MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007604	GGT	2	6	163669	163674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298973
3002	NC_007604	GGCA	2	8	163694	163701	25 %	0 %	50 %	25 %	81298973
3003	NC_007604	TGC	2	6	163722	163727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298973
3004	NC_007604	TGTC	2	8	163737	163744	0 %	50 %	25 %	25 %	81298973
3005	NC_007604	GCG	2	6	163791	163796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298974
3006	NC_007604	CAG	2	6	163866	163871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298974
3007	NC_007604	TGC	2	6	164068	164073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298974
3008	NC_007604	GTGA	2	8	164076	164083	25 %	25 %	50 %	0 %	81298974
3009	NC_007604	CAC	2	6	164148	164153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298974
3010	NC_007604	GAAACA	2	12	164162	164173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	81298974
3011	NC_007604	GGC	2	6	164211	164216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298974
3012	NC_007604	TTGC	2	8	164223	164230	0 %	50 %	25 %	25 %	81298974
3013	NC_007604	GCC	2	6	164473	164478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298974
3014	NC_007604	CAA	2	6	164486	164491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298974
3015	NC_007604	GGGCT	2	10	164494	164503	0 %	20 %	60 %	20 %	81298974
3016	NC_007604	TGA	2	6	164583	164588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298975
3017	NC_007604	GCA	3	9	164611	164619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298975
3018	NC_007604	GCA	2	6	164623	164628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298975
3019	NC_007604	ATT	2	6	164690	164695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81298975
3020	NC_007604	CG	3	6	164739	164744	0 %	0 %	50 %	50 %	81298975
3021	NC_007604	GAA	2	6	164752	164757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298975
3022	NC_007604	CTG	2	6	164824	164829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298975
3023	NC_007604	TGATC	2	10	164838	164847	20 %	40 %	20 %	20 %	81298975
3024	NC_007604	TCG	2	6	164953	164958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298975
3025	NC_007604	GAA	2	6	165010	165015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298976
3026	NC_007604	CAG	2	6	165016	165021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298976
3027	NC_007604	TGAA	2	8	165026	165033	50 %	25 %	25 %	0 %	81298976
3028	NC_007604	T	6	6	165058	165063	0 %	100 %	0 %	0 %	81298976
3029	NC_007604	CTA	2	6	165090	165095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298976
3030	NC_007604	GCTG	2	8	165125	165132	0 %	25 %	50 %	25 %	81298976
3031	NC_007604	TGC	2	6	165135	165140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298976
3032	NC_007604	GGC	2	6	165147	165152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298976
3033	NC_007604	GCC	2	6	165202	165207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298976
3034	NC_007604	GGC	2	6	165257	165262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298976
3035	NC_007604	CGG	2	6	165281	165286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298976
3036	NC_007604	ACG	2	6	165317	165322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298976
3037	NC_007604	CTG	2	6	165367	165372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298976
3038	NC_007604	GCT	2	6	165393	165398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298976
3039	NC_007604	TG	3	6	165427	165432	0 %	50 %	50 %	0 %	81298976
3040	NC_007604	GCT	2	6	165527	165532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298977
3041	NC_007604	TCC	2	6	165552	165557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298977
3042	NC_007604	CGT	2	6	165572	165577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298977
3043	NC_007604	CAG	2	6	165626	165631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298977
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3045	NC_007604	AGCA	2	8	165757	165764	50 %	0 %	25 %	25 %	81298977
3046	NC_007604	AGC	2	6	165898	165903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298977
3047	NC_007604	GCG	2	6	165929	165934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298977
3048	NC_007604	GCA	2	6	165947	165952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298977
3049	NC_007604	GCA	2	6	166052	166057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298977
3050	NC_007604	GCC	2	6	166195	166200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298977
3051	NC_007604	GTGCA	2	10	166227	166236	20 %	20 %	40 %	20 %	81298977
3052	NC_007604	GGCTTG	2	12	166254	166265	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	81298977
3053	NC_007604	AGCAG	2	10	166367	166376	40 %	0 %	40 %	20 %	81298977
