MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_007604	GGAA	2	8	2223826	2223833	50 %	0 %	50 %	0 %	81300948
41502	NC_007604	T	6	6	2223887	2223892	0 %	100 %	0 %	0 %	81300948
41503	NC_007604	AT	3	6	2223913	2223918	50 %	50 %	0 %	0 %	81300948
41504	NC_007604	AAGC	2	8	2223986	2223993	50 %	0 %	25 %	25 %	81300948
41505	NC_007604	TGG	2	6	2223994	2223999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300948
41506	NC_007604	AAC	2	6	2224023	2224028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300948
41507	NC_007604	GA	3	6	2224198	2224203	50 %	0 %	50 %	0 %	81300948
41508	NC_007604	ACCG	2	8	2224228	2224235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41509	NC_007604	GA	3	6	2224259	2224264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41510	NC_007604	GAG	2	6	2224323	2224328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300949
41511	NC_007604	AAC	2	6	2224381	2224386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300949
41512	NC_007604	GAC	2	6	2224428	2224433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300949
41513	NC_007604	TG	3	6	2224486	2224491	0 %	50 %	50 %	0 %	81300949
41514	NC_007604	GA	3	6	2224633	2224638	50 %	0 %	50 %	0 %	81300949
41515	NC_007604	AGC	2	6	2224777	2224782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41516	NC_007604	GCTA	2	8	2224816	2224823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41517	NC_007604	TAC	2	6	2224854	2224859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41518	NC_007604	ACGGCT	2	12	2224867	2224878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41519	NC_007604	GCA	2	6	2224977	2224982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41520	NC_007604	GAAAC	2	10	2224993	2225002	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41521	NC_007604	TCA	2	6	2225035	2225040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41522	NC_007604	CAA	2	6	2225055	2225060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41523	NC_007604	GCT	2	6	2225116	2225121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41524	NC_007604	TCAA	2	8	2225186	2225193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41525	NC_007604	TGT	2	6	2225210	2225215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41526	NC_007604	GTT	2	6	2225263	2225268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41527	NC_007604	T	7	7	2225325	2225331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41528	NC_007604	CGA	2	6	2225340	2225345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41529	NC_007604	TGT	3	9	2225385	2225393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41530	NC_007604	ATCC	2	8	2225434	2225441	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41531	NC_007604	GAA	2	6	2225508	2225513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41532	NC_007604	TGC	2	6	2225520	2225525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41533	NC_007604	CAA	2	6	2225571	2225576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41534	NC_007604	TGTCG	2	10	2225604	2225613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41535	NC_007604	T	6	6	2225664	2225669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41536	NC_007604	TTA	2	6	2225709	2225714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41537	NC_007604	AC	4	8	2225735	2225742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41538	NC_007604	GAT	2	6	2225802	2225807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41539	NC_007604	CAC	2	6	2225819	2225824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41540	NC_007604	CAA	2	6	2225881	2225886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41541	NC_007604	GTCGC	2	10	2225937	2225946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41542	NC_007604	TAGC	2	8	2225958	2225965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41543	NC_007604	ACA	2	6	2225993	2225998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41544	NC_007604	AAG	2	6	2226170	2226175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300950
41545	NC_007604	CGC	2	6	2226187	2226192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300950
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41548	NC_007604	GCC	2	6	2226471	2226476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300950
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41552	NC_007604	TGA	2	6	2226644	2226649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300951
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41554	NC_007604	GCGG	2	8	2226709	2226716	0 %	0 %	75 %	25 %	81300951
41555	NC_007604	GCA	2	6	2226742	2226747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300951
41556	NC_007604	ATCC	2	8	2226927	2226934	25 %	25 %	0 %	50 %	81300952
41557	NC_007604	ACC	2	6	2226935	2226940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300952
41558	NC_007604	GGC	2	6	2227010	2227015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300952
41559	NC_007604	GTCG	2	8	2227130	2227137	0 %	25 %	50 %	25 %	81300952
41560	NC_007604	TAC	2	6	2227175	2227180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300952
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41563	NC_007604	GAT	2	6	2227585	2227590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300952
41564	NC_007604	GGC	2	6	2227652	2227657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300952
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41566	NC_007604	GCC	2	6	2227793	2227798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300952
41567	NC_007604	GATG	2	8	2227939	2227946	25 %	25 %	50 %	0 %	81300952
41568	NC_007604	TAC	2	6	2227961	2227966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300952
41569	NC_007604	CAT	2	6	2228023	2228028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300952
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41571	NC_007604	ACA	2	6	2228221	2228226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41572	NC_007604	T	6	6	2228291	2228296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41573	NC_007604	C	6	6	2228384	2228389	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41574	NC_007604	CAA	2	6	2228392	2228397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41575	NC_007604	GCG	2	6	2228424	2228429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41576	NC_007604	TGC	2	6	2228607	2228612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300953
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41578	NC_007604	GCTC	2	8	2228818	2228825	0 %	25 %	25 %	50 %	81300953
41579	NC_007604	C	6	6	2228825	2228830	0 %	0 %	0 %	100 %	81300953
41580	NC_007604	CAAGC	2	10	2228863	2228872	40 %	0 %	20 %	40 %	81300953
41581	NC_007604	TGAC	2	8	2228879	2228886	25 %	25 %	25 %	25 %	81300953
41582	NC_007604	TGC	2	6	2228896	2228901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300953
