MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_007604	GCG	2	6	137042	137047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298947
2502	NC_007604	GTC	2	6	137085	137090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2503	NC_007604	CAT	2	6	137173	137178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298947
2504	NC_007604	GGA	2	6	137209	137214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298947
2505	NC_007604	GAG	2	6	137519	137524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298947
2506	NC_007604	A	6	6	137651	137656	100 %	0 %	0 %	0 %	81298947
2507	NC_007604	CTG	2	6	137657	137662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2508	NC_007604	GCT	3	9	137679	137687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2509	NC_007604	GCA	3	9	137755	137763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2510	NC_007604	GCT	2	6	137808	137813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2511	NC_007604	GGC	2	6	137817	137822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298947
2512	NC_007604	GCGATC	2	12	137852	137863	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2513	NC_007604	G	6	6	137876	137881	0 %	0 %	100 %	0 %	81298947
2514	NC_007604	ACG	2	6	137996	138001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298947
2515	NC_007604	GCG	2	6	138014	138019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_007604	GCAG	2	8	138044	138051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_007604	CGG	2	6	138147	138152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298948
2518	NC_007604	TGGCT	2	10	138248	138257	0 %	40 %	40 %	20 %	81298948
2519	NC_007604	G	6	6	138310	138315	0 %	0 %	100 %	0 %	81298948
2520	NC_007604	TCT	2	6	138686	138691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81298948
2521	NC_007604	AGTCG	2	10	138823	138832	20 %	20 %	40 %	20 %	81298948
2522	NC_007604	AG	4	8	138885	138892	50 %	0 %	50 %	0 %	81298948
2523	NC_007604	GAA	2	6	138985	138990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298948
2524	NC_007604	TTCA	2	8	139042	139049	25 %	50 %	0 %	25 %	81298948
2525	NC_007604	AGC	2	6	139082	139087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298948
2526	NC_007604	TGC	2	6	139115	139120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298948
2527	NC_007604	A	6	6	139123	139128	100 %	0 %	0 %	0 %	81298948
2528	NC_007604	GCG	2	6	139278	139283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298948
2529	NC_007604	CCA	3	9	139316	139324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_007604	GGC	2	6	139380	139385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_007604	GAG	2	6	139402	139407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_007604	GCG	2	6	139430	139435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298949
2533	NC_007604	TTGGC	2	10	139474	139483	0 %	40 %	40 %	20 %	81298949
2534	NC_007604	CTTC	2	8	139555	139562	0 %	50 %	0 %	50 %	81298949
2535	NC_007604	CCGG	2	8	139588	139595	0 %	0 %	50 %	50 %	81298949
2536	NC_007604	GAAG	2	8	139665	139672	50 %	0 %	50 %	0 %	81298949
2537	NC_007604	TGG	2	6	139686	139691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298949
2538	NC_007604	G	8	8	139690	139697	0 %	0 %	100 %	0 %	81298949
2539	NC_007604	ATG	2	6	139782	139787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298949
2540	NC_007604	TGG	2	6	139835	139840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298949
2541	NC_007604	TCG	2	6	140149	140154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_007604	CGC	2	6	140159	140164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_007604	ACA	2	6	140195	140200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_007604	TGAT	2	8	140320	140327	25 %	50 %	25 %	0 %	81298950
2545	NC_007604	ACG	2	6	140392	140397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2546	NC_007604	GGC	2	6	140414	140419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298950
2547	NC_007604	TTTGC	2	10	140509	140518	0 %	60 %	20 %	20 %	81298950
2548	NC_007604	TGG	3	9	140587	140595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298950
2549	NC_007604	AGAC	2	8	140644	140651	50 %	0 %	25 %	25 %	81298950
2550	NC_007604	GTG	2	6	140691	140696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298950
2551	NC_007604	GTC	2	6	140755	140760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2552	NC_007604	TGG	2	6	140939	140944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298950
2553	NC_007604	CGGC	2	8	140956	140963	0 %	0 %	50 %	50 %	81298950
2554	NC_007604	AAC	2	6	141011	141016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298950
2555	NC_007604	TGA	2	6	141041	141046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298950
2556	NC_007604	GCACG	2	10	141080	141089	20 %	0 %	40 %	40 %	81298950
2557	NC_007604	CTG	2	6	141123	141128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2558	NC_007604	GGTG	2	8	141134	141141	0 %	25 %	75 %	0 %	81298950
2559	NC_007604	GAT	2	6	141324	141329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298950
2560	NC_007604	CTA	2	6	141398	141403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298950
