MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_007604	AGG	2	6	2198128	2198133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300925
41003	NC_007604	GCA	3	9	2198141	2198149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300925
41004	NC_007604	GAT	2	6	2198245	2198250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300926
41005	NC_007604	TCA	2	6	2198276	2198281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300926
41006	NC_007604	T	6	6	2198373	2198378	0 %	100 %	0 %	0 %	81300926
41007	NC_007604	GCT	2	6	2198441	2198446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300926
41008	NC_007604	GTA	2	6	2198503	2198508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300926
41009	NC_007604	CTT	2	6	2198610	2198615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300926
41010	NC_007604	ATG	2	6	2198681	2198686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300926
41011	NC_007604	TAA	2	6	2198687	2198692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300926
41012	NC_007604	GCCA	2	8	2198833	2198840	25 %	0 %	25 %	50 %	81300926
41013	NC_007604	TGG	2	6	2198889	2198894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300926
41014	NC_007604	CAA	2	6	2198926	2198931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300926
41015	NC_007604	GA	3	6	2198955	2198960	50 %	0 %	50 %	0 %	81300926
41016	NC_007604	GA	3	6	2199009	2199014	50 %	0 %	50 %	0 %	81300926
41017	NC_007604	CAA	2	6	2199039	2199044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300926
41018	NC_007604	CGC	2	6	2199045	2199050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300926
41019	NC_007604	GCA	2	6	2199056	2199061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300926
41020	NC_007604	ACC	2	6	2199076	2199081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300926
41021	NC_007604	GCC	2	6	2199128	2199133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300926
41022	NC_007604	C	6	6	2199136	2199141	0 %	0 %	0 %	100 %	81300926
41023	NC_007604	AGGG	2	8	2199300	2199307	25 %	0 %	75 %	0 %	81300926
41024	NC_007604	A	6	6	2199476	2199481	100 %	0 %	0 %	0 %	81300926
41025	NC_007604	ACTGC	2	10	2199539	2199548	20 %	20 %	20 %	40 %	81300926
41026	NC_007604	GCTG	2	8	2199564	2199571	0 %	25 %	50 %	25 %	81300926
41027	NC_007604	GCG	2	6	2199644	2199649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41028	NC_007604	C	6	6	2199744	2199749	0 %	0 %	0 %	100 %	81300927
41029	NC_007604	CTT	2	6	2199819	2199824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300927
41030	NC_007604	GCA	2	6	2199825	2199830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300927
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41032	NC_007604	TCTG	2	8	2199914	2199921	0 %	50 %	25 %	25 %	81300927
41033	NC_007604	TGC	2	6	2199952	2199957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300927
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41035	NC_007604	CTG	2	6	2200144	2200149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300928
41036	NC_007604	CGT	2	6	2200151	2200156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300928
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41041	NC_007604	CAG	2	6	2200507	2200512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300928
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41043	NC_007604	CGC	2	6	2200548	2200553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300928
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41049	NC_007604	GAC	2	6	2200915	2200920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300928
41050	NC_007604	CGG	2	6	2200957	2200962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300928
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41054	NC_007604	ATC	2	6	2201060	2201065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300928
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41100	NC_007604	GCTT	2	8	2202253	2202260	0 %	50 %	25 %	25 %	81300930
41101	NC_007604	GA	3	6	2202313	2202318	50 %	0 %	50 %	0 %	81300930
41102	NC_007604	TCT	2	6	2202343	2202348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300930
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41105	NC_007604	GGGCA	2	10	2202532	2202541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41106	NC_007604	GGCT	2	8	2202640	2202647	0 %	25 %	50 %	25 %	81300931
41107	NC_007604	GTTGAG	2	12	2202713	2202724	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	81300931
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41234	NC_007604	GCT	2	6	2210042	2210047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41235	NC_007604	TGG	2	6	2210121	2210126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300940
41236	NC_007604	TGC	2	6	2210189	2210194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41237	NC_007604	GCA	2	6	2210247	2210252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41238	NC_007604	GGC	2	6	2210278	2210283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300940
41239	NC_007604	AGC	2	6	2210423	2210428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41240	NC_007604	GC	3	6	2210479	2210484	0 %	0 %	50 %	50 %	81300940
41241	NC_007604	CG	3	6	2210519	2210524	0 %	0 %	50 %	50 %	81300940
41242	NC_007604	CTG	2	6	2210532	2210537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41243	NC_007604	TTG	2	6	2210578	2210583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300940
