MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii Sb227 chromosome

Total Repeats: 91891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
75001	NC_007613	AGA	2	6	3689006	3689011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75002	NC_007613	ACGT	2	8	3689125	3689132	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75003	NC_007613	CAA	2	6	3689133	3689138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75004	NC_007613	CCG	2	6	3689188	3689193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82546034
75005	NC_007613	GCA	2	6	3689210	3689215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75006	NC_007613	TAA	2	6	3689360	3689365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82546034
75007	NC_007613	GCGGA	2	10	3689392	3689401	20 %	0 %	60 %	20 %	82546034
75008	NC_007613	TGC	2	6	3689516	3689521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75009	NC_007613	CCCGGC	2	12	3689552	3689563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82546034
75010	NC_007613	AC	3	6	3689597	3689602	50 %	0 %	0 %	50 %	82546034
75011	NC_007613	GC	4	8	3689640	3689647	0 %	0 %	50 %	50 %	82546034
75012	NC_007613	GGC	2	6	3689648	3689653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546034
75013	NC_007613	GTT	2	6	3689693	3689698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82546034
75014	NC_007613	GGC	2	6	3689706	3689711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546034
75015	NC_007613	CTG	2	6	3689733	3689738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75016	NC_007613	GC	3	6	3689763	3689768	0 %	0 %	50 %	50 %	82546034
75017	NC_007613	AAC	2	6	3689838	3689843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82546034
75018	NC_007613	CTA	2	6	3689864	3689869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82546034
75019	NC_007613	CTG	2	6	3689886	3689891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75020	NC_007613	CGA	2	6	3689894	3689899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75021	NC_007613	T	6	6	3689907	3689912	0 %	100 %	0 %	0 %	82546034
75022	NC_007613	TAA	2	6	3689915	3689920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82546034
75023	NC_007613	CTG	2	6	3689961	3689966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75024	NC_007613	GACT	2	8	3690058	3690065	25 %	25 %	25 %	25 %	82546034
75025	NC_007613	TGA	2	6	3690109	3690114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82546034
75026	NC_007613	CGA	2	6	3690122	3690127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75027	NC_007613	ACGT	2	8	3690187	3690194	25 %	25 %	25 %	25 %	82546034
75028	NC_007613	TGCCAA	2	12	3690224	3690235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	82546034
75029	NC_007613	CGTG	2	8	3690266	3690273	0 %	25 %	50 %	25 %	82546034
75030	NC_007613	AGA	2	6	3690331	3690336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546034
75031	NC_007613	TAC	2	6	3690348	3690353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82546034
75032	NC_007613	GATGGC	2	12	3690416	3690427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	82546034
75033	NC_007613	TGG	2	6	3690479	3690484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82546034
75034	NC_007613	ACG	2	6	3690495	3690500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546034
75035	NC_007613	TGCC	2	8	3690509	3690516	0 %	25 %	25 %	50 %	82546034
75036	NC_007613	AG	3	6	3690539	3690544	50 %	0 %	50 %	0 %	82546034
75037	NC_007613	AGA	2	6	3690557	3690562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546034
75038	NC_007613	TTA	2	6	3690628	3690633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82546035
75039	NC_007613	ACA	2	6	3690642	3690647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82546035
75040	NC_007613	GGT	2	6	3690664	3690669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82546035
75041	NC_007613	CTG	2	6	3690697	3690702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546035
75042	NC_007613	TGG	2	6	3690758	3690763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82546035
75043	NC_007613	CGA	2	6	3690800	3690805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546035
75044	NC_007613	GC	3	6	3690814	3690819	0 %	0 %	50 %	50 %	82546035
75045	NC_007613	GCG	2	6	3690937	3690942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546035
75046	NC_007613	CGA	2	6	3690998	3691003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546035
75047	NC_007613	GAA	2	6	3691093	3691098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546035
75048	NC_007613	CGG	2	6	3691224	3691229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546035
75049	NC_007613	GCA	2	6	3691256	3691261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546035
75050	NC_007613	TGG	2	6	3691307	3691312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82546035
