MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_007604	CGGT	2	8	2384141	2384148	0 %	25 %	50 %	25 %	81301124
44503	NC_007604	GGC	2	6	2384332	2384337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301124
44504	NC_007604	CGG	2	6	2384352	2384357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301124
44505	NC_007604	CAA	2	6	2384397	2384402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301124
44506	NC_007604	CGG	2	6	2384418	2384423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301124
44507	NC_007604	CGG	2	6	2384436	2384441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301124
44508	NC_007604	CGA	2	6	2384505	2384510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301124
44509	NC_007604	GCC	2	6	2384562	2384567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301124
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44512	NC_007604	ACT	2	6	2384700	2384705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301124
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44514	NC_007604	TGAC	2	8	2384840	2384847	25 %	25 %	25 %	25 %	81301124
44515	NC_007604	ACC	2	6	2384860	2384865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301124
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44517	NC_007604	CGG	2	6	2384927	2384932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301124
44518	NC_007604	CGA	2	6	2384954	2384959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301124
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44527	NC_007604	CCGA	2	8	2385423	2385430	25 %	0 %	25 %	50 %	81301125
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44532	NC_007604	TGGC	2	8	2385563	2385570	0 %	25 %	50 %	25 %	81301125
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44543	NC_007604	CCT	2	6	2385874	2385879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44544	NC_007604	AG	3	6	2385906	2385911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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44546	NC_007604	GACTC	2	10	2386069	2386078	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44547	NC_007604	C	6	6	2386085	2386090	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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44602	NC_007604	GGCT	2	8	2388959	2388966	0 %	25 %	50 %	25 %	81301127
44603	NC_007604	CCA	2	6	2389004	2389009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301127
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44605	NC_007604	TGC	3	9	2389134	2389142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301127
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44608	NC_007604	CGC	2	6	2389292	2389297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301127
44609	NC_007604	TGGG	2	8	2389308	2389315	0 %	25 %	75 %	0 %	81301127
44610	NC_007604	CTG	3	9	2389334	2389342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301127
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44616	NC_007604	GCAG	2	8	2389653	2389660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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44737	NC_007604	CTG	3	9	2396191	2396199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301138
44738	NC_007604	CAG	2	6	2396202	2396207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301138
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44798	NC_007604	T	6	6	2399909	2399914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44799	NC_007604	GTG	2	6	2399915	2399920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44800	NC_007604	AG	3	6	2400018	2400023	50 %	0 %	50 %	0 %	81301142
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44831	NC_007604	CCGCA	2	10	2401957	2401966	20 %	0 %	20 %	60 %	81301143
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44836	NC_007604	CAG	2	6	2402124	2402129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301143
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44852	NC_007604	AGA	2	6	2403462	2403467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301144
44853	NC_007604	TCG	2	6	2403486	2403491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301144
44854	NC_007604	CGC	2	6	2403504	2403509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301144
44855	NC_007604	ATCGAC	2	12	2403536	2403547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81301144
44856	NC_007604	AGC	2	6	2403576	2403581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301144
44857	NC_007604	GTA	2	6	2403614	2403619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301144
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44859	NC_007604	CAT	2	6	2403760	2403765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301144
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44862	NC_007604	CGC	2	6	2403833	2403838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301144
44863	NC_007604	GTG	2	6	2403897	2403902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301144
44864	NC_007604	GTG	2	6	2403939	2403944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81301144
44865	NC_007604	CTT	2	6	2404024	2404029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44866	NC_007604	TGC	2	6	2404059	2404064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44867	NC_007604	GCT	2	6	2404236	2404241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301145
44868	NC_007604	GTCC	2	8	2404283	2404290	0 %	25 %	25 %	50 %	81301145
44869	NC_007604	CAG	2	6	2404303	2404308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301145
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44871	NC_007604	CCT	2	6	2404395	2404400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44872	NC_007604	AAGC	2	8	2404433	2404440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44873	NC_007604	GGCA	2	8	2404609	2404616	25 %	0 %	50 %	25 %	81301146
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44877	NC_007604	TTG	2	6	2404907	2404912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81301146
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44880	NC_007604	G	6	6	2405070	2405075	0 %	0 %	100 %	0 %	81301146
44881	NC_007604	GAA	2	6	2405080	2405085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301146
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44884	NC_007604	GGACG	2	10	2405312	2405321	20 %	0 %	60 %	20 %	81301146
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44888	NC_007604	A	6	6	2405570	2405575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44889	NC_007604	CTG	2	6	2405662	2405667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44890	NC_007604	TCC	2	6	2405695	2405700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44891	NC_007604	CTG	2	6	2405853	2405858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301147
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44932	NC_007604	GTAA	2	8	2407867	2407874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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44963	NC_007604	A	6	6	2409192	2409197	100 %	0 %	0 %	0 %	81301149
44964	NC_007604	GCG	2	6	2409214	2409219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301149
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44966	NC_007604	AGC	2	6	2409292	2409297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301150
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44969	NC_007604	TGC	2	6	2409415	2409420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301150
44970	NC_007604	GGC	2	6	2409454	2409459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301150
44971	NC_007604	GGCT	2	8	2409468	2409475	0 %	25 %	50 %	25 %	81301150
44972	NC_007604	TGC	2	6	2409514	2409519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301150
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44976	NC_007604	CTAC	2	8	2409701	2409708	25 %	25 %	0 %	50 %	81301150
44977	NC_007604	CTG	2	6	2409733	2409738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301150
44978	NC_007604	GCTTC	2	10	2409815	2409824	0 %	40 %	20 %	40 %	81301150
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44982	NC_007604	AAT	2	6	2410161	2410166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44983	NC_007604	CCTGA	2	10	2410178	2410187	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44984	NC_007604	CT	3	6	2410291	2410296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44985	NC_007604	TCA	2	6	2410328	2410333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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44987	NC_007604	CGCAA	2	10	2410398	2410407	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44988	NC_007604	A	7	7	2410406	2410412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44995	NC_007604	CGG	2	6	2410841	2410846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301151
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