MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_007604	GAG	2	6	2623699	2623704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301351
49003	NC_007604	TCG	2	6	2623761	2623766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49004	NC_007604	CTT	2	6	2623780	2623785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301352
49005	NC_007604	GCA	2	6	2623840	2623845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49006	NC_007604	TCCA	2	8	2623890	2623897	25 %	25 %	0 %	50 %	81301352
49007	NC_007604	CAG	2	6	2623934	2623939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49008	NC_007604	CCG	2	6	2623948	2623953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301352
49009	NC_007604	CGCC	2	8	2623957	2623964	0 %	0 %	25 %	75 %	81301352
49010	NC_007604	CA	3	6	2624015	2624020	50 %	0 %	0 %	50 %	81301352
49011	NC_007604	GCC	2	6	2624022	2624027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301352
49012	NC_007604	CGG	2	6	2624057	2624062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301352
49013	NC_007604	CCG	2	6	2624116	2624121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301352
49014	NC_007604	CAA	2	6	2624155	2624160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301352
49015	NC_007604	GCTTG	2	10	2624215	2624224	0 %	40 %	40 %	20 %	81301352
49016	NC_007604	CAC	2	6	2624240	2624245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301352
49017	NC_007604	AGC	2	6	2624301	2624306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49018	NC_007604	TCG	2	6	2624353	2624358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49019	NC_007604	GCG	2	6	2624364	2624369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301352
49020	NC_007604	GCA	2	6	2624409	2624414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301352
49021	NC_007604	CGC	2	6	2624590	2624595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301353
49022	NC_007604	ATCC	2	8	2624603	2624610	25 %	25 %	0 %	50 %	81301353
49023	NC_007604	GCC	2	6	2624681	2624686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301353
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49025	NC_007604	ACC	2	6	2624777	2624782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301353
49026	NC_007604	CAG	2	6	2624797	2624802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301353
49027	NC_007604	GTCA	2	8	2624876	2624883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49028	NC_007604	TTC	2	6	2624894	2624899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49029	NC_007604	CGT	2	6	2624911	2624916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49030	NC_007604	GCC	2	6	2624966	2624971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49031	NC_007604	GCA	2	6	2625132	2625137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301354
49032	NC_007604	GC	3	6	2625221	2625226	0 %	0 %	50 %	50 %	81301354
49033	NC_007604	GCC	2	6	2625249	2625254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301354
49034	NC_007604	TGC	2	6	2625307	2625312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301354
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49042	NC_007604	CGAG	2	8	2625736	2625743	25 %	0 %	50 %	25 %	81301354
49043	NC_007604	TGC	4	12	2625749	2625760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301354
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49045	NC_007604	GCTG	2	8	2625857	2625864	0 %	25 %	50 %	25 %	81301354
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49049	NC_007604	ACTG	2	8	2626083	2626090	25 %	25 %	25 %	25 %	81301354
49050	NC_007604	GTC	2	6	2626171	2626176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49052	NC_007604	GCG	2	6	2626467	2626472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301355
49053	NC_007604	CAA	2	6	2626474	2626479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301355
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49055	NC_007604	CCGC	2	8	2626517	2626524	0 %	0 %	25 %	75 %	81301355
49056	NC_007604	GAC	2	6	2626541	2626546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301355
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49066	NC_007604	CAAC	2	8	2626975	2626982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49067	NC_007604	CTG	2	6	2626983	2626988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49086	NC_007604	TTG	2	6	2628041	2628046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49087	NC_007604	TGCC	2	8	2628070	2628077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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49094	NC_007604	GCT	2	6	2628415	2628420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49099	NC_007604	AG	3	6	2628804	2628809	50 %	0 %	50 %	0 %	81301359
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49115	NC_007604	CA	3	6	2629677	2629682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49116	NC_007604	ATC	2	6	2629749	2629754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301360
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49118	NC_007604	CCA	2	6	2629853	2629858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301360
49119	NC_007604	CCG	2	6	2629899	2629904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301360
49120	NC_007604	ACC	2	6	2629954	2629959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301360
