MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_007613	TGC	2	6	534383	534388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543095
11003	NC_007613	ACC	3	9	534452	534460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543095
11004	NC_007613	T	6	6	534469	534474	0 %	100 %	0 %	0 %	82543095
11005	NC_007613	ACCAT	2	10	534511	534520	40 %	20 %	0 %	40 %	82543095
11006	NC_007613	CTT	2	6	534556	534561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543096
11007	NC_007613	CAA	2	6	534576	534581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543096
11008	NC_007613	TAA	2	6	534596	534601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543096
11009	NC_007613	ATC	2	6	534628	534633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543096
11010	NC_007613	GAA	2	6	534678	534683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543096
11011	NC_007613	TGAG	2	8	534739	534746	25 %	25 %	50 %	0 %	82543096
11012	NC_007613	CG	3	6	534762	534767	0 %	0 %	50 %	50 %	82543096
11013	NC_007613	AAT	2	6	534783	534788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543096
11014	NC_007613	GCG	2	6	534829	534834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543096
11015	NC_007613	TAG	2	6	534886	534891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543096
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11017	NC_007613	T	6	6	534943	534948	0 %	100 %	0 %	0 %	82543096
11018	NC_007613	AGGGA	2	10	535183	535192	40 %	0 %	60 %	0 %	82543096
11019	NC_007613	ATT	2	6	535219	535224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82543096
11020	NC_007613	C	6	6	535227	535232	0 %	0 %	0 %	100 %	82543097
11021	NC_007613	CAGG	2	8	535240	535247	25 %	0 %	50 %	25 %	82543097
11022	NC_007613	GCC	2	6	535374	535379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543097
11023	NC_007613	CCA	2	6	535384	535389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543097
11024	NC_007613	TCA	2	6	535429	535434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543097
11025	NC_007613	CGG	2	6	535448	535453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543097
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11028	NC_007613	GGC	2	6	535562	535567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543097
11029	NC_007613	GCG	2	6	535590	535595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543097
11030	NC_007613	GA	3	6	535776	535781	50 %	0 %	50 %	0 %	82543097
11031	NC_007613	CGA	2	6	535822	535827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543097
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11033	NC_007613	GGT	2	6	535901	535906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543097
11034	NC_007613	TTG	2	6	535922	535927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543097
11035	NC_007613	A	7	7	535929	535935	100 %	0 %	0 %	0 %	82543097
11036	NC_007613	A	6	6	535974	535979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_007613	AGC	2	6	535986	535991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_007613	CGG	2	6	536211	536216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543098
11039	NC_007613	CATC	2	8	536288	536295	25 %	25 %	0 %	50 %	82543098
11040	NC_007613	ATC	2	6	536313	536318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543098
11041	NC_007613	CGA	2	6	536363	536368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543098
11042	NC_007613	TTC	2	6	536386	536391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543098
11043	NC_007613	CAG	2	6	536412	536417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543098
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11045	NC_007613	CAT	2	6	536427	536432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543098
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11048	NC_007613	TTCA	2	8	536520	536527	25 %	50 %	0 %	25 %	82543098
11049	NC_007613	TTG	2	6	536530	536535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543098
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11053	NC_007613	GCC	2	6	536665	536670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543098
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11056	NC_007613	GCA	2	6	536732	536737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543098
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11065	NC_007613	TGT	2	6	537096	537101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_007613	TTGT	2	8	537184	537191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_007613	TGG	2	6	537265	537270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_007613	TAAA	2	8	537313	537320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_007613	A	6	6	537335	537340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_007613	ATTA	2	8	537354	537361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_007613	GAT	2	6	537433	537438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11073	NC_007613	AGT	2	6	537706	537711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543099
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11089	NC_007613	A	7	7	538274	538280	100 %	0 %	0 %	0 %	82543099
11090	NC_007613	GCA	2	6	538281	538286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543099
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11096	NC_007613	AGTC	2	8	538514	538521	25 %	25 %	25 %	25 %	82543099
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11110	NC_007613	TCCT	2	8	539316	539323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11111	NC_007613	GTG	2	6	539341	539346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_007613	A	6	6	539544	539549	100 %	0 %	0 %	0 %	82543100
11113	NC_007613	GTGAT	2	10	539590	539599	20 %	40 %	40 %	0 %	82543100
11114	NC_007613	GCTG	2	8	539656	539663	0 %	25 %	50 %	25 %	82543100
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11123	NC_007613	ATT	2	6	540096	540101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11346	NC_007613	TGA	2	6	550222	550227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11348	NC_007613	AT	3	6	550358	550363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11349	NC_007613	TCA	2	6	550418	550423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11364	NC_007613	ACA	2	6	551227	551232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11365	NC_007613	ACC	2	6	551356	551361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543111
11366	NC_007613	AGC	2	6	551422	551427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543111
