MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197 plasmid pSD1_197

Total Repeats: 3823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007607	ACA	3	9	49466	49474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_007607	AT	3	6	49508	49513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_007607	ATAA	2	8	49569	49576	75 %	25 %	0 %	0 %	82524462
1004	NC_007607	T	6	6	49652	49657	0 %	100 %	0 %	0 %	82524462
1005	NC_007607	TC	3	6	49685	49690	0 %	50 %	0 %	50 %	82524462
1006	NC_007607	TGTC	2	8	49703	49710	0 %	50 %	25 %	25 %	82524462
1007	NC_007607	AGT	2	6	49749	49754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524462
1008	NC_007607	ATC	2	6	49768	49773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524462
1009	NC_007607	AGTG	2	8	49811	49818	25 %	25 %	50 %	0 %	82524462
1010	NC_007607	AAG	2	6	49819	49824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524462
1011	NC_007607	ATT	2	6	49848	49853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524462
1012	NC_007607	TTG	2	6	49858	49863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524462
1013	NC_007607	ATT	2	6	49884	49889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524462
1014	NC_007607	AT	3	6	49894	49899	50 %	50 %	0 %	0 %	82524462
1015	NC_007607	AATGA	2	10	49902	49911	60 %	20 %	20 %	0 %	82524462
1016	NC_007607	A	7	7	49924	49930	100 %	0 %	0 %	0 %	82524462
1017	NC_007607	G	6	6	50001	50006	0 %	0 %	100 %	0 %	82524462
1018	NC_007607	ATAAA	2	10	50083	50092	80 %	20 %	0 %	0 %	82524462
1019	NC_007607	A	7	7	50090	50096	100 %	0 %	0 %	0 %	82524462
1020	NC_007607	TGA	2	6	50117	50122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524462
1021	NC_007607	GACA	2	8	50175	50182	50 %	0 %	25 %	25 %	82524462
1022	NC_007607	CAA	2	6	50188	50193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524462
1023	NC_007607	TCC	2	6	50199	50204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524462
1024	NC_007607	TAA	2	6	50219	50224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524462
1025	NC_007607	TTAT	2	8	50242	50249	25 %	75 %	0 %	0 %	82524462
1026	NC_007607	ACT	2	6	50471	50476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524462
1027	NC_007607	GGAA	2	8	50483	50490	50 %	0 %	50 %	0 %	82524462
1028	NC_007607	GGA	2	6	50493	50498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524462
1029	NC_007607	AAG	2	6	50571	50576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524462
1030	NC_007607	AG	3	6	50575	50580	50 %	0 %	50 %	0 %	82524462
1031	NC_007607	AATA	2	8	50582	50589	75 %	25 %	0 %	0 %	82524462
1032	NC_007607	TTA	3	9	50624	50632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524462
1033	NC_007607	ACAG	2	8	50644	50651	50 %	0 %	25 %	25 %	82524462
1034	NC_007607	AAT	2	6	50811	50816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524462
1035	NC_007607	A	6	6	50880	50885	100 %	0 %	0 %	0 %	82524462
1036	NC_007607	AGC	2	6	50897	50902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524462
1037	NC_007607	TTGT	2	8	50928	50935	0 %	75 %	25 %	0 %	82524462
1038	NC_007607	ATT	2	6	50964	50969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524462
1039	NC_007607	GCA	2	6	51030	51035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524462
1040	NC_007607	ATTA	2	8	51059	51066	50 %	50 %	0 %	0 %	82524462
1041	NC_007607	ATA	2	6	51114	51119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524462
1042	NC_007607	A	8	8	51165	51172	100 %	0 %	0 %	0 %	82524462
1043	NC_007607	GTG	2	6	51226	51231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_007607	TAT	2	6	51262	51267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_007607	GATG	2	8	51390	51397	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_007607	TGA	2	6	51436	51441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_007607	CA	3	6	51461	51466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_007607	AGAC	2	8	51478	51485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_007607	TAG	2	6	51513	51518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524463
1050	NC_007607	GTC	2	6	51710	51715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524463
1051	NC_007607	AGT	2	6	51756	51761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524463
1052	NC_007607	C	7	7	51808	51814	0 %	0 %	0 %	100 %	82524463
1053	NC_007607	TCA	2	6	51882	51887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524463
1054	NC_007607	T	6	6	51953	51958	0 %	100 %	0 %	0 %	82524464
1055	NC_007607	TAAGTG	2	12	52076	52087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524464
1056	NC_007607	AATG	2	8	52185	52192	50 %	25 %	25 %	0 %	82524464
1057	NC_007607	CTA	2	6	52272	52277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_007607	ATA	2	6	52292	52297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_007607	TTCAA	2	10	52391	52400	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_007607	GAC	2	6	52424	52429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524465
1061	NC_007607	TCAG	2	8	52488	52495	25 %	25 %	25 %	25 %	82524465
1062	NC_007607	GCT	2	6	52528	52533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524465
1063	NC_007607	A	7	7	52568	52574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_007607	CAC	2	6	52626	52631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_007607	CGTGAT	2	12	52663	52674	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82524466
1066	NC_007607	GAA	2	6	52698	52703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524466
