MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella dysenteriae Sd197

Total Repeats: 86031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_007606	AGC	2	6	645589	645594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776010
13003	NC_007606	ACT	2	6	645634	645639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776010
13004	NC_007606	GTC	2	6	645662	645667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_007606	TGG	2	6	645700	645705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82776011
13006	NC_007606	CTG	2	6	645706	645711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13007	NC_007606	CTG	2	6	645721	645726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13008	NC_007606	CAC	2	6	645830	645835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82776011
13009	NC_007606	GGC	2	6	645871	645876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82776011
13010	NC_007606	TGC	2	6	645885	645890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13011	NC_007606	TTC	2	6	645961	645966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776011
13012	NC_007606	CGGT	2	8	645971	645978	0 %	25 %	50 %	25 %	82776011
13013	NC_007606	GAA	2	6	646000	646005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82776011
13014	NC_007606	CCG	2	6	646057	646062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82776011
13015	NC_007606	TGA	2	6	646116	646121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776011
13016	NC_007606	TAC	2	6	646135	646140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776011
13017	NC_007606	CTT	2	6	646149	646154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776011
13018	NC_007606	GCT	2	6	646158	646163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13019	NC_007606	CTG	2	6	646177	646182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13020	NC_007606	GTG	2	6	646189	646194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82776011
13021	NC_007606	GAT	2	6	646203	646208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776011
13022	NC_007606	GGC	2	6	646287	646292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82776011
13023	NC_007606	CTGG	2	8	646318	646325	0 %	25 %	50 %	25 %	82776011
13024	NC_007606	AAG	2	6	646406	646411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82776011
13025	NC_007606	CAA	2	6	646446	646451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82776011
13026	NC_007606	GCT	2	6	646497	646502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776011
13027	NC_007606	TCC	2	6	646552	646557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82776011
13028	NC_007606	CAT	2	6	646572	646577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776011
13029	NC_007606	ATG	2	6	646627	646632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776011
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13031	NC_007606	GGT	2	6	646701	646706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82776011
13032	NC_007606	AGA	2	6	646773	646778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82776011
13033	NC_007606	CT	3	6	646797	646802	0 %	50 %	0 %	50 %	82776011
13034	NC_007606	TAAG	2	8	646807	646814	50 %	25 %	25 %	0 %	82776011
13035	NC_007606	CTT	2	6	646854	646859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776012
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13037	NC_007606	TGA	2	6	646935	646940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776012
13038	NC_007606	ATGT	2	8	647026	647033	25 %	50 %	25 %	0 %	82776013
13039	NC_007606	CGC	2	6	647053	647058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82776013
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13041	NC_007606	TTGC	2	8	647180	647187	0 %	50 %	25 %	25 %	82776013
13042	NC_007606	TCT	3	9	647217	647225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776013
13043	NC_007606	A	6	6	647246	647251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_007606	CG	4	8	647319	647326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_007606	TAG	2	6	647329	647334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_007606	TTG	2	6	647357	647362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_007606	CTA	2	6	647415	647420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776014
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13051	NC_007606	TGC	2	6	647495	647500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776014
13052	NC_007606	TCA	3	9	647502	647510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776014
13053	NC_007606	CGA	2	6	647595	647600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776014
13054	NC_007606	TGAA	2	8	647690	647697	50 %	25 %	25 %	0 %	82776014
13055	NC_007606	GTT	2	6	647710	647715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82776014
13056	NC_007606	TGAC	2	8	647782	647789	25 %	25 %	25 %	25 %	82776014
13057	NC_007606	TTGATT	2	12	647844	647855	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	82776015
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13061	NC_007606	TCTGG	2	10	647947	647956	0 %	40 %	40 %	20 %	82776015
13062	NC_007606	CT	3	6	647964	647969	0 %	50 %	0 %	50 %	82776015
13063	NC_007606	AG	3	6	647981	647986	50 %	0 %	50 %	0 %	82776015
13064	NC_007606	GTA	2	6	648090	648095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776015
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13066	NC_007606	CGG	2	6	648340	648345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82776015
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13069	NC_007606	CAA	2	6	648461	648466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82776015
13070	NC_007606	GTC	2	6	648499	648504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776016
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13079	NC_007606	CTTG	2	8	648920	648927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13089	NC_007606	CAG	2	6	649225	649230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776017
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13095	NC_007606	GCG	2	6	649390	649395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82776017
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13105	NC_007606	GCT	2	6	649612	649617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776017
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13120	NC_007606	AAGT	2	8	650016	650023	50 %	25 %	25 %	0 %	82776017
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13122	NC_007606	ACC	2	6	650175	650180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82776017
13123	NC_007606	ATG	2	6	650365	650370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776018
13124	NC_007606	GTC	2	6	650468	650473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776018
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13127	NC_007606	GGC	2	6	650530	650535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82776018
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13133	NC_007606	GTACT	2	10	650744	650753	20 %	40 %	20 %	20 %	82776018
13134	NC_007606	TGA	2	6	650814	650819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776018
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13146	NC_007606	CCTG	2	8	651637	651644	0 %	25 %	25 %	50 %	82776018
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13183	NC_007606	GCC	2	6	653134	653139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13238	NC_007606	TGA	2	6	655473	655478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776022
