MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007606	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007606	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007606	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007606	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007606	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007606	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775383
7	NC_007606	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775383
8	NC_007606	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007606	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007606	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007606	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775384
12	NC_007606	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	82775384
13	NC_007606	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	82775384
14	NC_007606	AACC	2	8	464	471	50 %	0 %	0 %	50 %	82775384
15	NC_007606	TGG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775384
16	NC_007606	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
17	NC_007606	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	82775384
18	NC_007606	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775384
19	NC_007606	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
20	NC_007606	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	82775384
21	NC_007606	ACT	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
22	NC_007606	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775384
23	NC_007606	CCG	2	6	907	912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775384
24	NC_007606	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775384
25	NC_007606	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
26	NC_007606	CGG	2	6	967	972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775384
27	NC_007606	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775384
28	NC_007606	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	82775384
29	NC_007606	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775384
30	NC_007606	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775384
31	NC_007606	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
32	NC_007606	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775384
33	NC_007606	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	82775384
34	NC_007606	TGC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
35	NC_007606	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775384
36	NC_007606	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
37	NC_007606	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	82775384
38	NC_007606	AGG	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775384
39	NC_007606	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775384
40	NC_007606	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775384
41	NC_007606	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775384
42	NC_007606	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
43	NC_007606	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
44	NC_007606	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
45	NC_007606	CAA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775384
46	NC_007606	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	82775384
47	NC_007606	GCG	2	6	1837	1842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775384
48	NC_007606	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775384
49	NC_007606	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
50	NC_007606	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775384
51	NC_007606	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	82775384
52	NC_007606	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
53	NC_007606	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
54	NC_007606	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775384
55	NC_007606	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
56	NC_007606	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
57	NC_007606	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775384
58	NC_007606	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
59	NC_007606	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	82775384
60	NC_007606	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
61	NC_007606	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775384
62	NC_007606	CG	4	8	2525	2532	0 %	0 %	50 %	50 %	82775384
63	NC_007606	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
64	NC_007606	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775384
65	NC_007606	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775384
66	NC_007606	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
67	NC_007606	GCT	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
68	NC_007606	CTG	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775384
69	NC_007606	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775385
70	NC_007606	GTA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775385
71	NC_007606	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775385
72	NC_007606	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775385
73	NC_007606	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	82775385
74	NC_007606	GGT	2	6	3105	3110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775385
75	NC_007606	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	82775385
76	NC_007606	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775385
77	NC_007606	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775385
78	NC_007606	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775385
79	NC_007606	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775385
80	NC_007606	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775385
81	NC_007606	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	82775385
82	NC_007606	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775385
83	NC_007606	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775385
84	NC_007606	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	82775385
85	NC_007606	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	82775385
86	NC_007606	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775385
87	NC_007606	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	82775385
88	NC_007606	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	82775385
89	NC_007606	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775385
90	NC_007606	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	82775386
91	NC_007606	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	82775386
92	NC_007606	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775386
93	NC_007606	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775386
94	NC_007606	GC	3	6	3960	3965	0 %	0 %	50 %	50 %	82775386
95	NC_007606	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775386
96	NC_007606	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775386
97	NC_007606	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775386
98	NC_007606	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	82775386
99	NC_007606	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775386
100	NC_007606	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775386
101	NC_007606	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775386
102	NC_007606	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775386
103	NC_007606	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775386
104	NC_007606	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775386
105	NC_007606	GCA	2	6	4717	4722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775386
106	NC_007606	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775386
107	NC_007606	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	82775386
108	NC_007606	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775386
109	NC_007606	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775386
110	NC_007606	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775386
111	NC_007606	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775386
112	NC_007606	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007606	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007606	GA	3	6	5090	5095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007606	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007606	TTA	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775387