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11368	NC_007613	GAC	2	6	551516	551521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543111
11369	NC_007613	GTC	2	6	551595	551600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543111
11370	NC_007613	GTT	2	6	551648	551653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543111
11371	NC_007613	GGC	2	6	551667	551672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543111
11372	NC_007613	AGT	2	6	551861	551866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543111
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11374	NC_007613	TTC	2	6	551925	551930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543111
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11377	NC_007613	TGC	2	6	552155	552160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543111
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11380	NC_007613	GAC	2	6	552191	552196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543111
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11382	NC_007613	CTG	2	6	552273	552278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543111
11383	NC_007613	CTT	2	6	552284	552289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543111
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11388	NC_007613	CA	3	6	552734	552739	50 %	0 %	0 %	50 %	82543112
11389	NC_007613	GTA	2	6	552752	552757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543112
11390	NC_007613	CTG	2	6	552799	552804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543112
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11394	NC_007613	CG	3	6	553007	553012	0 %	0 %	50 %	50 %	82543112
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11398	NC_007613	T	7	7	553214	553220	0 %	100 %	0 %	0 %	82543112
11399	NC_007613	TCA	2	6	553312	553317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543112
11400	NC_007613	TGG	2	6	553327	553332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543112
11401	NC_007613	TAGT	2	8	553350	553357	25 %	50 %	25 %	0 %	82543112
11402	NC_007613	CGC	3	9	553438	553446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543112
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11404	NC_007613	GTT	2	6	553504	553509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543112
11405	NC_007613	GGC	2	6	553518	553523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543112
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11408	NC_007613	A	6	6	553650	553655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11409	NC_007613	CAGGG	2	10	553676	553685	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11410	NC_007613	TGG	2	6	553761	553766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543113
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11427	NC_007613	T	6	6	554588	554593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11428	NC_007613	TGA	2	6	554636	554641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11429	NC_007613	CA	3	6	554707	554712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11430	NC_007613	GAT	2	6	554723	554728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11431	NC_007613	GCA	2	6	554766	554771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11433	NC_007613	TGC	2	6	554884	554889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
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11458	NC_007613	CTG	2	6	555747	555752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
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11461	NC_007613	CCAG	2	8	555823	555830	25 %	0 %	25 %	50 %	82543114
11462	NC_007613	TGC	2	6	555841	555846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
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11469	NC_007613	TGC	2	6	556016	556021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
11470	NC_007613	GGC	2	6	556026	556031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543114
11471	NC_007613	ACGAT	2	10	556105	556114	40 %	20 %	20 %	20 %	82543114
11472	NC_007613	AACA	2	8	556152	556159	75 %	0 %	0 %	25 %	82543114
11473	NC_007613	TTG	2	6	556174	556179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543114
11474	NC_007613	GCGAT	2	10	556201	556210	20 %	20 %	40 %	20 %	82543114
11475	NC_007613	GAA	2	6	556211	556216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543114
11476	NC_007613	TATC	2	8	556312	556319	25 %	50 %	0 %	25 %	82543114
11477	NC_007613	GGTG	2	8	556397	556404	0 %	25 %	75 %	0 %	82543114
11478	NC_007613	TCG	2	6	556435	556440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
11479	NC_007613	ACCA	2	8	556479	556486	50 %	0 %	0 %	50 %	82543114
11480	NC_007613	TCG	2	6	556522	556527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543114
11481	NC_007613	TGG	2	6	556579	556584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543114
11482	NC_007613	GAT	2	6	556661	556666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543114
11483	NC_007613	GGT	2	6	556673	556678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543114
11484	NC_007613	GCA	2	6	556681	556686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543114
11485	NC_007613	CGA	2	6	556691	556696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543114
11486	NC_007613	TGT	2	6	556730	556735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543114
11487	NC_007613	CAA	2	6	556811	556816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11488	NC_007613	TCT	2	6	556833	556838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_007613	T	9	9	556846	556854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11490	NC_007613	ATCA	2	8	556856	556863	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11491	NC_007613	A	6	6	556895	556900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11492	NC_007613	GTT	2	6	556949	556954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_007613	TGAG	2	8	556976	556983	25 %	25 %	50 %	0 %	82543115
11494	NC_007613	GCCC	2	8	556990	556997	0 %	0 %	25 %	75 %	82543115
11495	NC_007613	ATC	2	6	557017	557022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543115
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11498	NC_007613	CCG	2	6	557071	557076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543115
11499	NC_007613	ATCT	2	8	557112	557119	25 %	50 %	0 %	25 %	82543115
11500	NC_007613	CGA	2	6	557172	557177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543115

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