MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42122	NC_007604	CAG	2	6	2258351	2258356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300987
42123	NC_007604	CTG	2	6	2258410	2258415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42124	NC_007604	CGC	2	6	2258463	2258468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300988
42125	NC_007604	CGT	2	6	2258523	2258528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300988
42126	NC_007604	GAC	2	6	2258564	2258569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300988
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42146	NC_007604	CCG	2	6	2259470	2259475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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42214	NC_007604	CAG	3	9	2262485	2262493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42215	NC_007604	TGCGGG	2	12	2262657	2262668	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	81300993
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42220	NC_007604	CCCAGC	2	12	2263016	2263027	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	81300993
42221	NC_007604	CGAT	2	8	2263146	2263153	25 %	25 %	25 %	25 %	81300993
42222	NC_007604	CAT	2	6	2263189	2263194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300993
42223	NC_007604	CTG	2	6	2263250	2263255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300993
42224	NC_007604	ACCC	2	8	2263292	2263299	25 %	0 %	0 %	75 %	81300993
42225	NC_007604	GATCGC	2	12	2263300	2263311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81300993
42226	NC_007604	GTC	2	6	2263395	2263400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42227	NC_007604	ATC	2	6	2263427	2263432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300994
42228	NC_007604	CTG	2	6	2263451	2263456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300994
42229	NC_007604	GACC	2	8	2263531	2263538	25 %	0 %	25 %	50 %	81300994
42230	NC_007604	CGG	2	6	2263546	2263551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300994
42231	NC_007604	T	6	6	2263574	2263579	0 %	100 %	0 %	0 %	81300994
42232	NC_007604	TCAA	2	8	2263770	2263777	50 %	25 %	0 %	25 %	81300994
42233	NC_007604	GCCTGG	2	12	2263781	2263792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	81300994
42234	NC_007604	GCTG	2	8	2263858	2263865	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42235	NC_007604	CGCTG	2	10	2263879	2263888	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42236	NC_007604	CA	3	6	2264039	2264044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42237	NC_007604	ATTGG	2	10	2264083	2264092	20 %	40 %	40 %	0 %	81300995
42238	NC_007604	GGC	2	6	2264103	2264108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300995
42239	NC_007604	CG	3	6	2264126	2264131	0 %	0 %	50 %	50 %	81300995
42240	NC_007604	CAGG	2	8	2264226	2264233	25 %	0 %	50 %	25 %	81300995
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42244	NC_007604	TGC	2	6	2264470	2264475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300995
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42347	NC_007604	ATC	2	6	2270765	2270770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301001
42348	NC_007604	ACA	2	6	2270904	2270909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42349	NC_007604	GCCAA	2	10	2270910	2270919	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42350	NC_007604	TTC	2	6	2270942	2270947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42351	NC_007604	GAG	2	6	2270956	2270961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42352	NC_007604	TGC	3	9	2271022	2271030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301002
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42355	NC_007604	A	6	6	2271304	2271309	100 %	0 %	0 %	0 %	81301002
42356	NC_007604	CTG	2	6	2271351	2271356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301002
42357	NC_007604	AGC	2	6	2271406	2271411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301002
42358	NC_007604	GCCA	2	8	2271451	2271458	25 %	0 %	25 %	50 %	81301002
42359	NC_007604	GCA	2	6	2271536	2271541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301002
42360	NC_007604	AGCCC	2	10	2271634	2271643	20 %	0 %	20 %	60 %	81301002
42361	NC_007604	AGCC	2	8	2271669	2271676	25 %	0 %	25 %	50 %	81301002
42362	NC_007604	ACG	2	6	2271678	2271683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301002
42363	NC_007604	CAGTTG	2	12	2271693	2271704	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81301002
42364	NC_007604	CTG	2	6	2271705	2271710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301002
42365	NC_007604	AGT	2	6	2271712	2271717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81301002
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42369	NC_007604	GTTC	2	8	2272033	2272040	0 %	50 %	25 %	25 %	81301002
42370	NC_007604	CTT	2	6	2272082	2272087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301002
42371	NC_007604	TCT	2	6	2272111	2272116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301002
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42373	NC_007604	GCA	2	6	2272211	2272216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301002
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42377	NC_007604	GCA	2	6	2272645	2272650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301002
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42380	NC_007604	CCA	2	6	2272832	2272837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81301003
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42383	NC_007604	CG	3	6	2272888	2272893	0 %	0 %	50 %	50 %	81301003
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42388	NC_007604	GC	3	6	2273259	2273264	0 %	0 %	50 %	50 %	81301004
42389	NC_007604	ACT	2	6	2273279	2273284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301004
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42392	NC_007604	CGC	2	6	2273366	2273371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301004
42393	NC_007604	GCT	2	6	2273381	2273386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301004
42394	NC_007604	CGC	2	6	2273392	2273397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81301004
42395	NC_007604	ATCGC	2	10	2273450	2273459	20 %	20 %	20 %	40 %	81301004
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42406	NC_007604	ATCGCG	2	12	2274094	2274105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81301004
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42410	NC_007604	GGC	3	9	2274221	2274229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301004
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42426	NC_007604	AAT	2	6	2275255	2275260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81301005
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42430	NC_007604	TGGC	2	8	2275436	2275443	0 %	25 %	50 %	25 %	81301005
42431	NC_007604	CTT	2	6	2275464	2275469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301005
42432	NC_007604	GCT	2	6	2275485	2275490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301005
42433	NC_007604	GC	3	6	2275497	2275502	0 %	0 %	50 %	50 %	81301005
42434	NC_007604	CGCC	2	8	2275534	2275541	0 %	0 %	25 %	75 %	81301005
42435	NC_007604	CTA	2	6	2275604	2275609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42440	NC_007604	CGT	2	6	2275811	2275816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301006
42441	NC_007604	CGGT	2	8	2275909	2275916	0 %	25 %	50 %	25 %	81301006
42442	NC_007604	ACG	2	6	2275939	2275944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301006
42443	NC_007604	CG	3	6	2275990	2275995	0 %	0 %	50 %	50 %	81301006
42444	NC_007604	CGT	2	6	2276063	2276068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301006
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42453	NC_007604	CGT	2	6	2277259	2277264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301007
42454	NC_007604	CTG	2	6	2277324	2277329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81301007
42455	NC_007604	ATTG	2	8	2277400	2277407	25 %	50 %	25 %	0 %	81301007
42456	NC_007604	CTC	2	6	2277418	2277423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81301007
42457	NC_007604	CGAG	2	8	2277424	2277431	25 %	0 %	50 %	25 %	81301007
42458	NC_007604	CTT	2	6	2277470	2277475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301007
42459	NC_007604	CTA	2	6	2277592	2277597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81301007
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42461	NC_007604	GGC	3	9	2277769	2277777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81301007
42462	NC_007604	TTC	2	6	2277815	2277820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81301007
42463	NC_007604	CGA	2	6	2277825	2277830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301007
42464	NC_007604	AAG	2	6	2277872	2277877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81301007
42465	NC_007604	AGTT	2	8	2277902	2277909	25 %	50 %	25 %	0 %	81301007
42466	NC_007604	CAG	2	6	2278047	2278052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81301008
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42478	NC_007604	GATC	2	8	2278782	2278789	25 %	25 %	25 %	25 %	81301008
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