MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_007604	GCTTG	2	10	2439204	2439213	0 %	40 %	40 %	20 %	81301180
45502	NC_007604	ATCA	2	8	2439245	2439252	50 %	25 %	0 %	25 %	81301180
45503	NC_007604	GTC	2	6	2439312	2439317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45504	NC_007604	CAC	2	6	2439341	2439346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301181
45505	NC_007604	TCA	2	6	2439405	2439410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301181
45506	NC_007604	CGC	2	6	2439437	2439442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301181
45507	NC_007604	GCC	2	6	2439474	2439479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301181
45508	NC_007604	GCACCA	2	12	2439565	2439576	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	81301181
45509	NC_007604	CTG	3	9	2439676	2439684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45510	NC_007604	TGCT	2	8	2439692	2439699	0 %	50 %	25 %	25 %	81301181
45511	NC_007604	CAA	2	6	2439784	2439789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301181
45512	NC_007604	CG	3	6	2439818	2439823	0 %	0 %	50 %	50 %	81301181
45513	NC_007604	CTG	2	6	2439931	2439936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45514	NC_007604	GCA	2	6	2439991	2439996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45515	NC_007604	CGAT	2	8	2440021	2440028	25 %	25 %	25 %	25 %	81301181
45516	NC_007604	GCCA	2	8	2440059	2440066	25 %	0 %	25 %	50 %	81301181
45517	NC_007604	GTT	2	6	2440186	2440191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301181
45518	NC_007604	CCG	2	6	2440204	2440209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301181
45519	NC_007604	ATCA	2	8	2440217	2440224	50 %	25 %	0 %	25 %	81301181
45520	NC_007604	GCA	2	6	2440252	2440257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45521	NC_007604	GCC	2	6	2440292	2440297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301181
45522	NC_007604	AGC	2	6	2440302	2440307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45523	NC_007604	GCA	2	6	2440330	2440335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301181
45524	NC_007604	GTCGAG	2	12	2440444	2440455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	81301182
45525	NC_007604	GCC	2	6	2440481	2440486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301182
45526	NC_007604	CTG	2	6	2440502	2440507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45527	NC_007604	AGC	2	6	2440515	2440520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45528	NC_007604	GC	4	8	2440544	2440551	0 %	0 %	50 %	50 %	81301182
45529	NC_007604	GCC	2	6	2440582	2440587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301182
45530	NC_007604	CAA	2	6	2440594	2440599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301182
45531	NC_007604	GCC	2	6	2440634	2440639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301182
45532	NC_007604	CGA	2	6	2440668	2440673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45533	NC_007604	GCC	2	6	2440804	2440809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301182
45534	NC_007604	CTT	2	6	2440845	2440850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301182
45535	NC_007604	TCCTG	2	10	2440955	2440964	0 %	40 %	20 %	40 %	81301182
45536	NC_007604	GACG	2	8	2440990	2440997	25 %	0 %	50 %	25 %	81301182
45537	NC_007604	CGAG	2	8	2441015	2441022	25 %	0 %	50 %	25 %	81301182
45538	NC_007604	AGC	2	6	2441089	2441094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45539	NC_007604	GCG	2	6	2441099	2441104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301182
45540	NC_007604	CTG	2	6	2441134	2441139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45541	NC_007604	CTG	2	6	2441218	2441223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45542	NC_007604	CTG	2	6	2441269	2441274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45543	NC_007604	GTC	2	6	2441294	2441299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301182
45544	NC_007604	GTTT	2	8	2441421	2441428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45545	NC_007604	CAC	2	6	2441473	2441478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301183
45546	NC_007604	TGGC	2	8	2441517	2441524	0 %	25 %	50 %	25 %	81301183
45547	NC_007604	GAG	2	6	2441555	2441560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301183
45548	NC_007604	ACG	2	6	2441565	2441570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45549	NC_007604	ACA	2	6	2441586	2441591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301183
45550	NC_007604	CAG	2	6	2441663	2441668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45551	NC_007604	TG	3	6	2441696	2441701	0 %	50 %	50 %	0 %	81301183
45552	NC_007604	GCA	2	6	2441704	2441709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45553	NC_007604	GCG	2	6	2441728	2441733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301183
45554	NC_007604	TCGCC	2	10	2441776	2441785	0 %	20 %	20 %	60 %	81301183
45555	NC_007604	GTC	2	6	2441819	2441824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45556	NC_007604	GAA	2	6	2441831	2441836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301183
45557	NC_007604	GCCGC	2	10	2441863	2441872	0 %	0 %	40 %	60 %	81301183
45558	NC_007604	AACG	2	8	2441915	2441922	50 %	0 %	25 %	25 %	81301183
45559	NC_007604	GTG	2	6	2441936	2441941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301183
45560	NC_007604	CGG	2	6	2441976	2441981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301183
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45562	NC_007604	GCT	2	6	2442034	2442039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45563	NC_007604	CTA	2	6	2442168	2442173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301183
45564	NC_007604	ACG	2	6	2442270	2442275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45565	NC_007604	CAT	2	6	2442343	2442348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301183
