MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_007604	TCT	2	6	2465794	2465799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301200
46002	NC_007604	TTCT	2	8	2465817	2465824	0 %	75 %	0 %	25 %	81301200
46003	NC_007604	TCT	2	6	2465868	2465873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46004	NC_007604	A	6	6	2465889	2465894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46005	NC_007604	ATT	2	6	2465989	2465994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46006	NC_007604	TTG	2	6	2466008	2466013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46007	NC_007604	A	6	6	2466014	2466019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46008	NC_007604	AATA	2	8	2466072	2466079	75 %	25 %	0 %	0 %	81301201
46009	NC_007604	GCCTT	2	10	2466110	2466119	0 %	40 %	20 %	40 %	81301201
46010	NC_007604	GAG	2	6	2466145	2466150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301201
46011	NC_007604	CTTGAA	2	12	2466165	2466176	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	81301201
46012	NC_007604	AAG	2	6	2466252	2466257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301201
46013	NC_007604	T	7	7	2466299	2466305	0 %	100 %	0 %	0 %	81301201
46014	NC_007604	AGT	2	6	2466350	2466355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301201
46015	NC_007604	ATC	2	6	2466416	2466421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301201
46016	NC_007604	A	8	8	2466572	2466579	100 %	0 %	0 %	0 %	81301201
46017	NC_007604	ATA	2	6	2466694	2466699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301201
46018	NC_007604	TA	3	6	2466724	2466729	50 %	50 %	0 %	0 %	81301201
46019	NC_007604	TCT	2	6	2466830	2466835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301201
46020	NC_007604	CAT	2	6	2466855	2466860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301201
46021	NC_007604	ATA	2	6	2466864	2466869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301201
46022	NC_007604	CCT	2	6	2466906	2466911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301201
46023	NC_007604	TGA	2	6	2466925	2466930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301201
46024	NC_007604	ATCT	2	8	2466986	2466993	25 %	50 %	0 %	25 %	81301201
46025	NC_007604	TCT	2	6	2466996	2467001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301201
46026	NC_007604	AT	3	6	2467021	2467026	50 %	50 %	0 %	0 %	81301201
46027	NC_007604	TAG	2	6	2467099	2467104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301201
46028	NC_007604	A	7	7	2467158	2467164	100 %	0 %	0 %	0 %	81301201
46029	NC_007604	GAAA	2	8	2467168	2467175	75 %	0 %	25 %	0 %	81301201
46030	NC_007604	AGAA	2	8	2467213	2467220	75 %	0 %	25 %	0 %	81301201
46031	NC_007604	TAA	2	6	2467241	2467246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301201
46032	NC_007604	T	6	6	2467290	2467295	0 %	100 %	0 %	0 %	81301201
46033	NC_007604	T	6	6	2467326	2467331	0 %	100 %	0 %	0 %	81301201
46034	NC_007604	ATC	2	6	2467351	2467356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301201
46035	NC_007604	ATT	2	6	2467459	2467464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81301201
46036	NC_007604	TGAT	2	8	2467465	2467472	25 %	50 %	25 %	0 %	81301201
46037	NC_007604	TA	3	6	2467524	2467529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46038	NC_007604	CTA	2	6	2467597	2467602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46039	NC_007604	TGA	2	6	2467619	2467624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46040	NC_007604	AGC	2	6	2467632	2467637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46041	NC_007604	GTT	2	6	2467672	2467677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46042	NC_007604	GTTCGC	2	12	2467694	2467705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46043	NC_007604	GTT	2	6	2467768	2467773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301202
46044	NC_007604	GCG	2	6	2467777	2467782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301202
46045	NC_007604	GCGATC	2	12	2467828	2467839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301202
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46047	NC_007604	GCC	2	6	2467937	2467942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301202
46048	NC_007604	GCA	2	6	2467945	2467950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46049	NC_007604	GCT	2	6	2467977	2467982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46050	NC_007604	AAG	2	6	2468082	2468087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301202
46051	NC_007604	TGA	2	6	2468134	2468139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301202
46052	NC_007604	CGT	2	6	2468179	2468184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46053	NC_007604	CGC	2	6	2468225	2468230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301202
46054	NC_007604	TGC	2	6	2468374	2468379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46055	NC_007604	CAA	2	6	2468413	2468418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301202
46056	NC_007604	CAA	2	6	2468599	2468604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301202
46057	NC_007604	GAGT	2	8	2468674	2468681	25 %	25 %	50 %	0 %	81301202
46058	NC_007604	TGG	2	6	2468682	2468687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301202
46059	NC_007604	CTG	2	6	2468690	2468695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
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46061	NC_007604	GAA	2	6	2468753	2468758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301202
46062	NC_007604	CT	3	6	2468766	2468771	0 %	50 %	0 %	50 %	81301202
46063	NC_007604	TCG	2	6	2468802	2468807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301202
46064	NC_007604	CTT	2	6	2468821	2468826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301202
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46067	NC_007604	GATC	2	8	2468956	2468963	25 %	25 %	25 %	25 %	81301202
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46101	NC_007604	CGCCTT	2	12	2470364	2470375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	81301203
46102	NC_007604	GCA	2	6	2470415	2470420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301203
46103	NC_007604	GTC	2	6	2470426	2470431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301203
46104	NC_007604	ACG	2	6	2470450	2470455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301203
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46112	NC_007604	TTC	2	6	2471078	2471083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301204
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46114	NC_007604	TGC	2	6	2471267	2471272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46115	NC_007604	ACA	2	6	2471280	2471285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46116	NC_007604	CCA	2	6	2471469	2471474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301205
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46118	NC_007604	ACG	2	6	2471578	2471583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301205
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46229	NC_007604	CGGA	2	8	2476872	2476879	25 %	0 %	50 %	25 %	81301211
46230	NC_007604	CCTTG	2	10	2476899	2476908	0 %	40 %	20 %	40 %	81301211
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46233	NC_007604	CGC	2	6	2477038	2477043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301211
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46235	NC_007604	CTGC	2	8	2477129	2477136	0 %	25 %	25 %	50 %	81301211
46236	NC_007604	TGC	2	6	2477184	2477189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46238	NC_007604	TTG	2	6	2477289	2477294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46351	NC_007604	TGGGA	2	10	2482973	2482982	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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46353	NC_007604	ATCG	2	8	2483084	2483091	25 %	25 %	25 %	25 %	81301219
46354	NC_007604	TGG	2	6	2483172	2483177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301219
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46459	NC_007604	CGG	2	6	2488599	2488604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301225
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46462	NC_007604	CGACC	2	10	2488643	2488652	20 %	0 %	20 %	60 %	81301225
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46465	NC_007604	GGA	2	6	2488779	2488784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301225
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46467	NC_007604	GTC	2	6	2488881	2488886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301225
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46471	NC_007604	ACC	3	9	2489083	2489091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301225
46472	NC_007604	AGCC	2	8	2489096	2489103	25 %	0 %	25 %	50 %	81301225
46473	NC_007604	TCG	2	6	2489143	2489148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301225
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46475	NC_007604	TTTA	2	8	2489233	2489240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46480	NC_007604	GCG	2	6	2489471	2489476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301226
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