MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_007604	ACA	2	6	2571826	2571831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301300
48003	NC_007604	CAA	2	6	2571845	2571850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301300
48004	NC_007604	CGG	2	6	2571866	2571871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301300
48005	NC_007604	TCCGGA	2	12	2572016	2572027	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301300
48006	NC_007604	TCG	2	6	2572078	2572083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301300
48007	NC_007604	CGC	2	6	2572347	2572352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301300
48008	NC_007604	GGA	2	6	2572475	2572480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301300
48009	NC_007604	ACC	2	6	2572504	2572509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301300
48010	NC_007604	TGAC	2	8	2572522	2572529	25 %	25 %	25 %	25 %	81301300
48011	NC_007604	CTT	2	6	2572571	2572576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301300
48012	NC_007604	GCT	2	6	2572595	2572600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301300
48013	NC_007604	CTACAT	2	12	2572610	2572621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301300
48014	NC_007604	TGCC	2	8	2572622	2572629	0 %	25 %	25 %	50 %	81301300
48015	NC_007604	CGC	2	6	2572630	2572635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301300
48016	NC_007604	ACT	2	6	2572663	2572668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301300
48017	NC_007604	AACG	2	8	2572677	2572684	50 %	0 %	25 %	25 %	81301300
48018	NC_007604	ATG	2	6	2572761	2572766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301300
48019	NC_007604	CAG	2	6	2572770	2572775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301300
48020	NC_007604	CGC	2	6	2572835	2572840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301300
48021	NC_007604	CGC	2	6	2572890	2572895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301300
48022	NC_007604	CTCAG	2	10	2572918	2572927	20 %	20 %	20 %	40 %	81301300
48023	NC_007604	TCA	2	6	2572972	2572977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48024	NC_007604	GCC	2	6	2572988	2572993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48025	NC_007604	CAG	2	6	2573013	2573018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48026	NC_007604	GCG	2	6	2573048	2573053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48027	NC_007604	TTG	2	6	2573055	2573060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48028	NC_007604	GTTG	2	8	2573102	2573109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48029	NC_007604	GACTC	2	10	2573173	2573182	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48030	NC_007604	C	6	6	2573189	2573194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48031	NC_007604	CAA	2	6	2573196	2573201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48032	NC_007604	GATCGC	2	12	2573227	2573238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48033	NC_007604	GGT	2	6	2573256	2573261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48034	NC_007604	GCT	2	6	2573348	2573353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48035	NC_007604	GCTT	2	8	2573368	2573375	0 %	50 %	25 %	25 %	81301301
48036	NC_007604	ATCA	2	8	2573385	2573392	50 %	25 %	0 %	25 %	81301301
48037	NC_007604	GCT	2	6	2573401	2573406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301301
48038	NC_007604	GAG	2	6	2573555	2573560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301301
48039	NC_007604	CAG	2	6	2573586	2573591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301301
48040	NC_007604	GAC	2	6	2573600	2573605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301301
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48044	NC_007604	GCG	2	6	2573843	2573848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301301
48045	NC_007604	CTG	2	6	2573868	2573873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301301
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48048	NC_007604	AGTC	2	8	2573999	2574006	25 %	25 %	25 %	25 %	81301301
48049	NC_007604	GCA	2	6	2574050	2574055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301301
48050	NC_007604	CTCA	2	8	2574060	2574067	25 %	25 %	0 %	50 %	81301301
48051	NC_007604	CAAT	2	8	2574129	2574136	50 %	25 %	0 %	25 %	81301302
48052	NC_007604	TCAA	2	8	2574197	2574204	50 %	25 %	0 %	25 %	81301302
48053	NC_007604	ACC	2	6	2574206	2574211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301302
48054	NC_007604	CTAGCG	2	12	2574318	2574329	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301302
48055	NC_007604	CGG	2	6	2574347	2574352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301302
48056	NC_007604	CGG	2	6	2574431	2574436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301302
48057	NC_007604	GCTCG	2	10	2574461	2574470	0 %	20 %	40 %	40 %	81301302
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48060	NC_007604	TTGA	2	8	2574760	2574767	25 %	50 %	25 %	0 %	81301302
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48062	NC_007604	CCA	2	6	2574779	2574784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301302
48063	NC_007604	GCG	2	6	2574787	2574792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301302
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48066	NC_007604	TGGC	3	12	2574840	2574851	0 %	25 %	50 %	25 %	81301303
48067	NC_007604	TGC	2	6	2574884	2574889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301303
48068	NC_007604	CAG	3	9	2574897	2574905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301303
48069	NC_007604	ACCGA	2	10	2574967	2574976	40 %	0 %	20 %	40 %	81301303
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48072	NC_007604	GCA	2	6	2575288	2575293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301303
