MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Shigella boydii Sb227 plasmid pSB4_227

Total Repeats: 2544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007608	TGA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007608	CAGC	2	8	26	33	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_007608	AG	3	6	65	70	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007608	ATCT	2	8	122	129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007608	TCGT	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_007608	GCGA	2	8	244	251	25 %	0 %	50 %	25 %	82524666
7	NC_007608	TGC	2	6	314	319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524666
8	NC_007608	CCG	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524666
9	NC_007608	TTC	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524666
10	NC_007608	CAA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524666
11	NC_007608	GTCA	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	82524665
12	NC_007608	AAT	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524665
13	NC_007608	TTG	2	6	773	778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007608	GCGA	2	8	869	876	25 %	0 %	50 %	25 %	161984778
15	NC_007608	TGC	2	6	939	944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161984778
16	NC_007608	CT	3	6	1006	1011	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
17	NC_007608	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
18	NC_007608	TTC	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161984778
19	NC_007608	CCACT	2	10	1125	1134	20 %	20 %	0 %	60 %	161984778
20	NC_007608	GAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
21	NC_007608	GCG	2	6	1161	1166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
22	NC_007608	GCC	2	6	1212	1217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161984778
23	NC_007608	CAGTG	2	10	1231	1240	20 %	20 %	40 %	20 %	161984778
24	NC_007608	CAG	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
25	NC_007608	TC	4	8	1281	1288	0 %	50 %	0 %	50 %	161984778
26	NC_007608	CAG	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
27	NC_007608	CTTT	2	8	1336	1343	0 %	75 %	0 %	25 %	161984778
28	NC_007608	ACA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161984778
29	NC_007608	AGC	2	6	1486	1491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
30	NC_007608	CGA	2	6	1501	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
31	NC_007608	ATC	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161984778
32	NC_007608	GAC	2	6	1574	1579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161984778
33	NC_007608	GCG	2	6	1581	1586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161984778
34	NC_007608	CCAT	2	8	1588	1595	25 %	25 %	0 %	50 %	161984778
35	NC_007608	T	6	6	1710	1715	0 %	100 %	0 %	0 %	82524668
36	NC_007608	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524668
37	NC_007608	GAG	2	6	1742	1747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524668
38	NC_007608	GGC	2	6	1805	1810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
39	NC_007608	AAC	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524668
40	NC_007608	CGG	2	6	1843	1848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524668
41	NC_007608	CAG	2	6	1852	1857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524668
42	NC_007608	CTTC	2	8	1863	1870	0 %	50 %	0 %	50 %	82524668
43	NC_007608	CTGG	2	8	1898	1905	0 %	25 %	50 %	25 %	82524668
44	NC_007608	CTG	2	6	1961	1966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524668
45	NC_007608	TG	3	6	1986	1991	0 %	50 %	50 %	0 %	82524668
46	NC_007608	ATCA	2	8	2024	2031	50 %	25 %	0 %	25 %	82524668
47	NC_007608	AGC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007608	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007608	GAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007608	TAT	2	6	2297	2302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007608	GTAG	2	8	2303	2310	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007608	AAT	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007608	A	6	6	2357	2362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007608	T	7	7	2411	2417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007608	AAG	2	6	2433	2438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007608	ATG	2	6	2474	2479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007608	AT	3	6	2491	2496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007608	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
59	NC_007608	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
60	NC_007608	TCA	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
61	NC_007608	AGC	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524669
62	NC_007608	T	7	7	2644	2650	0 %	100 %	0 %	0 %	82524669
63	NC_007608	GA	3	6	2653	2658	50 %	0 %	50 %	0 %	82524669
64	NC_007608	ATG	2	6	2677	2682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
65	NC_007608	TCTA	2	8	2684	2691	25 %	50 %	0 %	25 %	82524669
66	NC_007608	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524669
67	NC_007608	A	6	6	2758	2763	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
68	NC_007608	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
69	NC_007608	ATG	3	9	2830	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524669
70	NC_007608	TGC	3	9	2849	2857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
71	NC_007608	A	7	7	2870	2876	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
72	NC_007608	TAA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
73	NC_007608	TCA	2	6	2957	2962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524669
74	NC_007608	ACAA	2	8	2993	3000	75 %	0 %	0 %	25 %	82524669
75	NC_007608	CTG	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
76	NC_007608	TCTT	2	8	3116	3123	0 %	75 %	0 %	25 %	82524669
77	NC_007608	CT	3	6	3134	3139	0 %	50 %	0 %	50 %	82524669
78	NC_007608	T	7	7	3143	3149	0 %	100 %	0 %	0 %	82524669
79	NC_007608	A	7	7	3179	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	82524669
80	NC_007608	CTG	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524669
81	NC_007608	AAG	2	6	3329	3334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524669
82	NC_007608	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524669
83	NC_007608	TAA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524669
84	NC_007608	T	7	7	3427	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007608	TAG	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007608	ATC	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007608	ATA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007608	A	6	6	3515	3520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007608	CAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007608	TAC	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007608	ATT	2	6	3538	3543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007608	TTA	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007608	T	6	6	3589	3594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007608	T	6	6	3637	3642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007608	T	6	6	3656	3661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007608	ATC	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_007608	AATT	2	8	3681	3688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007608	AAAT	2	8	3698	3705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007608	TCT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524670
100	NC_007608	T	6	6	3729	3734	0 %	100 %	0 %	0 %	82524670
101	NC_007608	CAA	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524670
102	NC_007608	CCG	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82524670
103	NC_007608	AGT	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524670