1067	NC_007607	ATG	2	6	52802	52807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524466
1068	NC_007607	TC	3	6	52814	52819	0 %	50 %	0 %	50 %	82524466
1069	NC_007607	GTT	2	6	52861	52866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524466
1070	NC_007607	CAA	2	6	52956	52961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524466
1071	NC_007607	GCT	2	6	53007	53012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524466
1072	NC_007607	TGGC	2	8	53020	53027	0 %	25 %	50 %	25 %	82524466
1073	NC_007607	CGT	2	6	53190	53195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524466
1074	NC_007607	ACG	2	6	53198	53203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524466
1075	NC_007607	CAG	2	6	53224	53229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524467
1076	NC_007607	ATC	2	6	53246	53251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524467
1077	NC_007607	GTGC	2	8	53275	53282	0 %	25 %	50 %	25 %	82524467
1078	NC_007607	GCT	2	6	53369	53374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524467
1079	NC_007607	ACC	3	9	53391	53399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524467
1080	NC_007607	TGA	2	6	53426	53431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524467
1081	NC_007607	ACC	2	6	53442	53447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524467
1082	NC_007607	GAA	2	6	53497	53502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524467
1083	NC_007607	A	6	6	53504	53509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_007607	AAG	2	6	53542	53547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_007607	CGT	2	6	53556	53561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_007607	GCG	2	6	53595	53600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_007607	GGT	2	6	53623	53628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_007607	CAC	2	6	53915	53920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524469
1089	NC_007607	A	6	6	54039	54044	100 %	0 %	0 %	0 %	82524469
1090	NC_007607	CTG	2	6	54053	54058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524469
1091	NC_007607	CAT	2	6	54149	54154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524468
1092	NC_007607	GAA	2	6	54196	54201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82524468
1093	NC_007607	GTT	2	6	54265	54270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82524468
1094	NC_007607	TTAC	2	8	54453	54460	25 %	50 %	0 %	25 %	82524468
1095	NC_007607	TCA	2	6	54495	54500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82524468
1096	NC_007607	GTAT	2	8	54640	54647	25 %	50 %	25 %	0 %	82524468
1097	NC_007607	AC	3	6	54657	54662	50 %	0 %	0 %	50 %	82524468
1098	NC_007607	GTGG	2	8	54820	54827	0 %	25 %	75 %	0 %	82524468
1099	NC_007607	TAA	2	6	54835	54840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524468
1100	NC_007607	CGA	2	6	54842	54847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524468
1101	NC_007607	GCAGAA	2	12	54878	54889	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	82524468
1102	NC_007607	TTA	2	6	54895	54900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524468
1103	NC_007607	GAT	2	6	54917	54922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524468
1104	NC_007607	TGA	2	6	55068	55073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_007607	AGC	2	6	55206	55211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_007607	ACT	2	6	55213	55218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_007607	AAC	2	6	55231	55236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82524470
1108	NC_007607	A	9	9	55286	55294	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
1109	NC_007607	TAA	2	6	55303	55308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524470
1110	NC_007607	TA	3	6	55366	55371	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
1111	NC_007607	ACC	2	6	55396	55401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82524470
1112	NC_007607	TCC	2	6	55443	55448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82524470
1113	NC_007607	A	6	6	55450	55455	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
1114	NC_007607	TGG	2	6	55459	55464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524470
1115	NC_007607	TAA	2	6	55483	55488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82524470
1116	NC_007607	TAT	3	9	55507	55515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82524470
1117	NC_007607	TGG	2	6	55517	55522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82524470
1118	NC_007607	GAAT	2	8	55582	55589	50 %	25 %	25 %	0 %	82524470
1119	NC_007607	ATG	2	6	55600	55605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524470
1120	NC_007607	AT	3	6	55645	55650	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
1121	NC_007607	CAG	2	6	55656	55661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524470
1122	NC_007607	TTTCC	2	10	55677	55686	0 %	60 %	0 %	40 %	82524470
1123	NC_007607	AT	3	6	55698	55703	50 %	50 %	0 %	0 %	82524470
1124	NC_007607	A	6	6	55705	55710	100 %	0 %	0 %	0 %	82524470
1125	NC_007607	GAC	2	6	55784	55789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82524470
1126	NC_007607	GAT	2	6	55791	55796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82524470
1127	NC_007607	CTG	3	9	55849	55857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82524470
1128	NC_007607	GAG	2	6	55862	55867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82524470
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