3054	NC_007604	AAT	2	6	166466	166471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_007604	TAG	2	6	166514	166519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_007604	CTGG	2	8	166524	166531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3057	NC_007604	AGC	2	6	166542	166547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_007604	TCG	2	6	166556	166561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_007604	CCA	2	6	166603	166608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_007604	AG	3	6	166624	166629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_007604	T	6	6	166636	166641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_007604	CTG	2	6	166652	166657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_007604	CTG	2	6	166679	166684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_007604	CTT	2	6	166703	166708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298978
3065	NC_007604	ATC	2	6	166713	166718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298978
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3070	NC_007604	AG	3	6	167018	167023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_007604	CTG	2	6	167110	167115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298979
3072	NC_007604	GGC	2	6	167128	167133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298979
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3077	NC_007604	CTG	2	6	167312	167317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298979
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3082	NC_007604	GGT	2	6	167398	167403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298979
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3087	NC_007604	CGG	2	6	167653	167658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298979
3088	NC_007604	CTG	2	6	167669	167674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298979
3089	NC_007604	CCGCCC	2	12	167725	167736	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	81298979
3090	NC_007604	CAGAG	2	10	167761	167770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3091	NC_007604	GGGA	2	8	167800	167807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_007604	TGA	3	9	167940	167948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_007604	AGG	2	6	168059	168064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_007604	TCA	2	6	168081	168086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_007604	T	6	6	168160	168165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007604	CCA	2	6	168208	168213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298980
3097	NC_007604	CTA	2	6	168433	168438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298980
3098	NC_007604	TCT	2	6	168447	168452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298980
3099	NC_007604	CCG	2	6	168471	168476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298980
3100	NC_007604	CTC	2	6	168568	168573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298980
3101	NC_007604	TGG	2	6	168583	168588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298980
3102	NC_007604	CAT	2	6	168649	168654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298980
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3104	NC_007604	CGAT	2	8	168743	168750	25 %	25 %	25 %	25 %	81298980
3105	NC_007604	TC	3	6	168807	168812	0 %	50 %	0 %	50 %	81298980
3106	NC_007604	GCC	2	6	168869	168874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298980
3107	NC_007604	TGA	2	6	168943	168948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298980
3108	NC_007604	ACT	2	6	168951	168956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298980
3109	NC_007604	GGA	2	6	169000	169005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298980
3110	NC_007604	GCC	2	6	169091	169096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298980
3111	NC_007604	CAG	2	6	169115	169120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298980
3112	NC_007604	ACAG	2	8	169141	169148	50 %	0 %	25 %	25 %	81298980
3113	NC_007604	CTG	2	6	169172	169177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298980
3114	NC_007604	GCAAC	2	10	169236	169245	40 %	0 %	20 %	40 %	81298980
3115	NC_007604	TCT	2	6	169302	169307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298980
3116	NC_007604	CGAA	2	8	169395	169402	50 %	0 %	25 %	25 %	81298980
3117	NC_007604	CCG	2	6	169406	169411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298980
3118	NC_007604	CTCG	2	8	169669	169676	0 %	25 %	25 %	50 %	81298980
3119	NC_007604	GAA	2	6	169763	169768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298980
3120	NC_007604	GAAGC	2	10	169994	170003	40 %	0 %	40 %	20 %	81298980
3121	NC_007604	TATC	2	8	170029	170036	25 %	50 %	0 %	25 %	81298980
3122	NC_007604	TGG	2	6	170151	170156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298980
3123	NC_007604	GCG	2	6	170159	170164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298980
3124	NC_007604	TCCG	2	8	170238	170245	0 %	25 %	25 %	50 %	81298980
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3370	NC_007604	GGCTG	2	10	182952	182961	0 %	20 %	60 %	20 %	81298996
3371	NC_007604	GTC	2	6	183001	183006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3372	NC_007604	AGA	2	6	183189	183194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298996
