MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_007604	TTG	2	6	2516061	2516066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301249
47003	NC_007604	AAG	2	6	2516205	2516210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301249
47004	NC_007604	CATC	2	8	2516311	2516318	25 %	25 %	0 %	50 %	81301249
47005	NC_007604	GGA	2	6	2516366	2516371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301249
47006	NC_007604	ACC	2	6	2516385	2516390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301249
47007	NC_007604	TTC	2	6	2516408	2516413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301249
47008	NC_007604	CG	3	6	2516438	2516443	0 %	0 %	50 %	50 %	81301249
47009	NC_007604	CCG	2	6	2516471	2516476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301249
47010	NC_007604	G	6	6	2516516	2516521	0 %	0 %	100 %	0 %	81301249
47011	NC_007604	TGT	2	6	2516524	2516529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301249
47012	NC_007604	ATC	2	6	2516567	2516572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301249
47013	NC_007604	CGG	2	6	2516663	2516668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301249
47014	NC_007604	AGC	2	6	2516846	2516851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301249
47015	NC_007604	ACG	2	6	2516862	2516867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301249
47016	NC_007604	TGC	2	6	2516922	2516927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301249
47017	NC_007604	CAG	2	6	2517032	2517037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301249
47018	NC_007604	CTG	2	6	2517041	2517046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301249
47019	NC_007604	TGA	3	9	2517211	2517219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301249
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47021	NC_007604	G	6	6	2517323	2517328	0 %	0 %	100 %	0 %	81301249
47022	NC_007604	ATC	2	6	2517371	2517376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301249
47023	NC_007604	CGAT	2	8	2517411	2517418	25 %	25 %	25 %	25 %	81301249
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47027	NC_007604	AATC	2	8	2517535	2517542	50 %	25 %	0 %	25 %	81301249
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47030	NC_007604	AGCAA	2	10	2517789	2517798	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47031	NC_007604	CTT	2	6	2517891	2517896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301250
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47040	NC_007604	CATC	2	8	2518122	2518129	25 %	25 %	0 %	50 %	81301250
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47044	NC_007604	CGT	2	6	2518407	2518412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301250
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47049	NC_007604	TTG	2	6	2518717	2518722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301251
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47054	NC_007604	AGGA	2	8	2518879	2518886	50 %	0 %	50 %	0 %	81301251
47055	NC_007604	GCT	2	6	2518921	2518926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301251
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47058	NC_007604	GCCT	2	8	2519037	2519044	0 %	25 %	25 %	50 %	81301251
47059	NC_007604	CAG	2	6	2519109	2519114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301251
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47104	NC_007604	GTT	2	6	2521257	2521262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301253
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47109	NC_007604	CT	3	6	2521747	2521752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47110	NC_007604	TAAA	2	8	2521762	2521769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47111	NC_007604	ATA	2	6	2521819	2521824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47112	NC_007604	CTA	2	6	2521883	2521888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47113	NC_007604	CAA	2	6	2521893	2521898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47114	NC_007604	ATC	2	6	2521909	2521914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47118	NC_007604	TGGC	2	8	2522039	2522046	0 %	25 %	50 %	25 %	81301254
47119	NC_007604	T	6	6	2522124	2522129	0 %	100 %	0 %	0 %	81301254
47120	NC_007604	CTGC	2	8	2522132	2522139	0 %	25 %	25 %	50 %	81301254
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47122	NC_007604	GTA	2	6	2522274	2522279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301254
47123	NC_007604	AAG	2	6	2522290	2522295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301254
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47126	NC_007604	TGT	2	6	2522336	2522341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301254
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47128	NC_007604	T	7	7	2522492	2522498	0 %	100 %	0 %	0 %	81301254
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47138	NC_007604	ACTT	2	8	2522939	2522946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47139	NC_007604	AGGC	2	8	2522971	2522978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47140	NC_007604	GGGCTG	2	12	2523052	2523063	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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47142	NC_007604	GT	3	6	2523141	2523146	0 %	50 %	50 %	0 %	81301255
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47157	NC_007604	GCAA	2	8	2523894	2523901	50 %	0 %	25 %	25 %	81301255
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47164	NC_007604	GGCT	2	8	2524510	2524517	0 %	25 %	50 %	25 %	81301257
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47205	NC_007604	GGGA	2	8	2526866	2526873	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47206	NC_007604	GAAT	2	8	2526885	2526892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47207	NC_007604	CTAC	2	8	2526917	2526924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47208	NC_007604	TC	3	6	2526930	2526935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47209	NC_007604	CAA	2	6	2526970	2526975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47212	NC_007604	ATAGCC	2	12	2527048	2527059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81301259
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47224	NC_007604	GTCA	2	8	2527570	2527577	25 %	25 %	25 %	25 %	81301259
47225	NC_007604	TGT	2	6	2527590	2527595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301259
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47229	NC_007604	TCAAG	2	10	2527836	2527845	40 %	20 %	20 %	20 %	81301259
47230	NC_007604	GTTC	2	8	2527954	2527961	0 %	50 %	25 %	25 %	81301259
47231	NC_007604	TCA	2	6	2528045	2528050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301259
47232	NC_007604	CTGA	2	8	2528068	2528075	25 %	25 %	25 %	25 %	81301259
47233	NC_007604	CGC	2	6	2528112	2528117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301259
47234	NC_007604	T	6	6	2528161	2528166	0 %	100 %	0 %	0 %	81301259
47235	NC_007604	CAG	2	6	2528268	2528273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301259
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