MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_007604	CAG	2	6	1927904	1927909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36003	NC_007604	AGC	2	6	1927968	1927973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36004	NC_007604	TCA	2	6	1928092	1928097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300668
36005	NC_007604	CAA	2	6	1928117	1928122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300668
36006	NC_007604	CT	3	6	1928236	1928241	0 %	50 %	0 %	50 %	81300668
36007	NC_007604	GCA	2	6	1928272	1928277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36008	NC_007604	CTG	2	6	1928402	1928407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36009	NC_007604	CAT	2	6	1928408	1928413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300668
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36011	NC_007604	TAG	2	6	1928439	1928444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300668
36012	NC_007604	CAT	2	6	1928471	1928476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300668
36013	NC_007604	GCA	2	6	1928740	1928745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36014	NC_007604	CAG	2	6	1928789	1928794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36015	NC_007604	CAG	2	6	1928798	1928803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
36016	NC_007604	TAC	2	6	1928814	1928819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300668
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36018	NC_007604	CAT	2	6	1928872	1928877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300668
36019	NC_007604	TGA	2	6	1928923	1928928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300668
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36026	NC_007604	GCA	2	6	1929267	1929272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300668
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36469	NC_007604	GTC	2	6	1954299	1954304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300690
36470	NC_007604	CGCC	2	8	1954310	1954317	0 %	0 %	25 %	75 %	81300690
36471	NC_007604	GTG	2	6	1954320	1954325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300690
36472	NC_007604	GAT	2	6	1954381	1954386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300690
36473	NC_007604	AGC	2	6	1954419	1954424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300690
36474	NC_007604	CA	3	6	1954430	1954435	50 %	0 %	0 %	50 %	81300690
36475	NC_007604	ATC	2	6	1954529	1954534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300690
36476	NC_007604	GCC	2	6	1954548	1954553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300690
36477	NC_007604	C	6	6	1954557	1954562	0 %	0 %	0 %	100 %	81300690
36478	NC_007604	GGCA	2	8	1954629	1954636	25 %	0 %	50 %	25 %	81300690
36479	NC_007604	GCACCG	2	12	1954659	1954670	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	81300690
36480	NC_007604	GAT	2	6	1954673	1954678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300690
36481	NC_007604	CGT	2	6	1954681	1954686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300690
36482	NC_007604	GCA	2	6	1954701	1954706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300690
36483	NC_007604	GCA	2	6	1954710	1954715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300690
36484	NC_007604	GTT	2	6	1954829	1954834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300691
36485	NC_007604	GAG	2	6	1954870	1954875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300691
36486	NC_007604	CAT	2	6	1954945	1954950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300691
36487	NC_007604	TGT	2	6	1955038	1955043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300691
36488	NC_007604	GCC	2	6	1955057	1955062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300691
36489	NC_007604	GTT	2	6	1955215	1955220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300691
36490	NC_007604	CCT	2	6	1955236	1955241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36491	NC_007604	CGC	3	9	1955270	1955278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36492	NC_007604	AGC	2	6	1955441	1955446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300692
36493	NC_007604	TTGG	2	8	1955473	1955480	0 %	50 %	50 %	0 %	81300692
36494	NC_007604	GTA	2	6	1955713	1955718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300692
36495	NC_007604	CCT	2	6	1955787	1955792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300692
36496	NC_007604	TCA	2	6	1956123	1956128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300692
36497	NC_007604	GGC	2	6	1956381	1956386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300693
36498	NC_007604	CGGG	2	8	1956420	1956427	0 %	0 %	75 %	25 %	81300693
36499	NC_007604	CTGC	2	8	1956515	1956522	0 %	25 %	25 %	50 %	81300693
36500	NC_007604	AGC	2	6	1956557	1956562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300693

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