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41587	NC_007604	CAG	2	6	2229134	2229139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300954
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41589	NC_007604	GCA	2	6	2229222	2229227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300954
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41592	NC_007604	GCT	2	6	2229423	2229428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300954
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41594	NC_007604	GTA	2	6	2229530	2229535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300954
41595	NC_007604	CAG	2	6	2229604	2229609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300954
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41602	NC_007604	GCA	2	6	2229784	2229789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300954
41603	NC_007604	GCT	2	6	2229807	2229812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300954
41604	NC_007604	GCT	2	6	2229828	2229833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300954
41605	NC_007604	CGCGAT	2	12	2229838	2229849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81300954
41606	NC_007604	CAT	2	6	2229933	2229938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41607	NC_007604	TTCC	2	8	2230040	2230047	0 %	50 %	0 %	50 %	81300955
41608	NC_007604	ACA	2	6	2230251	2230256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300955
41609	NC_007604	GCA	2	6	2230305	2230310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300955
41610	NC_007604	TGG	2	6	2230329	2230334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300956
41611	NC_007604	CTT	2	6	2230396	2230401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300956
41612	NC_007604	CAG	2	6	2230402	2230407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300956
41613	NC_007604	ACT	2	6	2230420	2230425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300956
41614	NC_007604	TGAG	2	8	2230638	2230645	25 %	25 %	50 %	0 %	81300956
41615	NC_007604	TCGA	2	8	2230656	2230663	25 %	25 %	25 %	25 %	81300956
41616	NC_007604	TGAG	2	8	2230757	2230764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41617	NC_007604	GCC	2	6	2230774	2230779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41618	NC_007604	GGT	2	6	2230870	2230875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300957
41619	NC_007604	CCG	2	6	2230905	2230910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300957
41620	NC_007604	CGCTG	2	10	2230959	2230968	0 %	20 %	40 %	40 %	81300957
41621	NC_007604	GTC	2	6	2230983	2230988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300957
41622	NC_007604	CGC	2	6	2231041	2231046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300957
41623	NC_007604	CGAT	2	8	2231082	2231089	25 %	25 %	25 %	25 %	81300957
41624	NC_007604	GCG	2	6	2231126	2231131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300957
41625	NC_007604	GCG	2	6	2231171	2231176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300957
41626	NC_007604	CTG	2	6	2231186	2231191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300957
41627	NC_007604	CGC	2	6	2231213	2231218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300957
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41630	NC_007604	CGT	3	9	2231335	2231343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300957
41631	NC_007604	GCG	2	6	2231356	2231361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300957
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41634	NC_007604	TGG	2	6	2231500	2231505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300957
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41637	NC_007604	AGCA	2	8	2231556	2231563	50 %	0 %	25 %	25 %	81300957
41638	NC_007604	ACT	2	6	2231569	2231574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300957
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41650	NC_007604	AGCC	2	8	2232559	2232566	25 %	0 %	25 %	50 %	81300958
41651	NC_007604	ATCGCG	2	12	2232638	2232649	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81300958
41652	NC_007604	GCT	2	6	2232678	2232683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300958
41653	NC_007604	ATACAG	2	12	2232933	2232944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41654	NC_007604	TGC	2	6	2232999	2233004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300959
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41656	NC_007604	TTA	2	6	2233024	2233029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81300959
41657	NC_007604	CGAT	2	8	2233099	2233106	25 %	25 %	25 %	25 %	81300959
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41672	NC_007604	AG	3	6	2234030	2234035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41673	NC_007604	GAT	2	6	2234042	2234047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41721	NC_007604	GAG	2	6	2236459	2236464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300961
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41729	NC_007604	T	6	6	2236792	2236797	0 %	100 %	0 %	0 %	81300961
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41732	NC_007604	TTTG	2	8	2237007	2237014	0 %	75 %	25 %	0 %	81300961
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41975	NC_007604	GAG	3	9	2250406	2250414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300977
41976	NC_007604	ATG	2	6	2250416	2250421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300977
41977	NC_007604	AAG	2	6	2250479	2250484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300977
41978	NC_007604	GTT	2	6	2250541	2250546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300977
41979	NC_007604	CGA	2	6	2250594	2250599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300977
41980	NC_007604	CG	3	6	2250602	2250607	0 %	0 %	50 %	50 %	81300977
41981	NC_007604	GAA	3	9	2250613	2250621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300977
41982	NC_007604	TCG	2	6	2250687	2250692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300977
41983	NC_007604	TCAC	2	8	2250768	2250775	25 %	25 %	0 %	50 %	81300977
41984	NC_007604	CGT	2	6	2250784	2250789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300977
41985	NC_007604	GCGCC	2	10	2250828	2250837	0 %	0 %	40 %	60 %	81300977
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41991	NC_007604	CTG	2	6	2251277	2251282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300978
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41994	NC_007604	CTG	2	6	2251445	2251450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300978
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41998	NC_007604	GCAG	2	8	2251604	2251611	25 %	0 %	50 %	25 %	81300979
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