3373	NC_007604	ACGAAC	2	12	183224	183235	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	81298996
3374	NC_007604	CGGC	2	8	183263	183270	0 %	0 %	50 %	50 %	81298996
3375	NC_007604	GCA	2	6	183294	183299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3376	NC_007604	CAG	2	6	183372	183377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298996
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3378	NC_007604	CTG	2	6	183385	183390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3379	NC_007604	TTGCCT	2	12	183392	183403	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	81298996
3380	NC_007604	CTC	2	6	183409	183414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298996
3381	NC_007604	CAG	2	6	183442	183447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3382	NC_007604	CGC	2	6	183493	183498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298996
3383	NC_007604	CAA	2	6	183520	183525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298996
3384	NC_007604	ATCG	2	8	183532	183539	25 %	25 %	25 %	25 %	81298996
3385	NC_007604	GGCT	2	8	183580	183587	0 %	25 %	50 %	25 %	81298996
3386	NC_007604	GCA	2	6	183599	183604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3387	NC_007604	CAT	2	6	183699	183704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298996
3388	NC_007604	CAA	2	6	183708	183713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298996
3389	NC_007604	GAT	2	6	183783	183788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298996
3390	NC_007604	CGG	2	6	183843	183848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298996
3391	NC_007604	CTC	2	6	183932	183937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81298996
3392	NC_007604	AGC	2	6	183999	184004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298996
3393	NC_007604	ACT	2	6	184036	184041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298996
3394	NC_007604	GGC	2	6	184057	184062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298996
3395	NC_007604	CAC	2	6	184168	184173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298997
3396	NC_007604	GCT	2	6	184226	184231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298997
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3398	NC_007604	T	6	6	184241	184246	0 %	100 %	0 %	0 %	81298997
3399	NC_007604	TGC	2	6	184300	184305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298997
3400	NC_007604	GCT	2	6	184331	184336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298997
3401	NC_007604	GCC	3	9	184453	184461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298998
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3403	NC_007604	TCT	2	6	184539	184544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298998
3404	NC_007604	CCA	2	6	184566	184571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298998
3405	NC_007604	ACA	2	6	184681	184686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298998
3406	NC_007604	AGC	2	6	184712	184717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298998
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3409	NC_007604	ACAATG	2	12	184770	184781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	81298998
3410	NC_007604	TCA	2	6	184867	184872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298998
3411	NC_007604	ATC	2	6	184914	184919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298998
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3413	NC_007604	CAG	2	6	185039	185044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298998
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3416	NC_007604	CAG	2	6	185165	185170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298998
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3419	NC_007604	GAT	3	9	185234	185242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298998
3420	NC_007604	GTT	2	6	185264	185269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298998
3421	NC_007604	GCAAG	2	10	185320	185329	40 %	0 %	40 %	20 %	81298998
3422	NC_007604	GCG	2	6	185339	185344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298998
3423	NC_007604	GGC	2	6	185390	185395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298998
3424	NC_007604	ACA	2	6	185430	185435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298998
3425	NC_007604	AGG	2	6	185566	185571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3426	NC_007604	GATC	2	8	185745	185752	25 %	25 %	25 %	25 %	81298999
3427	NC_007604	TGGC	2	8	185760	185767	0 %	25 %	50 %	25 %	81298999
3428	NC_007604	CGC	2	6	185873	185878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298999
3429	NC_007604	GTT	2	6	185982	185987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298999
3430	NC_007604	GTT	2	6	186014	186019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298999
3431	NC_007604	ACGG	2	8	186048	186055	25 %	0 %	50 %	25 %	81298999
3432	NC_007604	CAAGG	2	10	186057	186066	40 %	0 %	40 %	20 %	81298999
3433	NC_007604	ACG	2	6	186145	186150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3434	NC_007604	GCG	2	6	186223	186228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298999