41244	NC_007604	GCA	2	6	2210673	2210678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41245	NC_007604	ACC	2	6	2210679	2210684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300940
41246	NC_007604	GCTG	2	8	2210734	2210741	0 %	25 %	50 %	25 %	81300940
41247	NC_007604	CTGC	2	8	2210808	2210815	0 %	25 %	25 %	50 %	81300940
41248	NC_007604	GCC	2	6	2210847	2210852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300940
41249	NC_007604	CAG	2	6	2210920	2210925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41250	NC_007604	GGC	2	6	2211025	2211030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300940
41251	NC_007604	CCA	2	6	2211115	2211120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300940
41252	NC_007604	CAA	2	6	2211127	2211132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300940
41253	NC_007604	CTG	2	6	2211141	2211146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300940
41254	NC_007604	CGC	2	6	2211185	2211190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300940
41255	NC_007604	GAA	2	6	2211239	2211244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300940
41256	NC_007604	TCT	2	6	2211286	2211291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41257	NC_007604	CGT	2	6	2211324	2211329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41258	NC_007604	GGCT	2	8	2211393	2211400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41259	NC_007604	C	6	6	2211475	2211480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41260	NC_007604	GT	3	6	2211540	2211545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41261	NC_007604	CAG	2	6	2211684	2211689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41262	NC_007604	CTGGA	2	10	2211698	2211707	20 %	20 %	40 %	20 %	81300941
41263	NC_007604	TGC	2	6	2211712	2211717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41264	NC_007604	GTC	3	9	2211744	2211752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41265	NC_007604	CT	3	6	2211795	2211800	0 %	50 %	0 %	50 %	81300941
41266	NC_007604	GCC	2	6	2211810	2211815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300941
41267	NC_007604	TGC	2	6	2211829	2211834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41268	NC_007604	CAC	2	6	2211876	2211881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300941
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41270	NC_007604	TGA	2	6	2211901	2211906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300941
41271	NC_007604	GCCA	2	8	2211912	2211919	25 %	0 %	25 %	50 %	81300941
41272	NC_007604	GCA	2	6	2211964	2211969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41273	NC_007604	CGA	2	6	2212036	2212041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41274	NC_007604	TAC	2	6	2212056	2212061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300941
41275	NC_007604	GCG	2	6	2212089	2212094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300941
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41277	NC_007604	GCC	2	6	2212167	2212172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300941
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41284	NC_007604	GTGG	2	8	2212503	2212510	0 %	25 %	75 %	0 %	81300941
41285	NC_007604	GGC	2	6	2212581	2212586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300941
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41288	NC_007604	TGC	2	6	2212876	2212881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300941
41289	NC_007604	TGG	2	6	2212888	2212893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300941
41290	NC_007604	CAG	2	6	2212908	2212913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300941
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41294	NC_007604	ACGGG	2	10	2213228	2213237	20 %	0 %	60 %	20 %	81300942
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41297	NC_007604	CGT	2	6	2213257	2213262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300942
41298	NC_007604	CCAG	2	8	2213271	2213278	25 %	0 %	25 %	50 %	81300942
41299	NC_007604	GTA	3	9	2213294	2213302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300942
41300	NC_007604	CCA	2	6	2213323	2213328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300942
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41302	NC_007604	GCG	2	6	2213509	2213514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41303	NC_007604	GAC	2	6	2213534	2213539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41304	NC_007604	GCGATC	2	12	2213563	2213574	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41305	NC_007604	GCAG	2	8	2213575	2213582	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41306	NC_007604	ACT	2	6	2213587	2213592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41307	NC_007604	GCCG	2	8	2213683	2213690	0 %	0 %	50 %	50 %	81300943
41308	NC_007604	CGAGG	2	10	2213730	2213739	20 %	0 %	60 %	20 %	81300943
41309	NC_007604	GCTT	2	8	2213819	2213826	0 %	50 %	25 %	25 %	81300943
41310	NC_007604	GAA	2	6	2213851	2213856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300943
41311	NC_007604	CAT	2	6	2213860	2213865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300943
41312	NC_007604	GAA	2	6	2213908	2213913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300943
41313	NC_007604	TGCTCG	2	12	2213986	2213997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300943
41314	NC_007604	CG	3	6	2214012	2214017	0 %	0 %	50 %	50 %	81300943
