MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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39002	NC_007604	CTTCGC	2	12	2088864	2088875	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	81300829
39003	NC_007604	GCT	2	6	2088904	2088909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300829
39004	NC_007604	TCTTCC	2	12	2088919	2088930	0 %	50 %	0 %	50 %	81300829
39005	NC_007604	CGG	2	6	2088990	2088995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300829
39006	NC_007604	TCT	2	6	2089030	2089035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300829
39007	NC_007604	GCT	2	6	2089048	2089053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300829
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39012	NC_007604	GCCA	2	8	2089233	2089240	25 %	0 %	25 %	50 %	81300829
39013	NC_007604	GCT	3	9	2089381	2089389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300829
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39019	NC_007604	GCA	2	6	2089570	2089575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300829
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39032	NC_007604	CAA	2	6	2089995	2090000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39033	NC_007604	TCAG	2	8	2090011	2090018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39034	NC_007604	GCTT	2	8	2090019	2090026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39035	NC_007604	CAT	2	6	2090033	2090038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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39097	NC_007604	GGC	2	6	2092906	2092911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300833
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39100	NC_007604	CAGA	2	8	2093031	2093038	50 %	0 %	25 %	25 %	81300833
39101	NC_007604	GTG	2	6	2093107	2093112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300833
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39105	NC_007604	CCAA	2	8	2093225	2093232	50 %	0 %	0 %	50 %	81300833
39106	NC_007604	GA	3	6	2093297	2093302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39107	NC_007604	GCC	2	6	2093346	2093351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39108	NC_007604	GCG	2	6	2093406	2093411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300834
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39111	NC_007604	GCG	2	6	2093543	2093548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300834
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39222	NC_007604	C	6	6	2100525	2100530	0 %	0 %	0 %	100 %	81300840
39223	NC_007604	GAGGTT	2	12	2100621	2100632	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	81300840
39224	NC_007604	GTT	3	9	2100630	2100638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300840
39225	NC_007604	CAT	2	6	2100722	2100727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300840
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39227	NC_007604	CATG	2	8	2100842	2100849	25 %	25 %	25 %	25 %	81300840
39228	NC_007604	CG	3	6	2100866	2100871	0 %	0 %	50 %	50 %	81300840
39229	NC_007604	GGT	2	6	2100945	2100950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300840
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39231	NC_007604	CGCCT	2	10	2101130	2101139	0 %	20 %	20 %	60 %	81300841
39232	NC_007604	TCT	2	6	2101140	2101145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300841
39233	NC_007604	CTG	2	6	2101190	2101195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300841
39234	NC_007604	GCA	2	6	2101227	2101232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300841
39235	NC_007604	GCTC	2	8	2101302	2101309	0 %	25 %	25 %	50 %	81300841
39236	NC_007604	GTC	2	6	2101323	2101328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300841
39237	NC_007604	GGGTG	2	10	2101447	2101456	0 %	20 %	80 %	0 %	81300841
39238	NC_007604	TTTG	2	8	2101555	2101562	0 %	75 %	25 %	0 %	81300841
39239	NC_007604	CTT	2	6	2101580	2101585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300841
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39247	NC_007604	CGG	2	6	2102068	2102073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300841
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39262	NC_007604	GCG	2	6	2103014	2103019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300842
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39264	NC_007604	C	6	6	2103123	2103128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39265	NC_007604	AGG	2	6	2103134	2103139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39266	NC_007604	AG	3	6	2103217	2103222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39267	NC_007604	CTG	2	6	2103228	2103233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39268	NC_007604	GGA	2	6	2103251	2103256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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39334	NC_007604	CAG	2	6	2106549	2106554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300846
39335	NC_007604	CCA	2	6	2106599	2106604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300846
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39338	NC_007604	GTG	2	6	2106932	2106937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300846
39339	NC_007604	GCC	2	6	2107012	2107017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300846
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39343	NC_007604	TCGC	2	8	2107253	2107260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39344	NC_007604	CAG	2	6	2107268	2107273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39345	NC_007604	AGT	2	6	2107304	2107309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39346	NC_007604	CGA	2	6	2107314	2107319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39347	NC_007604	CT	3	6	2107362	2107367	0 %	50 %	0 %	50 %	81300847
39348	NC_007604	TCT	2	6	2107377	2107382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300847
39349	NC_007604	ATCA	2	8	2107481	2107488	50 %	25 %	0 %	25 %	81300847
39350	NC_007604	AGC	2	6	2107625	2107630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300847
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39464	NC_007604	CGAT	2	8	2113878	2113885	25 %	25 %	25 %	25 %	81300853
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39466	NC_007604	ACG	2	6	2113905	2113910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300853
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39468	NC_007604	AGC	2	6	2114032	2114037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39469	NC_007604	CCG	2	6	2114202	2114207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300854
39470	NC_007604	ATC	2	6	2114213	2114218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300854
39471	NC_007604	GCT	2	6	2114249	2114254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39472	NC_007604	CAC	2	6	2114397	2114402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300854
39473	NC_007604	GAC	2	6	2114418	2114423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39474	NC_007604	GCT	2	6	2114464	2114469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39475	NC_007604	GAGC	2	8	2114497	2114504	25 %	0 %	50 %	25 %	81300854
39476	NC_007604	CGAT	2	8	2114546	2114553	25 %	25 %	25 %	25 %	81300854
39477	NC_007604	CGG	2	6	2114579	2114584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300854
39478	NC_007604	GCA	2	6	2114610	2114615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39479	NC_007604	CTC	2	6	2114662	2114667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300854
39480	NC_007604	TCC	2	6	2114693	2114698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300854
39481	NC_007604	TGC	2	6	2114759	2114764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39482	NC_007604	TGC	2	6	2114783	2114788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39483	NC_007604	CTG	2	6	2114827	2114832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39484	NC_007604	GCT	2	6	2114865	2114870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39485	NC_007604	TGT	3	9	2114882	2114890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300854
39486	NC_007604	TGC	2	6	2114906	2114911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39487	NC_007604	GCGATC	2	12	2114962	2114973	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39488	NC_007604	TGC	2	6	2115017	2115022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39489	NC_007604	CTG	2	6	2115094	2115099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39490	NC_007604	GCTG	2	8	2115108	2115115	0 %	25 %	50 %	25 %	81300854
39491	NC_007604	CG	3	6	2115136	2115141	0 %	0 %	50 %	50 %	81300854
39492	NC_007604	TGC	2	6	2115173	2115178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39493	NC_007604	CTT	2	6	2115228	2115233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300854
39494	NC_007604	TGT	2	6	2115236	2115241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300854
39495	NC_007604	GCT	2	6	2115255	2115260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39496	NC_007604	TCT	2	6	2115284	2115289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300854
39497	NC_007604	GCG	2	6	2115332	2115337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300854
39498	NC_007604	TGC	2	6	2115398	2115403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854
39499	NC_007604	GCTGTT	2	12	2115417	2115428	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	81300854
39500	NC_007604	TGC	2	6	2115431	2115436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300854

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