75051	NC_007613	CCG	2	6	3691332	3691337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82546035
75052	NC_007613	GAA	2	6	3691347	3691352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546035
75053	NC_007613	GCTG	2	8	3691372	3691379	0 %	25 %	50 %	25 %	82546035
75054	NC_007613	TC	3	6	3691416	3691421	0 %	50 %	0 %	50 %	82546035
75055	NC_007613	CAA	2	6	3691482	3691487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82546035
75056	NC_007613	GAA	2	6	3691498	3691503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546035
75057	NC_007613	ATG	2	6	3691612	3691617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82546035
75058	NC_007613	GCCA	2	8	3691657	3691664	25 %	0 %	25 %	50 %	82546035
75059	NC_007613	TGT	2	6	3691677	3691682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82546035
75060	NC_007613	TTG	2	6	3691716	3691721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82546036
75061	NC_007613	AGG	2	6	3691894	3691899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82546036
75062	NC_007613	ACAA	2	8	3691963	3691970	75 %	0 %	0 %	25 %	82546036
75063	NC_007613	TTTAC	2	10	3692064	3692073	20 %	60 %	0 %	20 %	82546036
75064	NC_007613	CGG	2	6	3692078	3692083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546036
75065	NC_007613	AGA	2	6	3692094	3692099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546036
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75067	NC_007613	GCG	2	6	3692187	3692192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546036
75068	NC_007613	TGG	2	6	3692251	3692256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82546036
75069	NC_007613	GC	3	6	3692273	3692278	0 %	0 %	50 %	50 %	82546036
75070	NC_007613	GCGG	2	8	3692578	3692585	0 %	0 %	75 %	25 %	82546036
75071	NC_007613	GAT	2	6	3692604	3692609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82546036
75072	NC_007613	TGA	3	9	3692624	3692632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82546036
75073	NC_007613	GCT	2	6	3692642	3692647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546036
75074	NC_007613	CTC	2	6	3692820	3692825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82546037
75075	NC_007613	GTAT	2	8	3692873	3692880	25 %	50 %	25 %	0 %	82546037
75076	NC_007613	CAC	2	6	3692911	3692916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82546037
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75078	NC_007613	CGA	2	6	3692946	3692951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82546037
75079	NC_007613	CTCTGT	2	12	3693003	3693014	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	82546037
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75082	NC_007613	GTA	2	6	3693166	3693171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82546037
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75084	NC_007613	AGA	2	6	3693438	3693443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82546037
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75087	NC_007613	GAACAA	2	12	3693489	3693500	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	82546037
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75089	NC_007613	TCT	2	6	3693521	3693526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82546037
75090	NC_007613	CAA	2	6	3693612	3693617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82546037
75091	NC_007613	CGG	2	6	3693633	3693638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546037
75092	NC_007613	GCG	2	6	3693661	3693666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546037
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75100	NC_007613	CTG	2	6	3693883	3693888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546037
75101	NC_007613	TGC	2	6	3693933	3693938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546037
75102	NC_007613	GCG	2	6	3693952	3693957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546037
75103	NC_007613	CG	4	8	3693961	3693968	0 %	0 %	50 %	50 %	82546037
75104	NC_007613	CCG	2	6	3693978	3693983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82546037
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75106	NC_007613	GGC	2	6	3694087	3694092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82546037
75107	NC_007613	GC	3	6	3694168	3694173	0 %	0 %	50 %	50 %	82546037
75108	NC_007613	CT	3	6	3694186	3694191	0 %	50 %	0 %	50 %	82546037
75109	NC_007613	CAT	4	12	3694278	3694289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82546037
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75112	NC_007613	GCC	2	6	3694395	3694400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82546037
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75116	NC_007613	CGT	2	6	3694597	3694602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82546037
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