MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_007604	TCA	2	6	2280299	2280304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301008
42502	NC_007604	TGA	2	6	2280315	2280320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301008
42503	NC_007604	GAG	2	6	2280376	2280381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301008
42504	NC_007604	CCA	2	6	2280453	2280458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301008
42505	NC_007604	CAG	2	6	2280484	2280489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301008
42506	NC_007604	TGTGCA	2	12	2280501	2280512	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81301008
42507	NC_007604	CAA	2	6	2280516	2280521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301008
42508	NC_007604	GCT	2	6	2280642	2280647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301009
42509	NC_007604	GCA	2	6	2280648	2280653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301009
42510	NC_007604	CCG	2	6	2280663	2280668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301009
42511	NC_007604	ATC	2	6	2280725	2280730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301009
42512	NC_007604	CAG	2	6	2280799	2280804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301009
42513	NC_007604	GCA	2	6	2280815	2280820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301009
42514	NC_007604	CG	3	6	2280886	2280891	0 %	0 %	50 %	50 %	81301009
42515	NC_007604	CCA	2	6	2280945	2280950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301009
42516	NC_007604	CCTG	2	8	2280959	2280966	0 %	25 %	25 %	50 %	81301009
42517	NC_007604	GCA	2	6	2281060	2281065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301009
42518	NC_007604	TGC	2	6	2281094	2281099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42519	NC_007604	TTG	2	6	2281187	2281192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42520	NC_007604	GA	4	8	2281202	2281209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42521	NC_007604	TGC	2	6	2281259	2281264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42522	NC_007604	TC	3	6	2281282	2281287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42523	NC_007604	ACA	2	6	2281490	2281495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301010
42524	NC_007604	ATC	3	9	2281532	2281540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301010
42525	NC_007604	CAA	2	6	2281644	2281649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81301010
42526	NC_007604	GCAG	2	8	2281709	2281716	25 %	0 %	50 %	25 %	81301010
42527	NC_007604	CGTGA	2	10	2281720	2281729	20 %	20 %	40 %	20 %	81301010
42528	NC_007604	AGAC	2	8	2281765	2281772	50 %	0 %	25 %	25 %	81301010
42529	NC_007604	GGTGC	2	10	2281782	2281791	0 %	20 %	60 %	20 %	81301010
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42533	NC_007604	GCG	2	6	2281956	2281961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301010
42534	NC_007604	CG	3	6	2281960	2281965	0 %	0 %	50 %	50 %	81301010
42535	NC_007604	GA	3	6	2282113	2282118	50 %	0 %	50 %	0 %	81301010
42536	NC_007604	TCG	2	6	2282213	2282218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301010
42537	NC_007604	GATC	2	8	2282227	2282234	25 %	25 %	25 %	25 %	81301010
42538	NC_007604	CAG	3	9	2282236	2282244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301010
42539	NC_007604	GAC	2	6	2282377	2282382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301010
42540	NC_007604	GTTG	2	8	2282516	2282523	0 %	50 %	50 %	0 %	81301010
42541	NC_007604	ACC	2	6	2282553	2282558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42542	NC_007604	GGC	2	6	2282727	2282732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301011
42543	NC_007604	CCTG	2	8	2282794	2282801	0 %	25 %	25 %	50 %	81301011
42544	NC_007604	G	7	7	2282967	2282973	0 %	0 %	100 %	0 %	81301011
42545	NC_007604	TGA	2	6	2283063	2283068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301011
42546	NC_007604	CAG	2	6	2283088	2283093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301011
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42548	NC_007604	GCT	2	6	2283193	2283198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301012
42549	NC_007604	TCTTGA	2	12	2283199	2283210	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	81301012
42550	NC_007604	GGTC	2	8	2283320	2283327	0 %	25 %	50 %	25 %	81301012
42551	NC_007604	CGC	2	6	2283394	2283399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301012
42552	NC_007604	CTG	2	6	2283417	2283422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301012
42553	NC_007604	GC	3	6	2283451	2283456	0 %	0 %	50 %	50 %	81301012
42554	NC_007604	CG	3	6	2283468	2283473	0 %	0 %	50 %	50 %	81301012
42555	NC_007604	ACC	2	6	2283576	2283581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301012
42556	NC_007604	GTC	2	6	2283601	2283606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301012
42557	NC_007604	GATC	2	8	2283623	2283630	25 %	25 %	25 %	25 %	81301012
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42570	NC_007604	CGA	2	6	2284155	2284160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301012
42571	NC_007604	CA	3	6	2284296	2284301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42572	NC_007604	CTTGG	2	10	2284403	2284412	0 %	40 %	40 %	20 %	81301013
42573	NC_007604	AAG	2	6	2284440	2284445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301013
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42592	NC_007604	GTGACC	2	12	2285321	2285332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301015
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42602	NC_007604	TAGC	2	8	2286062	2286069	25 %	25 %	25 %	25 %	81301016
42603	NC_007604	GC	3	6	2286076	2286081	0 %	0 %	50 %	50 %	81301016
42604	NC_007604	GCG	2	6	2286107	2286112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301016
42605	NC_007604	GAC	2	6	2286135	2286140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301016
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42614	NC_007604	AG	3	6	2286700	2286705	50 %	0 %	50 %	0 %	81301017
42615	NC_007604	AAAC	2	8	2286790	2286797	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42616	NC_007604	ACC	2	6	2286858	2286863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301018
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42972	NC_007604	TCAA	2	8	2304884	2304891	50 %	25 %	0 %	25 %	81301047
42973	NC_007604	TAA	2	6	2304909	2304914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301047
42974	NC_007604	TCA	2	6	2305001	2305006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301047
42975	NC_007604	GGA	2	6	2305033	2305038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81301047
42976	NC_007604	CACT	2	8	2305066	2305073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42977	NC_007604	TTA	2	6	2305113	2305118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42978	NC_007604	AAGG	2	8	2305131	2305138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42979	NC_007604	GCT	2	6	2305282	2305287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301048
42980	NC_007604	GA	3	6	2305299	2305304	50 %	0 %	50 %	0 %	81301048
42981	NC_007604	ACCG	2	8	2305441	2305448	25 %	0 %	25 %	50 %	81301048
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42985	NC_007604	TTCTG	2	10	2305917	2305926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42986	NC_007604	GTCAC	2	10	2305950	2305959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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43000	NC_007604	GGC	2	6	2306606	2306611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301050

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