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13243	NC_007606	CG	3	6	655649	655654	0 %	0 %	50 %	50 %	82776022
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13245	NC_007606	TTCA	2	8	655696	655703	25 %	50 %	0 %	25 %	82776023
13246	NC_007606	TGG	2	6	655746	655751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82776023
13247	NC_007606	CAA	2	6	655798	655803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82776023
13248	NC_007606	ATCGTG	2	12	655807	655818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	82776023
13249	NC_007606	TCA	2	6	655845	655850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82776023
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13251	NC_007606	ACG	2	6	655921	655926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776023
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13254	NC_007606	GA	3	6	656036	656041	50 %	0 %	50 %	0 %	82776023
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13364	NC_007606	TCAG	2	8	661726	661733	25 %	25 %	25 %	25 %	82776031
13365	NC_007606	GCT	2	6	661820	661825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776031
13366	NC_007606	GAA	2	6	661827	661832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82776031
13367	NC_007606	ACG	2	6	661857	661862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776031
13368	NC_007606	ATG	2	6	661909	661914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776031
13369	NC_007606	TCTT	2	8	661987	661994	0 %	75 %	0 %	25 %	82776031
13370	NC_007606	CAA	2	6	662039	662044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82776031
13371	NC_007606	GAT	2	6	662099	662104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776031
13372	NC_007606	GCT	2	6	662108	662113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776031
13373	NC_007606	GAA	2	6	662149	662154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82776031
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13375	NC_007606	TGT	2	6	662213	662218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82776031
13376	NC_007606	CAC	2	6	662238	662243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82776031
13377	NC_007606	GTG	2	6	662363	662368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82776031
13378	NC_007606	AATC	2	8	662390	662397	50 %	25 %	0 %	25 %	82776031
13379	NC_007606	CGT	2	6	662417	662422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776031
13380	NC_007606	GT	3	6	662431	662436	0 %	50 %	50 %	0 %	82776031
13381	NC_007606	T	6	6	662519	662524	0 %	100 %	0 %	0 %	82776031
13382	NC_007606	GC	3	6	662578	662583	0 %	0 %	50 %	50 %	82776032
13383	NC_007606	CTG	2	6	662591	662596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776032
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13385	NC_007606	TACG	2	8	662657	662664	25 %	25 %	25 %	25 %	82776032
13386	NC_007606	GC	3	6	662738	662743	0 %	0 %	50 %	50 %	82776032
13387	NC_007606	CGCCAG	2	12	662814	662825	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	82776032
13388	NC_007606	CGCTG	2	10	662828	662837	0 %	20 %	40 %	40 %	82776032
13389	NC_007606	GCA	2	6	662879	662884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776032
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13394	NC_007606	CG	3	6	663278	663283	0 %	0 %	50 %	50 %	82776032
13395	NC_007606	CT	3	6	663284	663289	0 %	50 %	0 %	50 %	82776032
13396	NC_007606	TGGC	2	8	663464	663471	0 %	25 %	50 %	25 %	82776032
13397	NC_007606	GCGGT	2	10	663504	663513	0 %	20 %	60 %	20 %	82776032
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13399	NC_007606	GAT	2	6	663560	663565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776032
13400	NC_007606	TGCCAG	2	12	663628	663639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	82776033
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13402	NC_007606	GCT	2	6	663810	663815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776033
13403	NC_007606	ACG	2	6	663880	663885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776033
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13405	NC_007606	GC	3	6	664064	664069	0 %	0 %	50 %	50 %	82776033
13406	NC_007606	GCA	2	6	664088	664093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82776033
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13418	NC_007606	ACC	2	6	664590	664595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82776033
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13420	NC_007606	ATGA	2	8	664761	664768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13421	NC_007606	A	7	7	664785	664791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13422	NC_007606	GCC	2	6	664845	664850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13423	NC_007606	AT	3	6	664878	664883	50 %	50 %	0 %	0 %	82776034
13424	NC_007606	CAGG	2	8	664945	664952	25 %	0 %	50 %	25 %	82776034
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13427	NC_007606	CAA	2	6	665015	665020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82776034
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13433	NC_007606	AGT	2	6	665286	665291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82776034
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13450	NC_007606	CTG	2	6	665982	665987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776034
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13473	NC_007606	T	6	6	667546	667551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13474	NC_007606	CTG	2	6	667581	667586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13476	NC_007606	CGC	3	9	667743	667751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82776037
13477	NC_007606	A	6	6	667792	667797	100 %	0 %	0 %	0 %	82776037
13478	NC_007606	TCT	2	6	667819	667824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776037
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13480	NC_007606	A	6	6	667924	667929	100 %	0 %	0 %	0 %	82776037
13481	NC_007606	CGAT	2	8	667931	667938	25 %	25 %	25 %	25 %	82776037
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13483	NC_007606	AACT	2	8	668028	668035	50 %	25 %	0 %	25 %	82776037
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13488	NC_007606	GC	3	6	668180	668185	0 %	0 %	50 %	50 %	82776037
13489	NC_007606	A	6	6	668293	668298	100 %	0 %	0 %	0 %	82776037
13490	NC_007606	TGT	2	6	668316	668321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82776037
13491	NC_007606	GCAG	2	8	668376	668383	25 %	0 %	50 %	25 %	82776037
13492	NC_007606	GGCA	2	8	668443	668450	25 %	0 %	50 %	25 %	82776038
13493	NC_007606	TTA	2	6	668454	668459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82776038
13494	NC_007606	TTC	2	6	668471	668476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82776038
13495	NC_007606	GCTGT	2	10	668481	668490	0 %	40 %	40 %	20 %	82776038
13496	NC_007606	T	6	6	668511	668516	0 %	100 %	0 %	0 %	82776038
13497	NC_007606	GTC	2	6	668601	668606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82776038
13498	NC_007606	TTA	3	9	668613	668621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82776038
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13500	NC_007606	GCC	2	6	668715	668720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82776038

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