48073	NC_007604	CAG	3	9	2575302	2575310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301303
48074	NC_007604	GGCAA	2	10	2575312	2575321	40 %	0 %	40 %	20 %	81301303
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48099	NC_007604	TCAA	2	8	2576410	2576417	50 %	25 %	0 %	25 %	81301304
48100	NC_007604	CCG	2	6	2576428	2576433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301304
48101	NC_007604	AGC	2	6	2576449	2576454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301304
48102	NC_007604	CCCA	2	8	2576523	2576530	25 %	0 %	0 %	75 %	81301304
48103	NC_007604	CAA	2	6	2576693	2576698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301305
48104	NC_007604	GA	3	6	2576784	2576789	50 %	0 %	50 %	0 %	81301305
48105	NC_007604	GCA	2	6	2576830	2576835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301305
48106	NC_007604	ACC	2	6	2576868	2576873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301305
48107	NC_007604	CTG	2	6	2576920	2576925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301305
48108	NC_007604	A	6	6	2576926	2576931	100 %	0 %	0 %	0 %	81301305
48109	NC_007604	TTG	2	6	2576994	2576999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301305
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48112	NC_007604	GCC	2	6	2577098	2577103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301305
48113	NC_007604	CCA	2	6	2577153	2577158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301305
48114	NC_007604	GCT	2	6	2577162	2577167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301305
48115	NC_007604	CGA	2	6	2577170	2577175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301305
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48234	NC_007604	CAA	2	6	2582751	2582756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301310
48235	NC_007604	GTCA	2	8	2582768	2582775	25 %	25 %	25 %	25 %	81301310
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48237	NC_007604	TGA	2	6	2582834	2582839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301310
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48255	NC_007604	GATG	2	8	2584192	2584199	25 %	25 %	50 %	0 %	81301311
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48259	NC_007604	AG	3	6	2584430	2584435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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48337	NC_007604	GAC	2	6	2588430	2588435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301317
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48465	NC_007604	CTG	2	6	2595724	2595729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48466	NC_007604	TCA	2	6	2595741	2595746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301324
48467	NC_007604	CAG	2	6	2595812	2595817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48468	NC_007604	AC	3	6	2595940	2595945	50 %	0 %	0 %	50 %	81301324
48469	NC_007604	TGC	2	6	2595946	2595951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48470	NC_007604	GTT	2	6	2595958	2595963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301324
48471	NC_007604	CAA	2	6	2595995	2596000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301324
48472	NC_007604	CTG	2	6	2596001	2596006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48473	NC_007604	GCG	2	6	2596067	2596072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301324
48474	NC_007604	TGC	2	6	2596194	2596199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48475	NC_007604	GGC	2	6	2596232	2596237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301324
48476	NC_007604	CGA	2	6	2596269	2596274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48477	NC_007604	GCT	2	6	2596308	2596313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48478	NC_007604	GCT	3	9	2596387	2596395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301324
48479	NC_007604	TCT	2	6	2596420	2596425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301324
48480	NC_007604	ATC	2	6	2596455	2596460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301324
48481	NC_007604	CTG	2	6	2596485	2596490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48482	NC_007604	TGC	2	6	2596496	2596501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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48484	NC_007604	CTCCA	2	10	2596652	2596661	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
48485	NC_007604	CTC	2	6	2596734	2596739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301325
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48489	NC_007604	TGT	2	6	2596994	2596999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48490	NC_007604	GGC	2	6	2597117	2597122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301326
48491	NC_007604	CTG	2	6	2597142	2597147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301326
48492	NC_007604	CTG	2	6	2597172	2597177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301326
48493	NC_007604	GGC	2	6	2597222	2597227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301326
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48495	NC_007604	CGG	3	9	2597412	2597420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301326
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48497	NC_007604	GTT	2	6	2597504	2597509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301326
48498	NC_007604	GCGATC	2	12	2597524	2597535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301326
48499	NC_007604	CCAG	2	8	2597558	2597565	25 %	0 %	25 %	50 %	81301326
48500	NC_007604	GCT	2	6	2597614	2597619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301326

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