49121	NC_007604	TGCT	2	8	2629984	2629991	0 %	50 %	25 %	25 %	81301360
49122	NC_007604	CAAC	2	8	2630004	2630011	50 %	0 %	0 %	50 %	81301360
49123	NC_007604	TCAG	2	8	2630117	2630124	25 %	25 %	25 %	25 %	81301360
49124	NC_007604	AAT	2	6	2630240	2630245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301360
49125	NC_007604	CAG	2	6	2630348	2630353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49126	NC_007604	C	6	6	2630420	2630425	0 %	0 %	0 %	100 %	81301360
49127	NC_007604	AGCC	2	8	2630536	2630543	25 %	0 %	25 %	50 %	81301360
49128	NC_007604	GGT	2	6	2630552	2630557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301360
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49130	NC_007604	TTG	2	6	2630722	2630727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301360
49131	NC_007604	GCG	2	6	2630728	2630733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301360
49132	NC_007604	GGC	2	6	2630740	2630745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301360
49133	NC_007604	TTC	2	6	2630813	2630818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301360
49134	NC_007604	GAG	2	6	2630836	2630841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301360
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49136	NC_007604	AAT	2	6	2630920	2630925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301360
49137	NC_007604	ATC	2	6	2630938	2630943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301360
49138	NC_007604	CAG	2	6	2631026	2631031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49139	NC_007604	CGC	2	6	2631039	2631044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301360
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49145	NC_007604	GCA	2	6	2631203	2631208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49146	NC_007604	GGCA	2	8	2631345	2631352	25 %	0 %	50 %	25 %	81301360
49147	NC_007604	CAG	2	6	2631358	2631363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49148	NC_007604	GCC	2	6	2631370	2631375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301360
49149	NC_007604	TTG	2	6	2631403	2631408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301360
49150	NC_007604	GCG	2	6	2631413	2631418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301360
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49152	NC_007604	GTG	2	6	2631590	2631595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301360
49153	NC_007604	GC	3	6	2631632	2631637	0 %	0 %	50 %	50 %	81301360
49154	NC_007604	GATAGC	2	12	2631666	2631677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	81301360
49155	NC_007604	TGCTC	2	10	2631750	2631759	0 %	40 %	20 %	40 %	81301360
49156	NC_007604	TTG	2	6	2631817	2631822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301360
49157	NC_007604	GCT	2	6	2631867	2631872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49158	NC_007604	CTG	2	6	2631877	2631882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301360
49159	NC_007604	CAT	2	6	2631927	2631932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301360
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49161	NC_007604	GCC	2	6	2632023	2632028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301360
49162	NC_007604	GAC	2	6	2632094	2632099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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49164	NC_007604	CCAG	2	8	2632184	2632191	25 %	0 %	25 %	50 %	81301361
49165	NC_007604	CTG	2	6	2632216	2632221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301361
49166	NC_007604	TCG	2	6	2632232	2632237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301361
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49169	NC_007604	CGC	2	6	2632402	2632407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301361
49170	NC_007604	GCA	2	6	2632426	2632431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301361
49171	NC_007604	ATCG	2	8	2632470	2632477	25 %	25 %	25 %	25 %	81301361
49172	NC_007604	GGCA	2	8	2632496	2632503	25 %	0 %	50 %	25 %	81301361
49173	NC_007604	TTGC	2	8	2632571	2632578	0 %	50 %	25 %	25 %	81301361
49174	NC_007604	GGC	2	6	2632639	2632644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301361
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49178	NC_007604	ACC	2	6	2632867	2632872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301362
49179	NC_007604	TGCAAC	2	12	2632882	2632893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81301362
49180	NC_007604	CTG	2	6	2632902	2632907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301362
49181	NC_007604	GCG	2	6	2632952	2632957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301362
49182	NC_007604	TGC	2	6	2633044	2633049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301362
49183	NC_007604	TGC	2	6	2633128	2633133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301362
49184	NC_007604	CTGC	2	8	2633147	2633154	0 %	25 %	25 %	50 %	81301362
49185	NC_007604	TGC	2	6	2633244	2633249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301363
49186	NC_007604	CA	3	6	2633350	2633355	50 %	0 %	0 %	50 %	81301363
49187	NC_007604	CGC	2	6	2633424	2633429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301363
49188	NC_007604	TCCAC	2	10	2633433	2633442	20 %	20 %	0 %	60 %	81301363
