MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35003	NC_007604	GATTG	2	10	1874899	1874908	20 %	40 %	40 %	0 %	81300614
35004	NC_007604	CTG	2	6	1874953	1874958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300614
35005	NC_007604	TTC	2	6	1874960	1874965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300614
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35019	NC_007604	GCGA	2	8	1875750	1875757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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35119	NC_007604	AAT	2	6	1881152	1881157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300620
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35156	NC_007604	AAAAC	2	10	1883153	1883162	80 %	0 %	0 %	20 %	81300620
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35209	NC_007604	ACT	2	6	1885193	1885198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300622
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35211	NC_007604	CTT	2	6	1885471	1885476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300622
35212	NC_007604	TCT	3	9	1885665	1885673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300622
35213	NC_007604	CTC	3	9	1885811	1885819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300622
35214	NC_007604	AAT	2	6	1885832	1885837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300622
35215	NC_007604	GTT	2	6	1885839	1885844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300622
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35217	NC_007604	TTGA	2	8	1886066	1886073	25 %	50 %	25 %	0 %	81300622
35218	NC_007604	GTT	2	6	1886128	1886133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300622
35219	NC_007604	GCGATC	2	12	1886135	1886146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81300622
35220	NC_007604	TCCG	2	8	1886430	1886437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35221	NC_007604	TGT	2	6	1886441	1886446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35222	NC_007604	AGT	2	6	1886457	1886462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35223	NC_007604	GGC	2	6	1886496	1886501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300623
35224	NC_007604	TGC	2	6	1886529	1886534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35225	NC_007604	GAA	2	6	1886555	1886560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300623
35226	NC_007604	GCT	2	6	1886656	1886661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35227	NC_007604	G	6	6	1886737	1886742	0 %	0 %	100 %	0 %	81300623
35228	NC_007604	CTG	2	6	1886762	1886767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35229	NC_007604	CGCC	2	8	1886770	1886777	0 %	0 %	25 %	75 %	81300623
35230	NC_007604	CAA	2	6	1886831	1886836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300623
35231	NC_007604	CTG	2	6	1886870	1886875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35232	NC_007604	TC	3	6	1886962	1886967	0 %	50 %	0 %	50 %	81300623
35233	NC_007604	CAG	2	6	1886969	1886974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35234	NC_007604	GCA	2	6	1886995	1887000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35235	NC_007604	GTT	2	6	1887014	1887019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300623
35236	NC_007604	GCT	3	9	1887072	1887080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300623
35237	NC_007604	CTT	2	6	1887103	1887108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300623
35238	NC_007604	GAA	2	6	1887238	1887243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81300624
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35254	NC_007604	GCT	2	6	1887961	1887966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300624
35255	NC_007604	ACCTCC	2	12	1887994	1888005	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	81300624
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35271	NC_007604	GCCA	2	8	1888746	1888753	25 %	0 %	25 %	50 %	81300625
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35300	NC_007604	T	7	7	1889654	1889660	0 %	100 %	0 %	0 %	81300625
35301	NC_007604	TTG	2	6	1889804	1889809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300625
35302	NC_007604	TTC	2	6	1889833	1889838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300625
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35304	NC_007604	CAT	3	9	1889866	1889874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300625
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35312	NC_007604	GCT	2	6	1890279	1890284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300625
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35320	NC_007604	GCT	2	6	1890864	1890869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300625
35321	NC_007604	GGT	2	6	1890886	1890891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300625
35322	NC_007604	GCC	2	6	1890946	1890951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300625
35323	NC_007604	GCC	2	6	1891117	1891122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300625
35324	NC_007604	TCGA	2	8	1891175	1891182	25 %	25 %	25 %	25 %	81300625
35325	NC_007604	CT	3	6	1891226	1891231	0 %	50 %	0 %	50 %	81300625
35326	NC_007604	GCA	2	6	1891242	1891247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300625
35327	NC_007604	CCT	2	6	1891257	1891262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300625
35328	NC_007604	ACTC	2	8	1891272	1891279	25 %	25 %	0 %	50 %	81300625
35329	NC_007604	ACA	2	6	1891350	1891355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300625
35330	NC_007604	GGC	2	6	1891362	1891367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300625
35331	NC_007604	G	6	6	1891393	1891398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35332	NC_007604	GTC	2	6	1891489	1891494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300626
35333	NC_007604	CAGT	2	8	1891542	1891549	25 %	25 %	25 %	25 %	81300626
35334	NC_007604	CCAT	2	8	1891610	1891617	25 %	25 %	0 %	50 %	81300626
35335	NC_007604	GCCGT	2	10	1891662	1891671	0 %	20 %	40 %	40 %	81300626
35336	NC_007604	ACA	2	6	1891737	1891742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300626
35337	NC_007604	TCT	2	6	1891763	1891768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300626
35338	NC_007604	CAA	2	6	1891771	1891776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300626
35339	NC_007604	TCACC	2	10	1891813	1891822	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35340	NC_007604	CAG	2	6	1891902	1891907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300627
35341	NC_007604	AGTG	2	8	1891908	1891915	25 %	25 %	50 %	0 %	81300627
35342	NC_007604	GTT	2	6	1891922	1891927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300627
35343	NC_007604	TGC	2	6	1891934	1891939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300627
35344	NC_007604	TAA	2	6	1891951	1891956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300627
35345	NC_007604	GAG	2	6	1891987	1891992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81300627
35346	NC_007604	TCT	2	6	1891997	1892002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300627
35347	NC_007604	AAT	2	6	1892059	1892064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81300627
35348	NC_007604	TGC	2	6	1892195	1892200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300627
35349	NC_007604	GC	3	6	1892210	1892215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35350	NC_007604	TGC	2	6	1892311	1892316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35351	NC_007604	GCG	2	6	1892396	1892401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300628
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35353	NC_007604	T	6	6	1892599	1892604	0 %	100 %	0 %	0 %	81300628
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35472	NC_007604	ATT	2	6	1899104	1899109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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