MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007613	CCA	2	6	486430	486435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_007613	TTG	2	6	486447	486452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_007613	GCT	2	6	486490	486495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_007613	CAAC	2	8	486524	486531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_007613	TGT	2	6	486677	486682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543050
10006	NC_007613	TCAGAT	2	12	486684	486695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82543050
10007	NC_007613	GCCA	2	8	486771	486778	25 %	0 %	25 %	50 %	82543050
10008	NC_007613	CAG	2	6	486811	486816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543050
10009	NC_007613	AGA	2	6	486821	486826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543050
10010	NC_007613	TCC	2	6	486876	486881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82543050
10011	NC_007613	CAGC	2	8	486904	486911	25 %	0 %	25 %	50 %	82543050
10012	NC_007613	ATCAC	2	10	486968	486977	40 %	20 %	0 %	40 %	82543050
10013	NC_007613	T	6	6	487018	487023	0 %	100 %	0 %	0 %	82543050
10014	NC_007613	CAC	2	6	487221	487226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_007613	AGGA	2	8	487244	487251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_007613	ATGGAA	2	12	487258	487269	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_007613	CAT	2	6	487294	487299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_007613	GCA	2	6	487319	487324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_007613	GC	3	6	487346	487351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_007613	GCGA	2	8	487428	487435	25 %	0 %	50 %	25 %	161984973
10021	NC_007613	TGC	2	6	487498	487503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10022	NC_007613	CT	3	6	487565	487570	0 %	50 %	0 %	50 %	161984973
10023	NC_007613	CCG	2	6	487599	487604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984973
10024	NC_007613	TTC	2	6	487607	487612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984973
10025	NC_007613	CCACT	2	10	487684	487693	20 %	20 %	0 %	60 %	161984973
10026	NC_007613	GAC	2	6	487697	487702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10027	NC_007613	GCG	2	6	487720	487725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984973
10028	NC_007613	GCC	2	6	487771	487776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984973
10029	NC_007613	CAGTG	2	10	487790	487799	20 %	20 %	40 %	20 %	161984973
10030	NC_007613	CAG	2	6	487811	487816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10031	NC_007613	TC	4	8	487840	487847	0 %	50 %	0 %	50 %	161984973
10032	NC_007613	CAG	2	6	487856	487861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10033	NC_007613	CTTT	2	8	487895	487902	0 %	75 %	0 %	25 %	161984973
10034	NC_007613	CAG	2	6	487944	487949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10035	NC_007613	AGC	2	6	488045	488050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10036	NC_007613	CGA	2	6	488060	488065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10037	NC_007613	ATC	2	6	488122	488127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984973
10038	NC_007613	GAC	2	6	488133	488138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984973
10039	NC_007613	GCG	2	6	488140	488145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984973
10040	NC_007613	CCAT	2	8	488147	488154	25 %	25 %	0 %	50 %	161984973
10041	NC_007613	T	6	6	488269	488274	0 %	100 %	0 %	0 %	82543052
10042	NC_007613	CTT	2	6	488294	488299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543052
10043	NC_007613	GAG	2	6	488301	488306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543052
10044	NC_007613	GGC	2	6	488364	488369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543052
10045	NC_007613	AAC	2	6	488388	488393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543052
10046	NC_007613	CGG	2	6	488402	488407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543052
10047	NC_007613	CAG	2	6	488411	488416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543052
10048	NC_007613	CTTC	2	8	488422	488429	0 %	50 %	0 %	50 %	82543052
10049	NC_007613	CTGG	2	8	488457	488464	0 %	25 %	50 %	25 %	82543052
10050	NC_007613	CTG	2	6	488520	488525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543052
10051	NC_007613	TG	3	6	488545	488550	0 %	50 %	50 %	0 %	82543052
10052	NC_007613	ATCA	2	8	488583	488590	50 %	25 %	0 %	25 %	82543052
10053	NC_007613	CTG	2	6	488688	488693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_007613	T	6	6	488757	488762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_007613	GAG	2	6	488769	488774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_007613	GT	3	6	488843	488848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_007613	TCC	2	6	488964	488969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_007613	TGA	2	6	488987	488992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_007613	T	6	6	489082	489087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_007613	TCAG	2	8	489106	489113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_007613	GTT	2	6	489212	489217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_007613	GCAG	2	8	489245	489252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10063	NC_007613	CGC	2	6	489322	489327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_007613	GGA	2	6	489451	489456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_007613	TCT	4	12	489567	489578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543053
10066	NC_007613	ACTTT	2	10	489588	489597	20 %	60 %	0 %	20 %	82543053
10067	NC_007613	CCGA	2	8	489605	489612	25 %	0 %	25 %	50 %	82543053
10068	NC_007613	GAA	2	6	489638	489643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543053
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10070	NC_007613	GAT	2	6	489748	489753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543053
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10072	NC_007613	GTT	2	6	489833	489838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82543053
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10074	NC_007613	CTG	2	6	489905	489910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543053
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10078	NC_007613	TTC	2	6	490087	490092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_007613	TGC	2	6	490096	490101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10081	NC_007613	ATG	2	6	490127	490132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_007613	ATG	3	9	490168	490176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543054
10083	NC_007613	ACTCA	2	10	490219	490228	40 %	20 %	0 %	40 %	82543054
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10089	NC_007613	GTG	2	6	490600	490605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82543054
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10093	NC_007613	TCG	2	6	490847	490852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543054
10094	NC_007613	CCGGC	2	10	490856	490865	0 %	0 %	40 %	60 %	82543054
10095	NC_007613	GCA	2	6	490876	490881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543054
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10111	NC_007613	AAG	3	9	491762	491770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543054
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10113	NC_007613	T	6	6	491818	491823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_007613	CAGG	2	8	491854	491861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_007613	TGGCG	2	10	491910	491919	0 %	20 %	60 %	20 %	82543055
10116	NC_007613	ACA	2	6	491987	491992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82543055
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10119	NC_007613	TTC	2	6	492109	492114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543055
10120	NC_007613	ACG	2	6	492142	492147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543055
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10123	NC_007613	AT	3	6	492418	492423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_007613	GACT	2	8	492498	492505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10352	NC_007613	GCG	2	6	504076	504081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10353	NC_007613	GGT	2	6	504195	504200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10356	NC_007613	AT	3	6	504336	504341	50 %	50 %	0 %	0 %	82543067
10357	NC_007613	TCAG	2	8	504359	504366	25 %	25 %	25 %	25 %	82543067
10358	NC_007613	ATG	2	6	504400	504405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543067
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10361	NC_007613	GCCA	2	8	504670	504677	25 %	0 %	25 %	50 %	82543067
10362	NC_007613	TGA	2	6	504687	504692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543067
10363	NC_007613	GCC	2	6	504878	504883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543067
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10365	NC_007613	GGA	2	6	504964	504969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10366	NC_007613	GCT	3	9	505008	505016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543068
10367	NC_007613	ACCAA	2	10	505056	505065	60 %	0 %	0 %	40 %	82543068
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10494	NC_007613	CCA	2	6	509918	509923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543074
10495	NC_007613	CTT	2	6	509957	509962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82543074
10496	NC_007613	CAG	2	6	509973	509978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82543074
10497	NC_007613	T	6	6	510149	510154	0 %	100 %	0 %	0 %	82543074
10498	NC_007613	TCA	2	6	510208	510213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543074
10499	NC_007613	CGG	2	6	510337	510342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543074
10500	NC_007613	AGG	2	6	510410	510415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82543074

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