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41318	NC_007604	GATC	2	8	2214177	2214184	25 %	25 %	25 %	25 %	81300943
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41321	NC_007604	AGGCG	2	10	2214269	2214278	20 %	0 %	60 %	20 %	81300943
41322	NC_007604	CGT	2	6	2214283	2214288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300943
41323	NC_007604	CTG	3	9	2214333	2214341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300943
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41327	NC_007604	GC	3	6	2214424	2214429	0 %	0 %	50 %	50 %	81300943
41328	NC_007604	GCG	2	6	2214441	2214446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300943
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41332	NC_007604	TTG	2	6	2214593	2214598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300943
41333	NC_007604	GCC	2	6	2214602	2214607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300943
41334	NC_007604	CAG	2	6	2214675	2214680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300943
41335	NC_007604	ATG	2	6	2214745	2214750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41336	NC_007604	GCG	2	6	2214776	2214781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300944
41337	NC_007604	TCA	2	6	2214795	2214800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300944
41338	NC_007604	TCAC	2	8	2214876	2214883	25 %	25 %	0 %	50 %	81300944
41339	NC_007604	CAG	2	6	2215046	2215051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300944
41340	NC_007604	GGC	2	6	2215175	2215180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300944
41341	NC_007604	ATAGCG	2	12	2215181	2215192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	81300944
41342	NC_007604	AGC	2	6	2215214	2215219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300944
41343	NC_007604	CAC	2	6	2215236	2215241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300944
41344	NC_007604	GCC	2	6	2215250	2215255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300944
41345	NC_007604	CGA	3	9	2215264	2215272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300944
41346	NC_007604	GCC	2	6	2215348	2215353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300944
41347	NC_007604	CAG	2	6	2215377	2215382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300944
41348	NC_007604	GACG	2	8	2215636	2215643	25 %	0 %	50 %	25 %	81300945
41349	NC_007604	GGA	2	6	2215716	2215721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300945
41350	NC_007604	CTGC	2	8	2215852	2215859	0 %	25 %	25 %	50 %	81300945
41351	NC_007604	CAG	2	6	2215862	2215867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300945
41352	NC_007604	AGC	2	6	2215900	2215905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300945
41353	NC_007604	GGT	2	6	2215964	2215969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300945
41354	NC_007604	GGGT	2	8	2216031	2216038	0 %	25 %	75 %	0 %	81300945
41355	NC_007604	ACA	2	6	2216046	2216051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300945
41356	NC_007604	CAT	2	6	2216200	2216205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300945
41357	NC_007604	CCG	2	6	2216206	2216211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300945
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41359	NC_007604	GCT	2	6	2216565	2216570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41457	NC_007604	ATT	2	6	2221748	2221753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41460	NC_007604	TC	3	6	2221857	2221862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41461	NC_007604	TA	3	6	2221903	2221908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41462	NC_007604	ATTT	2	8	2221975	2221982	25 %	75 %	0 %	0 %	81300947
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41470	NC_007604	T	6	6	2222295	2222300	0 %	100 %	0 %	0 %	81300947
41471	NC_007604	A	6	6	2222306	2222311	100 %	0 %	0 %	0 %	81300947
41472	NC_007604	TGC	2	6	2222335	2222340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300947
41473	NC_007604	TTA	2	6	2222415	2222420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81300947
41474	NC_007604	TAA	2	6	2222428	2222433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300947
41475	NC_007604	TATT	2	8	2222467	2222474	25 %	75 %	0 %	0 %	81300947
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41481	NC_007604	T	6	6	2222678	2222683	0 %	100 %	0 %	0 %	81300947
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41489	NC_007604	AGC	2	6	2222995	2223000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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41491	NC_007604	T	6	6	2223108	2223113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41492	NC_007604	CAA	2	6	2223222	2223227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41493	NC_007604	AT	3	6	2223278	2223283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41494	NC_007604	TGA	2	6	2223341	2223346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41496	NC_007604	AT	4	8	2223517	2223524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41497	NC_007604	AGTT	2	8	2223557	2223564	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41498	NC_007604	GAA	2	6	2223571	2223576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41499	NC_007604	TGT	2	6	2223624	2223629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300948
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