104	NC_007608	CGCT	2	8	3896	3903	0 %	25 %	25 %	50 %	82524670
105	NC_007608	TAC	2	6	3944	3949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
106	NC_007608	GTT	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
107	NC_007608	TAC	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524670
108	NC_007608	TTAT	2	8	4107	4114	25 %	75 %	0 %	0 %	82524670
109	NC_007608	TTGG	2	8	4191	4198	0 %	50 %	50 %	0 %	82524670
110	NC_007608	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524670
111	NC_007608	ATA	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524670
112	NC_007608	A	6	6	4397	4402	100 %	0 %	0 %	0 %	82524670
113	NC_007608	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524670
114	NC_007608	AGG	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007608	CAC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_007608	GCAGAA	2	12	4586	4597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_007608	TTA	2	6	4603	4608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007608	TGC	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007608	GAT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007608	CAC	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_007608	AT	3	6	4788	4793	50 %	50 %	0 %	0 %	82524671
122	NC_007608	T	6	6	4834	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	82524671
123	NC_007608	A	7	7	4843	4849	100 %	0 %	0 %	0 %	82524671
124	NC_007608	CATTG	2	10	4876	4885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_007608	T	6	6	4921	4926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007608	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007608	TGT	2	6	5086	5091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524672
128	NC_007608	TCAGAT	2	12	5093	5104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	82524672
129	NC_007608	GCCA	2	8	5180	5187	25 %	0 %	25 %	50 %	82524672
130	NC_007608	CAG	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524672
131	NC_007608	AGA	2	6	5230	5235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524672
132	NC_007608	TCC	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524672
133	NC_007608	CAGC	2	8	5313	5320	25 %	0 %	25 %	50 %	82524672
134	NC_007608	ATCAC	2	10	5377	5386	40 %	20 %	0 %	40 %	82524672
135	NC_007608	T	6	6	5427	5432	0 %	100 %	0 %	0 %	82524672
136	NC_007608	CAC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007608	AGGA	2	8	5653	5660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007608	ATGGAA	2	12	5667	5678	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007608	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007608	GCA	2	6	5728	5733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007608	TAA	3	9	5769	5777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007608	AAGT	2	8	5782	5789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_007608	TAT	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007608	ATG	2	6	5880	5885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_007608	TCT	2	6	11921	11926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_007608	ATC	2	6	11934	11939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524680
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413	NC_007608	GCCGGA	2	12	17840	17851	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	82524687
414	NC_007608	TAA	2	6	17852	17857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524687
415	NC_007608	CTGTG	2	10	17910	17919	0 %	40 %	40 %	20 %	82524687
416	NC_007608	GCCG	2	8	17930	17937	0 %	0 %	50 %	50 %	82524687
417	NC_007608	TTA	2	6	17973	17978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524687
418	NC_007608	AGC	2	6	18006	18011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524687
419	NC_007608	TGA	2	6	18015	18020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524687
420	NC_007608	CTGG	2	8	18046	18053	0 %	25 %	50 %	25 %	82524688
421	NC_007608	GGCCT	2	10	18089	18098	0 %	20 %	40 %	40 %	82524688
422	NC_007608	CTT	2	6	18302	18307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82524688
423	NC_007608	GAACG	2	10	18336	18345	40 %	0 %	40 %	20 %	82524688
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425	NC_007608	GAA	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
426	NC_007608	TCCG	2	8	18754	18761	0 %	25 %	25 %	50 %	82524691
427	NC_007608	TGC	2	6	18771	18776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524691
428	NC_007608	TGG	2	6	18785	18790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524691
429	NC_007608	GATGT	2	10	18808	18817	20 %	40 %	40 %	0 %	82524691
430	NC_007608	AGC	2	6	18823	18828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524691
431	NC_007608	CAG	2	6	18839	18844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524691
432	NC_007608	TGT	2	6	18971	18976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524691
433	NC_007608	CGT	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_007608	CTG	2	6	19092	19097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524692
435	NC_007608	GAT	2	6	19155	19160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524692
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440	NC_007608	ATC	2	6	19312	19317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524692
441	NC_007608	GGT	2	6	19356	19361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524692
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444	NC_007608	GGC	2	6	19469	19474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82524692
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446	NC_007608	TAT	2	6	19578	19583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524692
447	NC_007608	TGGTG	2	10	19657	19666	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
448	NC_007608	TTGA	2	8	19852	19859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
449	NC_007608	ATGAA	2	10	19880	19889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
450	NC_007608	TAT	2	6	19967	19972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_007608	CAT	2	6	20012	20017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_007608	CAC	2	6	20018	20023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
453	NC_007608	CAAC	2	8	20030	20037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_007608	A	6	6	20041	20046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_007608	TAG	2	6	20075	20080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_007608	TTC	2	6	20089	20094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_007608	ATT	2	6	20136	20141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_007608	ACTA	2	8	20150	20157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
459	NC_007608	ATGA	2	8	20290	20297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
460	NC_007608	TAA	2	6	20313	20318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_007608	TCAG	2	8	20372	20379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
462	NC_007608	TCA	2	6	20426	20431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524693
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474	NC_007608	AT	3	6	21021	21026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_007608	T	7	7	21095	21101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_007608	ATTAC	2	10	21125	21134	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
477	NC_007608	T	7	7	21150	21156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_007608	AATA	2	8	21182	21189	75 %	25 %	0 %	0 %	82524694
479	NC_007608	ACA	2	6	21211	21216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524694
480	NC_007608	TAA	2	6	21229	21234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524694
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499	NC_007608	ATT	2	6	21822	21827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524694
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