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3436	NC_007604	ACC	2	6	186379	186384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298999
3437	NC_007604	TGC	3	9	186397	186405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298999
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3439	NC_007604	GCG	2	6	186552	186557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298999
3440	NC_007604	GCA	2	6	186584	186589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3441	NC_007604	CGCGAT	2	12	186648	186659	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3442	NC_007604	GCA	2	6	186675	186680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3443	NC_007604	GCA	2	6	186761	186766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3444	NC_007604	CAA	2	6	186771	186776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298999
3445	NC_007604	CCCG	2	8	186995	187002	0 %	0 %	25 %	75 %	81298999
3446	NC_007604	AGC	2	6	187003	187008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298999
3447	NC_007604	CTGC	2	8	187020	187027	0 %	25 %	25 %	50 %	81298999
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3450	NC_007604	TGA	2	6	187202	187207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298999
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3452	NC_007604	G	6	6	187231	187236	0 %	0 %	100 %	0 %	81298999
3453	NC_007604	CCAAG	2	10	187298	187307	40 %	0 %	20 %	40 %	81298999
3454	NC_007604	GAA	2	6	187371	187376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298999
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3456	NC_007604	GACT	2	8	187485	187492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3457	NC_007604	AG	3	6	187493	187498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3458	NC_007604	TTCA	2	8	187501	187508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3459	NC_007604	ACA	2	6	187509	187514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3460	NC_007604	GAC	2	6	187576	187581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299000
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3462	NC_007604	GCA	2	6	187692	187697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3463	NC_007604	GCA	3	9	187752	187760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3464	NC_007604	TCG	2	6	187781	187786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299000
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3469	NC_007604	CTCG	2	8	188058	188065	0 %	25 %	25 %	50 %	81299000
3470	NC_007604	GCCGA	2	10	188146	188155	20 %	0 %	40 %	40 %	81299000
3471	NC_007604	TTC	3	9	188161	188169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299000
3472	NC_007604	GAAT	2	8	188178	188185	50 %	25 %	25 %	0 %	81299000
3473	NC_007604	TTC	2	6	188209	188214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299000
3474	NC_007604	AAG	2	6	188243	188248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299000
3475	NC_007604	AT	3	6	188264	188269	50 %	50 %	0 %	0 %	81299000
3476	NC_007604	GAA	2	6	188405	188410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299000
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3479	NC_007604	TCGCAA	2	12	188513	188524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81299000
3480	NC_007604	GCCAT	2	10	188552	188561	20 %	20 %	20 %	40 %	81299000
3481	NC_007604	CGCAG	2	10	188626	188635	20 %	0 %	40 %	40 %	81299000
3482	NC_007604	AGC	2	6	188657	188662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3483	NC_007604	TCGG	2	8	188744	188751	0 %	25 %	50 %	25 %	81299000
3484	NC_007604	TCG	2	6	188753	188758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3485	NC_007604	GTC	2	6	188905	188910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3486	NC_007604	GCC	2	6	188926	188931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299000
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3489	NC_007604	GCG	2	6	189025	189030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299000
3490	NC_007604	AAC	2	6	189159	189164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299000
3491	NC_007604	CGCTGA	2	12	189216	189227	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299000
3492	NC_007604	GTAGC	2	10	189285	189294	20 %	20 %	40 %	20 %	81299001
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3494	NC_007604	CGA	2	6	189434	189439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299001
3495	NC_007604	GCA	2	6	189508	189513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299001
3496	NC_007604	CAG	2	6	189531	189536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299001
3497	NC_007604	GCC	2	6	189580	189585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299001
3498	NC_007604	CGG	2	6	189595	189600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299001
3499	NC_007604	AGA	2	6	189673	189678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299001
3500	NC_007604	CGA	2	6	189707	189712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299001

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