49189	NC_007604	CGG	3	9	2633455	2633463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301363
49190	NC_007604	TGA	2	6	2633529	2633534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301363
49191	NC_007604	CGT	2	6	2633552	2633557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301363
49192	NC_007604	AGCG	2	8	2633566	2633573	25 %	0 %	50 %	25 %	81301363
49193	NC_007604	CAT	2	6	2633602	2633607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301363
49194	NC_007604	C	6	6	2633688	2633693	0 %	0 %	0 %	100 %	81301364
49195	NC_007604	AGC	2	6	2633766	2633771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301364
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49198	NC_007604	GCT	2	6	2634106	2634111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301364
49199	NC_007604	CCA	2	6	2634122	2634127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301364
49200	NC_007604	GTA	2	6	2634247	2634252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301364
49201	NC_007604	TCC	2	6	2634311	2634316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301364
49202	NC_007604	CAA	2	6	2634351	2634356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301364
49203	NC_007604	CCG	2	6	2634368	2634373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301364
49204	NC_007604	CCA	2	6	2634399	2634404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301364
49205	NC_007604	TCT	2	6	2634446	2634451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301364
49206	NC_007604	AGC	2	6	2634467	2634472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301364
49207	NC_007604	CTGA	2	8	2634550	2634557	25 %	25 %	25 %	25 %	81301364
49208	NC_007604	CCCG	2	8	2634571	2634578	0 %	0 %	25 %	75 %	81301364
49209	NC_007604	C	7	7	2634607	2634613	0 %	0 %	0 %	100 %	81301364
49210	NC_007604	GCT	2	6	2634627	2634632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301364
49211	NC_007604	CAG	2	6	2634678	2634683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301364
49212	NC_007604	CCCAG	2	10	2634723	2634732	20 %	0 %	20 %	60 %	81301364
49213	NC_007604	A	6	6	2634757	2634762	100 %	0 %	0 %	0 %	81301364
49214	NC_007604	GAT	2	6	2634781	2634786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301364
49215	NC_007604	CGG	2	6	2634867	2634872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301364
49216	NC_007604	GGC	2	6	2634939	2634944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301364
49217	NC_007604	ACG	2	6	2634977	2634982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301364
49218	NC_007604	ATC	2	6	2635012	2635017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301364
49219	NC_007604	AGC	2	6	2635148	2635153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
49220	NC_007604	GCA	2	6	2635158	2635163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
49221	NC_007604	CGG	2	6	2635179	2635184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301365
49222	NC_007604	GCG	2	6	2635185	2635190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301365
49223	NC_007604	CCA	2	6	2635218	2635223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301365
49224	NC_007604	AGC	2	6	2635250	2635255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
49225	NC_007604	GGC	2	6	2635256	2635261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301365
49226	NC_007604	GCG	2	6	2635287	2635292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301365
49227	NC_007604	CAG	2	6	2635329	2635334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
49228	NC_007604	C	6	6	2635347	2635352	0 %	0 %	0 %	100 %	81301365
49229	NC_007604	TGG	2	6	2635433	2635438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301365
49230	NC_007604	AGC	2	6	2635439	2635444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
49231	NC_007604	GCAA	2	8	2635519	2635526	50 %	0 %	25 %	25 %	81301365
49232	NC_007604	GAC	2	6	2635537	2635542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301365
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49234	NC_007604	CGC	2	6	2635651	2635656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301366
49235	NC_007604	GGCA	2	8	2635748	2635755	25 %	0 %	50 %	25 %	81301366
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49350	NC_007604	GCA	2	6	2641414	2641419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301372
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49353	NC_007604	GCC	2	6	2641599	2641604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301372
49354	NC_007604	CAGCTC	2	12	2641625	2641636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	81301372
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49453	NC_007604	CGAT	2	8	2645685	2645692	25 %	25 %	25 %	25 %	81301375
49454	NC_007604	GGC	2	6	2645827	2645832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301375
49455	NC_007604	AGA	2	6	2645839	2645844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301375
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49457	NC_007604	AGA	2	6	2645860	2645865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301375
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49466	NC_007604	TGC	2	6	2646204	2646209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301375
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