MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_007613	GCC	2	6	439379	439384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543012
9002	NC_007613	GAA	2	6	439411	439416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82543012
9003	NC_007613	CAT	2	6	439570	439575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543012
9004	NC_007613	ACC	2	6	439757	439762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82543012
9005	NC_007613	GCC	2	6	439789	439794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82543012
9006	NC_007613	CACG	2	8	439909	439916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_007613	GGC	2	6	439955	439960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_007613	CCAG	2	8	440025	440032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9009	NC_007613	ACG	2	6	440044	440049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_007613	GCA	2	6	440066	440071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_007613	TAA	2	6	440122	440127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_007613	T	6	6	440137	440142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_007613	GCC	2	6	440146	440151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9014	NC_007613	GCC	2	6	440306	440311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_007613	TGC	2	6	440375	440380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_007613	CG	3	6	440450	440455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9017	NC_007613	GGC	2	6	440488	440493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9018	NC_007613	ATC	2	6	440600	440605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_007613	ATC	2	6	440632	440637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_007613	AAT	2	6	440647	440652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_007613	CAT	2	6	440674	440679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9022	NC_007613	TGA	2	6	440684	440689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_007613	TCG	2	6	440696	440701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9024	NC_007613	CGC	2	6	440734	440739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9025	NC_007613	CAGC	2	8	440745	440752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9026	NC_007613	CCG	2	6	440756	440761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9027	NC_007613	AAAT	2	8	440775	440782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_007613	GCT	2	6	440785	440790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_007613	GAG	2	6	440864	440869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_007613	TCG	2	6	440885	440890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_007613	CCG	2	6	440898	440903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9032	NC_007613	CCA	2	6	440925	440930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_007613	GCGA	2	8	441064	441071	25 %	0 %	50 %	25 %	161984974
9034	NC_007613	TGC	2	6	441134	441139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984974
9035	NC_007613	CT	3	6	441201	441206	0 %	50 %	0 %	50 %	161984974
9036	NC_007613	CCG	2	6	441235	441240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984974
9037	NC_007613	TTC	2	6	441243	441248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984974
9038	NC_007613	CCACT	2	10	441320	441329	20 %	20 %	0 %	60 %	161984974
9039	NC_007613	GAC	2	6	441333	441338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984974
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9041	NC_007613	GCC	2	6	441407	441412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984974
9042	NC_007613	CAGTG	2	10	441426	441435	20 %	20 %	40 %	20 %	161984974
9043	NC_007613	CAG	2	6	441447	441452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984974
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9045	NC_007613	CAG	2	6	441492	441497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984974
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9047	NC_007613	CAG	2	6	441580	441585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984974
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9053	NC_007613	CCAT	2	8	441783	441790	25 %	25 %	0 %	50 %	161984974
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9062	NC_007613	CTGG	2	8	442093	442100	0 %	25 %	50 %	25 %	82543014
9063	NC_007613	CTG	2	6	442156	442161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543014
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9065	NC_007613	ATCA	2	8	442219	442226	50 %	25 %	0 %	25 %	82543014
9066	NC_007613	GCC	2	6	442400	442405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9068	NC_007613	CTGC	2	8	442462	442469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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9072	NC_007613	CAT	2	6	442673	442678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9079	NC_007613	GGCGT	2	10	442929	442938	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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9082	NC_007613	CAT	2	6	443000	443005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9093	NC_007613	CAGC	2	8	443462	443469	25 %	0 %	25 %	50 %	82543015
9094	NC_007613	ATCAC	2	10	443526	443535	40 %	20 %	0 %	40 %	82543015
9095	NC_007613	T	6	6	443576	443581	0 %	100 %	0 %	0 %	82543015
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9097	NC_007613	AGGA	2	8	443802	443809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_007613	ATGGAA	2	12	443816	443827	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9103	NC_007613	TA	3	6	444056	444061	50 %	50 %	0 %	0 %	82543016
9104	NC_007613	A	6	6	444080	444085	100 %	0 %	0 %	0 %	82543016
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9107	NC_007613	TTTG	2	8	444241	444248	0 %	75 %	25 %	0 %	82543016
9108	NC_007613	ATC	2	6	444350	444355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543016
9109	NC_007613	T	7	7	444384	444390	0 %	100 %	0 %	0 %	82543016
9110	NC_007613	TGA	2	6	444415	444420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82543016
9111	NC_007613	TCCT	2	8	444476	444483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9112	NC_007613	TAA	2	6	444509	444514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82543017
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9115	NC_007613	AT	3	6	444758	444763	50 %	50 %	0 %	0 %	82543017
9116	NC_007613	A	6	6	444765	444770	100 %	0 %	0 %	0 %	82543017
9117	NC_007613	AAT	2	6	444819	444824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_007613	ACA	2	6	444829	444834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_007613	TTA	2	6	444883	444888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_007613	CAGA	2	8	444912	444919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9121	NC_007613	TGA	2	6	444928	444933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_007613	CGG	2	6	444992	444997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82543018
9123	NC_007613	CAT	2	6	445024	445029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543018
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9125	NC_007613	CTG	2	6	445145	445150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82543018
9126	NC_007613	CA	3	6	445213	445218	50 %	0 %	0 %	50 %	82543018
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9128	NC_007613	GTCTG	2	10	445426	445435	0 %	40 %	40 %	20 %	82543018
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9249	NC_007613	CAA	2	6	451772	451777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9250	NC_007613	A	6	6	451776	451781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9251	NC_007613	AC	3	6	451783	451788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9254	NC_007613	CT	3	6	452103	452108	0 %	50 %	0 %	50 %	82543022
9255	NC_007613	ACT	2	6	452116	452121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82543022
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