45566	NC_007604	GCG	2	6	2442356	2442361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301183
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45569	NC_007604	CGG	2	6	2442462	2442467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301183
45570	NC_007604	CAG	2	6	2442492	2442497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45571	NC_007604	TCGC	2	8	2442583	2442590	0 %	25 %	25 %	50 %	81301183
45572	NC_007604	GAA	2	6	2442611	2442616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301183
45573	NC_007604	CAG	2	6	2442650	2442655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301183
45574	NC_007604	TCT	2	6	2442687	2442692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301183
45575	NC_007604	GGC	2	6	2442790	2442795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301183
45576	NC_007604	GGA	2	6	2442823	2442828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45577	NC_007604	GCA	2	6	2442840	2442845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301184
45578	NC_007604	GGCG	2	8	2442867	2442874	0 %	0 %	75 %	25 %	81301184
45579	NC_007604	CGG	3	9	2442904	2442912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301184
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45581	NC_007604	GGC	2	6	2442987	2442992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301184
45582	NC_007604	GTG	2	6	2443000	2443005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301184
45583	NC_007604	CCAA	2	8	2443027	2443034	50 %	0 %	0 %	50 %	81301184
45584	NC_007604	CAG	2	6	2443078	2443083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301184
45585	NC_007604	GCT	2	6	2443154	2443159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301184
45586	NC_007604	TCT	2	6	2443297	2443302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301184
45587	NC_007604	TCG	2	6	2443389	2443394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301184
45588	NC_007604	GCC	2	6	2443434	2443439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301184
45589	NC_007604	GCT	2	6	2443449	2443454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301184
45590	NC_007604	CTACGA	2	12	2443580	2443591	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81301184
45591	NC_007604	CGG	2	6	2443642	2443647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301184
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45597	NC_007604	GTGGC	2	10	2443822	2443831	0 %	20 %	60 %	20 %	81301184
45598	NC_007604	TGC	2	6	2443885	2443890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301185
45599	NC_007604	GCT	2	6	2443910	2443915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301185
45600	NC_007604	GGCTT	2	10	2443929	2443938	0 %	40 %	40 %	20 %	81301185
45601	NC_007604	GAAT	2	8	2443949	2443956	50 %	25 %	25 %	0 %	81301185
45602	NC_007604	ATG	2	6	2444011	2444016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301185
45603	NC_007604	CGAT	2	8	2444095	2444102	25 %	25 %	25 %	25 %	81301185
45604	NC_007604	GTT	2	6	2444144	2444149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301185
45605	NC_007604	CGG	2	6	2444179	2444184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301185
45606	NC_007604	GTG	2	6	2444313	2444318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45607	NC_007604	CGC	2	6	2444441	2444446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301186
45608	NC_007604	ATC	2	6	2444481	2444486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301186
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45611	NC_007604	GCCA	2	8	2444663	2444670	25 %	0 %	25 %	50 %	81301186
45612	NC_007604	ATC	2	6	2444676	2444681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301186
45613	NC_007604	GTC	2	6	2444724	2444729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301186
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45617	NC_007604	AACC	2	8	2445152	2445159	50 %	0 %	0 %	50 %	81301186
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45621	NC_007604	ACT	2	6	2445374	2445379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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45722	NC_007604	CGGTA	2	10	2450900	2450909	20 %	20 %	40 %	20 %	81301192
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45730	NC_007604	A	7	7	2451306	2451312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45731	NC_007604	TGG	2	6	2451323	2451328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45732	NC_007604	CCT	2	6	2451388	2451393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301193
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45966	NC_007604	GGC	2	6	2464279	2464284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301199
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45969	NC_007604	CACCT	2	10	2464396	2464405	20 %	20 %	0 %	60 %	81301199
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45972	NC_007604	CGT	2	6	2464450	2464455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301199
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45981	NC_007604	TCG	2	6	2464894	2464899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301199
45982	NC_007604	CAG	2	6	2464936	2464941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301199
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45987	NC_007604	CGG	2	6	2465175	2465180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45988	NC_007604	TTA	2	6	2465258	2465263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81301200
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45991	NC_007604	TTG	2	6	2465499	2465504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301200
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45995	NC_007604	AG	3	6	2465609	2465614	50 %	0 %	50 %	0 %	81301200
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45999	NC_007604	GCA	2	6	2465750	2465755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301200
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