MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_007604	GAT	2	6	1766010	1766015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300508
33003	NC_007604	GGC	2	6	1766037	1766042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300508
33004	NC_007604	TGA	2	6	1766078	1766083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300508
33005	NC_007604	GCCCA	2	10	1766125	1766134	20 %	0 %	20 %	60 %	81300508
33006	NC_007604	GCG	2	6	1766196	1766201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81300508
33007	NC_007604	ACA	2	6	1766360	1766365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81300508
33008	NC_007604	GCA	2	6	1766414	1766419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300508
33009	NC_007604	ATG	2	6	1766440	1766445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300508
33010	NC_007604	AGT	2	6	1766465	1766470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81300508
33011	NC_007604	GCTG	2	8	1766528	1766535	0 %	25 %	50 %	25 %	81300508
33012	NC_007604	CAG	2	6	1766559	1766564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300508
33013	NC_007604	CG	3	6	1766587	1766592	0 %	0 %	50 %	50 %	81300508
33014	NC_007604	CGC	2	6	1766595	1766600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300508
33015	NC_007604	GCC	2	6	1766716	1766721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300508
33016	NC_007604	CAT	2	6	1766745	1766750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300508
33017	NC_007604	GCC	2	6	1766773	1766778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300508
33018	NC_007604	GCC	2	6	1766794	1766799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300508
33019	NC_007604	GACA	2	8	1766876	1766883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33020	NC_007604	CTT	2	6	1766916	1766921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300509
33021	NC_007604	CGA	2	6	1767018	1767023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33022	NC_007604	TGC	2	6	1767048	1767053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33023	NC_007604	CGC	2	6	1767069	1767074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300509
33024	NC_007604	CTT	2	6	1767267	1767272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300509
33025	NC_007604	TCT	2	6	1767335	1767340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300509
33026	NC_007604	TTGG	2	8	1767353	1767360	0 %	50 %	50 %	0 %	81300509
33027	NC_007604	CATT	2	8	1767443	1767450	25 %	50 %	0 %	25 %	81300509
33028	NC_007604	CAG	2	6	1767472	1767477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33029	NC_007604	CAG	2	6	1767538	1767543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33030	NC_007604	GATA	2	8	1767621	1767628	50 %	25 %	25 %	0 %	81300509
33031	NC_007604	CCA	2	6	1767644	1767649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300509
33032	NC_007604	TGC	3	9	1767655	1767663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33033	NC_007604	A	6	6	1767694	1767699	100 %	0 %	0 %	0 %	81300509
33034	NC_007604	CTG	2	6	1767768	1767773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300509
33035	NC_007604	CCA	2	6	1767801	1767806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81300509
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33037	NC_007604	TGC	2	6	1767868	1767873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33038	NC_007604	CGA	2	6	1767964	1767969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300510
33039	NC_007604	CTT	2	6	1767979	1767984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81300510
33040	NC_007604	AGC	2	6	1768089	1768094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300510
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33042	NC_007604	GC	3	6	1768139	1768144	0 %	0 %	50 %	50 %	81300510
33043	NC_007604	TGG	2	6	1768203	1768208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81300510
33044	NC_007604	TGC	2	6	1768236	1768241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300510
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33046	NC_007604	CACC	2	8	1768392	1768399	25 %	0 %	0 %	75 %	81300510
33047	NC_007604	GCT	2	6	1768424	1768429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300510
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33049	NC_007604	GCT	2	6	1768684	1768689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33050	NC_007604	GCA	2	6	1768765	1768770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33051	NC_007604	AAC	2	6	1768829	1768834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33052	NC_007604	GCA	3	9	1768841	1768849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33053	NC_007604	GGC	2	6	1768875	1768880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33054	NC_007604	GCA	2	6	1768960	1768965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300512
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33057	NC_007604	GCAAC	2	10	1769108	1769117	40 %	0 %	20 %	40 %	81300512
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33059	NC_007604	GCTG	2	8	1769226	1769233	0 %	25 %	50 %	25 %	81300512
33060	NC_007604	TGC	2	6	1769328	1769333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300512
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33062	NC_007604	TG	3	6	1769520	1769525	0 %	50 %	50 %	0 %	81300512
33063	NC_007604	GTT	2	6	1769580	1769585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81300512
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33065	NC_007604	ATCG	2	8	1769624	1769631	25 %	25 %	25 %	25 %	81300512
33066	NC_007604	CAGT	2	8	1769662	1769669	25 %	25 %	25 %	25 %	81300512
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33071	NC_007604	ACTG	2	8	1770073	1770080	25 %	25 %	25 %	25 %	81300512
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33100	NC_007604	GTC	2	6	1772005	1772010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81300512
33101	NC_007604	TCC	2	6	1772067	1772072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81300513
33102	NC_007604	CGA	2	6	1772199	1772204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300513
33103	NC_007604	ATC	2	6	1772247	1772252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81300513
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33108	NC_007604	TC	3	6	1772417	1772422	0 %	50 %	0 %	50 %	81300513
33109	NC_007604	AGC	2	6	1772430	1772435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300513
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33113	NC_007604	CGC	2	6	1772477	1772482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81300513
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33238	NC_007604	GCA	2	6	1778971	1778976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300518
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33314	NC_007604	TCAG	2	8	1783238	1783245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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33342	NC_007604	ATCA	2	8	1784677	1784684	50 %	25 %	0 %	25 %	81300525
33343	NC_007604	GAAC	2	8	1784749	1784756	50 %	0 %	25 %	25 %	81300525
33344	NC_007604	GCA	2	6	1784783	1784788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81300525
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