	6	557225	557230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543115
11503	NC_007613	CTGGT	2	10	557250	557259	0 %	40 %	40 %	20 %	82543115
11504	NC_007613	CTC	2	6	557271	557276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543115
11505	NC_007613	ATT	2	6	557279	557284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543115
11506	NC_007613	TGA	2	6	557340	557345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543115
11507	NC_007613	A	6	6	557450	557455	100 %	0 %	0 %	0 %	82543115
11508	NC_007613	GGT	2	6	557464	557469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543115
11509	NC_007613	GAA	2	6	557473	557478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543115
11510	NC_007613	GCCT	2	8	557485	557492	0 %	25 %	25 %	50 %	82543115
11511	NC_007613	ACC	2	6	557570	557575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543115
11512	NC_007613	CAA	2	6	557583	557588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543115
11513	NC_007613	GTG	2	6	557589	557594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543115
11514	NC_007613	CT	3	6	557655	557660	0 %	50 %	0 %	50 %	82543115
11515	NC_007613	ACA	2	6	557711	557716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543115
11516	NC_007613	CTG	2	6	557800	557805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543115
11517	NC_007613	CGT	3	9	557866	557874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543115
11518	NC_007613	CTG	2	6	557882	557887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543115
11519	NC_007613	CAGG	2	8	557925	557932	25 %	0 %	50 %	25 %	82543115
11520	NC_007613	ACA	2	6	557933	557938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543115
11521	NC_007613	CG	3	6	557996	558001	0 %	0 %	50 %	50 %	82543115
11522	NC_007613	GGCGAA	2	12	558049	558060	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	82543115
11523	NC_007613	GCC	2	6	558104	558109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543115
11524	NC_007613	GATC	2	8	558135	558142	25 %	25 %	25 %	25 %	82543115
11525	NC_007613	GAA	2	6	558157	558162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543115
11526	NC_007613	AAG	2	6	558197	558202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543115
11527	NC_007613	CAC	2	6	558267	558272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543115
11528	NC_007613	TCT	2	6	558275	558280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543115
11529	NC_007613	TGC	2	6	558423	558428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543115
11530	NC_007613	GAT	2	6	558430	558435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543115
11531	NC_007613	GCC	2	6	558560	558565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543115
11532	NC_007613	AATA	2	8	558686	558693	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_007613	AT	3	6	558760	558765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_007613	CGC	2	6	558804	558809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_007613	CGC	2	6	558840	558845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_007613	GCG	2	6	558851	558856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_007613	T	6	6	558857	558862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_007613	TTC	2	6	558869	558874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_007613	AATT	2	8	558878	558885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_007613	ATAAA	2	10	558904	558913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_007613	TAAA	2	8	558935	558942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_007613	TTC	2	6	558982	558987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_007613	ATC	2	6	559028	559033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_007613	TCGCG	2	10	559091	559100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11545	NC_007613	T	6	6	559147	559152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_007613	ATTTTT	2	12	559154	559165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_007613	T	7	7	559161	559167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_007613	GCA	2	6	559185	559190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_007613	GTA	2	6	559239	559244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_007613	CGCTGG	2	12	559245	559256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_007613	CGA	2	6	559324	559329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_007613	CGG	2	6	559342	559347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_007613	TA	3	6	559348	559353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_007613	AACC	2	8	559408	559415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_007613	TGC	2	6	559462	559467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_007613	CGAA	2	8	559539	559546	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11557	NC_007613	TAA	2	6	559565	559570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_007613	ACC	2	6	559860	559865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11559	NC_007613	ACC	2	6	560013	560018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11560	NC_007613	GGC	2	6	560120	560125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_007613	CAG	2	6	560175	560180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_007613	TCC	2	6	560217	560222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11563	NC_007613	GCC	2	6	560227	560232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_007613	TGG	2	6	560241	560246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_007613	TCT	2	6	560287	560292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_007613	TAC	2	6	560406	560411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_007613	GGT	2	6	560550	560555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_007613	CGTGA	2	10	560580	560589	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11569	NC_007613	TCT	2	6	560617	560622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_007613	TGCC	2	8	560646	560653	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_007613	A	6	6	560677	560682	100 %	0 %	0 %	0 %	82543116
11572	NC_007613	GTC	2	6	560753	560758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543116
11573	NC_007613	A	6	6	560807	560812	100 %	0 %	0 %	0 %	82543116
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11578	NC_007613	A	6	6	561041	561046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_007613	GGCT	2	8	561078	561085	0 %	25 %	50 %	25 %	82543117
11580	NC_007613	ATC	2	6	561217	561222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543117
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11582	NC_007613	CGT	2	6	561339	561344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543117
11583	NC_007613	TTC	2	6	561385	561390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543117
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11585	NC_007613	CTTT	2	8	561501	561508	0 %	75 %	0 %	25 %	82543117
11586	NC_007613	AGA	2	6	561569	561574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_007613	TAA	2	6	561662	561667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_007613	ACA	2	6	561731	561736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_007613	ATT	2	6	561760	561765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_007613	CGC	2	6	561808	561813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_007613	TCG	2	6	561836	561841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543118
11592	NC_007613	TCG	2	6	561914	561919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543118
11593	NC_007613	GTC	2	6	561940	561945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543118
11594	NC_007613	CG	3	6	562014	562019	0 %	0 %	50 %	50 %	82543118
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11596	NC_007613	CAC	2	6	562083	562088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543118
11597	NC_007613	AATC	2	8	562119	562126	50 %	25 %	0 %	25 %	82543118
11598	NC_007613	GAA	2	6	562141	562146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543118
11599	NC_007613	CAG	3	9	562195	562203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543118
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11601	NC_007613	TGC	2	6	562230	562235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543118
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11603	NC_007613	TGC	2	6	562524	562529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543119
11604	NC_007613	TTA	2	6	562671	562676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543119
11605	NC_007613	CG	3	6	562693	562698	0 %	0 %	50 %	50 %	82543119
11606	NC_007613	GTC	2	6	562717	562722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543119
11607	NC_007613	GGAT	2	8	562828	562835	25 %	25 %	50 %	0 %	82543119
11608	NC_007613	GC	3	6	562837	562842	0 %	0 %	50 %	50 %	82543119
11609	NC_007613	ATA	2	6	562844	562849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543119
11610	NC_007613	CG	3	6	562880	562885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11611	NC_007613	ATC	2	6	563040	563045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543120
11612	NC_007613	GCC	2	6	563076	563081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543120
11613	NC_007613	CAGGG	2	10	563091	563100	20 %	0 %	60 %	20 %	82543120
11614	NC_007613	CAA	2	6	563186	563191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543120
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11616	NC_007613	ATT	2	6	563242	563247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543120
11617	NC_007613	GCT	3	9	563248	563256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543120
11618	NC_007613	TCA	2	6	563311	563316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543120
11619	NC_007613	ATCG	2	8	563349	563356	25 %	25 %	25 %	25 %	82543120
11620	NC_007613	CCA	2	6	563357	563362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543120
11621	NC_007613	CAA	2	6	563471	563476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543120
11622	NC_007613	CT	3	6	563511	563516	0 %	50 %	0 %	50 %	82543120
11623	NC_007613	GAT	2	6	563550	563555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543120
11624	NC_007613	ATT	2	6	563640	563645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543120
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