MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38501	NC_007604	CTG	2	6	2063237	2063242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300801
38502	NC_007604	AACCA	2	10	2063252	2063261	60 %	0 %	0 %	40 %	81300801
38503	NC_007604	CAC	2	6	2063297	2063302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300801
38504	NC_007604	GCC	2	6	2063331	2063336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300801
38505	NC_007604	GTA	2	6	2063342	2063347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300801
38506	NC_007604	AGT	2	6	2063385	2063390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300801
38507	NC_007604	TTC	2	6	2063516	2063521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38508	NC_007604	TTC	2	6	2063562	2063567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300802
38509	NC_007604	CGC	2	6	2063659	2063664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300802
38510	NC_007604	GGT	2	6	2063754	2063759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300802
38511	NC_007604	CAG	2	6	2063780	2063785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300802
38512	NC_007604	ACT	2	6	2063790	2063795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300802
38513	NC_007604	ACTCT	2	10	2063860	2063869	20 %	40 %	0 %	40 %	81300802
38514	NC_007604	CAC	2	6	2063940	2063945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300802
38515	NC_007604	CAC	2	6	2064035	2064040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300802
38516	NC_007604	GCG	2	6	2064097	2064102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300802
38517	NC_007604	CTG	2	6	2064130	2064135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300802
38518	NC_007604	TCCT	2	8	2064161	2064168	0 %	50 %	0 %	50 %	81300802
38519	NC_007604	CAC	2	6	2064200	2064205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300803
38520	NC_007604	GCT	3	9	2064206	2064214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300803
38521	NC_007604	CTT	2	6	2064293	2064298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300803
38522	NC_007604	TGC	2	6	2064343	2064348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300803
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38525	NC_007604	CGC	2	6	2064410	2064415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300803
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38529	NC_007604	GCA	2	6	2064705	2064710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300803
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38533	NC_007604	GAA	2	6	2065004	2065009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300804
38534	NC_007604	CAC	2	6	2065064	2065069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300804
38535	NC_007604	T	7	7	2065090	2065096	0 %	100 %	0 %	0 %	81300804
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38539	NC_007604	CAG	3	9	2065292	2065300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300804
38540	NC_007604	CTCG	2	8	2065507	2065514	0 %	25 %	25 %	50 %	81300804
38541	NC_007604	GACAGA	2	12	2065542	2065553	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	81300804
38542	NC_007604	CCG	2	6	2065596	2065601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38543	NC_007604	TCG	2	6	2065706	2065711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300805
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38546	NC_007604	TGGC	2	8	2065802	2065809	0 %	25 %	50 %	25 %	81300805
38547	NC_007604	GCG	2	6	2065817	2065822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300805
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38551	NC_007604	AGT	2	6	2065909	2065914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300805
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38555	NC_007604	GCC	2	6	2065995	2066000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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38557	NC_007604	GTT	2	6	2066133	2066138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38558	NC_007604	GCA	2	6	2066178	2066183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300806
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38583	NC_007604	AG	3	6	2067206	2067211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38584	NC_007604	GCA	2	6	2067229	2067234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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38586	NC_007604	TGCTC	2	10	2067344	2067353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38587	NC_007604	CAA	2	6	2067382	2067387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38588	NC_007604	A	6	6	2067386	2067391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38589	NC_007604	CA	4	8	2067416	2067423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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38598	NC_007604	AAT	2	6	2067864	2067869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38599	NC_007604	A	8	8	2067896	2067903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38600	NC_007604	ATT	2	6	2067917	2067922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38601	NC_007604	GCT	2	6	2068006	2068011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300809
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38603	NC_007604	CAT	2	6	2068107	2068112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300809
38604	NC_007604	TCG	2	6	2068113	2068118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300809
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38606	NC_007604	ACT	2	6	2068171	2068176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300809
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38609	NC_007604	TGC	2	6	2068250	2068255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300809
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38617	NC_007604	GCT	2	6	2068658	2068663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300809
38618	NC_007604	CGA	2	6	2068752	2068757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300809
38619	NC_007604	CTT	2	6	2068902	2068907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300809
38620	NC_007604	GTA	2	6	2068957	2068962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300809
38621	NC_007604	GCT	2	6	2068981	2068986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300809
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38625	NC_007604	GCA	2	6	2069105	2069110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300809
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38642	NC_007604	GGTG	2	8	2070151	2070158	0 %	25 %	75 %	0 %	81300809
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38644	NC_007604	GGCG	2	8	2070274	2070281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38645	NC_007604	CGGCG	2	10	2070365	2070374	0 %	0 %	60 %	40 %	81300810
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38661	NC_007604	GGAT	2	8	2071206	2071213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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