117	NC_007606	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775387
118	NC_007606	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775387
119	NC_007606	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775387
120	NC_007606	CCG	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775387
121	NC_007606	TCA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775387
122	NC_007606	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775387
123	NC_007606	CGG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82775387
124	NC_007606	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007606	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007606	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775388
127	NC_007606	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82775388
128	NC_007606	TCA	2	6	5734	5739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775388
129	NC_007606	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775388
130	NC_007606	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	82775388
131	NC_007606	AAT	2	6	5799	5804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775388
132	NC_007606	TCA	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775388
133	NC_007606	TTC	2	6	5866	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775388
134	NC_007606	TTC	2	6	5911	5916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82775388
135	NC_007606	CAC	2	6	5958	5963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775388
136	NC_007606	TGC	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775388
137	NC_007606	TTG	2	6	5998	6003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775388
138	NC_007606	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775388
139	NC_007606	AAATCG	2	12	6151	6162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	82775388
140	NC_007606	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	82775388
141	NC_007606	CTG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775388
142	NC_007606	GTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775388
143	NC_007606	A	6	6	6495	6500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007606	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007606	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775389
146	NC_007606	GTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82775389
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148	NC_007606	ATC	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775389
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151	NC_007606	GCC	2	6	7202	7207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775389
152	NC_007606	GCCA	2	8	7219	7226	25 %	0 %	25 %	50 %	82775389
153	NC_007606	TTA	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775389
154	NC_007606	CAG	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775389
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157	NC_007606	AAG	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775389
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159	NC_007606	CG	3	6	7738	7743	0 %	0 %	50 %	50 %	82775389
160	NC_007606	CAA	2	6	7872	7877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775389
161	NC_007606	A	6	6	7938	7943	100 %	0 %	0 %	0 %	82775389
162	NC_007606	GCAT	2	8	7948	7955	25 %	25 %	25 %	25 %	82775389
163	NC_007606	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007606	TA	3	6	8017	8022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007606	GGCG	2	8	8079	8086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
166	NC_007606	CGG	2	6	8143	8148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_007606	CGT	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_007606	ATC	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_007606	ACC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775390
170	NC_007606	CAAC	2	8	8327	8334	50 %	0 %	0 %	50 %	82775390
171	NC_007606	TC	3	6	8338	8343	0 %	50 %	0 %	50 %	82775390
172	NC_007606	CGCAG	2	10	8352	8361	20 %	0 %	40 %	40 %	82775390
173	NC_007606	TTGA	2	8	8380	8387	25 %	50 %	25 %	0 %	82775390
174	NC_007606	CAG	2	6	8410	8415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775390
175	NC_007606	CG	3	6	8425	8430	0 %	0 %	50 %	50 %	82775390
176	NC_007606	CAG	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82775390
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182	NC_007606	AGA	2	6	8823	8828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775390
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188	NC_007606	CTGT	2	8	9232	9239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_007606	TGA	2	6	9296	9301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775391
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202	NC_007606	AGAT	2	8	9987	9994	50 %	25 %	25 %	0 %	82775392
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215	NC_007606	AAT	2	6	10521	10526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_007606	ATA	2	6	10562	10567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
217	NC_007606	GAG	2	6	10600	10605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_007606	TCTTT	2	10	11860	11869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_007606	TTA	2	6	11870	11875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_007606	T	6	6	11879	11884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_007606	ATTC	2	8	11904	11911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
245	NC_007606	A	6	6	11984	11989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_007606	TGA	2	6	12007	12012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_007606	AGTG	2	8	12046	12053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
249	NC_007606	A	7	7	12061	12067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_007606	ATG	2	6	12123	12128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_007606	AT	3	6	12134	12139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_007606	AAT	2	6	12163	12168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775395
253	NC_007606	TAC	2	6	12184	12189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775395
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255	NC_007606	CAC	2	6	12217	12222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775395
256	NC_007606	CAC	2	6	12256	12261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82775395
257	NC_007606	TGGT	2	8	12300	12307	0 %	50 %	50 %	0 %	82775395
258	NC_007606	GCC	2	6	12375	12380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775395
259	NC_007606	GAA	2	6	12392	12397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775395
260	NC_007606	CAT	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775395
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262	NC_007606	GCT	2	6	12437	12442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775395
263	NC_007606	CCG	2	6	12488	12493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82775395
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265	NC_007606	A	7	7	12515	12521	100 %	0 %	0 %	0 %	82775395
266	NC_007606	GAA	2	6	12523	12528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82775395
267	NC_007606	ATC	2	6	12656	12661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82775395
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269	NC_007606	GTG	2	6	12741	12746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82775395
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403	NC_007606	ATG	2	6	19413	19418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82775402
404	NC_007606	ATT	2	6	19434	19439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775402
405	NC_007606	AAATTA	2	12	19525	19536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82775402
406	NC_007606	TAT	2	6	19559	19564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82775402
407	NC_007606	AAC	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82775402
408	NC_007606	CATT	2	8	19726	19733	25 %	50 %	0 %	25 %	82775403
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431	NC_007606	T	6	6	21642	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_007606	CTG	2	6	21719	21724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
434	NC_007606	GAG	2	6	21775	21780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_007606	CGT	2	6	21784	21789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82775407
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