2561	NC_007604	CAA	2	6	141423	141428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298950
2562	NC_007604	AGC	2	6	141449	141454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2563	NC_007604	CAC	2	6	141470	141475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298950
2564	NC_007604	GCT	2	6	141501	141506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2565	NC_007604	TCA	2	6	141511	141516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298950
2566	NC_007604	CGT	2	6	141528	141533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298950
2567	NC_007604	GCCG	2	8	141575	141582	0 %	0 %	50 %	50 %	81298950
2568	NC_007604	TG	3	6	141624	141629	0 %	50 %	50 %	0 %	81298950
2569	NC_007604	TGA	2	6	141649	141654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298950
2570	NC_007604	ACA	2	6	141685	141690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298950
2571	NC_007604	GTT	2	6	141705	141710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298950
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2579	NC_007604	GCG	2	6	142090	142095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298950
2580	NC_007604	GCT	2	6	142108	142113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_007604	TGG	2	6	142151	142156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_007604	ATG	2	6	142182	142187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_007604	AG	3	6	142280	142285	50 %	0 %	50 %	0 %	81298951
2584	NC_007604	CACC	2	8	142295	142302	25 %	0 %	0 %	75 %	81298951
2585	NC_007604	CAGA	2	8	142389	142396	50 %	0 %	25 %	25 %	81298951
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2588	NC_007604	GCTA	2	8	142521	142528	25 %	25 %	25 %	25 %	81298951
2589	NC_007604	CGC	3	9	142552	142560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298951
2590	NC_007604	GTCT	2	8	142611	142618	0 %	50 %	25 %	25 %	81298951
2591	NC_007604	GCG	2	6	142641	142646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298952
2592	NC_007604	GCGT	2	8	142653	142660	0 %	25 %	50 %	25 %	81298952
2593	NC_007604	CCA	2	6	142666	142671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298952
2594	NC_007604	CGA	2	6	142725	142730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2595	NC_007604	CAAGG	2	10	142732	142741	40 %	0 %	40 %	20 %	81298952
2596	NC_007604	ATTG	2	8	142813	142820	25 %	50 %	25 %	0 %	81298952
2597	NC_007604	GA	3	6	142844	142849	50 %	0 %	50 %	0 %	81298952
2598	NC_007604	CGA	2	6	142851	142856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2599	NC_007604	TCG	2	6	142859	142864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2600	NC_007604	GTC	2	6	142867	142872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2601	NC_007604	ACC	2	6	142916	142921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298952
2602	NC_007604	AGCAA	2	10	142952	142961	60 %	0 %	20 %	20 %	81298952
2603	NC_007604	CCAA	2	8	143001	143008	50 %	0 %	0 %	50 %	81298952
2604	NC_007604	CGT	2	6	143034	143039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2605	NC_007604	CAG	2	6	143122	143127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2606	NC_007604	CTGAG	2	10	143139	143148	20 %	20 %	40 %	20 %	81298952
2607	NC_007604	GCT	2	6	143151	143156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2608	NC_007604	CTG	2	6	143191	143196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2609	NC_007604	TGT	2	6	143288	143293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298952
2610	NC_007604	TGC	2	6	143316	143321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298952
2611	NC_007604	CCA	3	9	143521	143529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81298952
2612	NC_007604	CAGA	2	8	143586	143593	50 %	0 %	25 %	25 %	81298953
2613	NC_007604	CGG	2	6	143594	143599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298953
2614	NC_007604	GCT	2	6	143734	143739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298953
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2617	NC_007604	TGC	2	6	143793	143798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298953
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2619	NC_007604	CAG	2	6	143956	143961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298953
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2624	NC_007604	GCC	2	6	144067	144072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298953
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2993	NC_007604	TCGGC	2	10	163264	163273	0 %	20 %	40 %	40 %	81298972
2994	NC_007604	CCG	2	6	163289	163294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298972
2995	NC_007604	TC	3	6	163437	163442	0 %	50 %	0 %	50 %	81298973
2996	NC_007604	CTG	2	6	163450	163455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298973
2997	NC_007604	TCCC	2	8	163457	163464	0 %	25 %	0 %	75 %	81298973
2998	NC_007604	TGC	2	6	163491	163496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298973
2999	NC_007604	GCT	2	6	163531	163536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298973
3000	NC_007604	CCGC	2	8	163600	163607	0 %	0 %	25 %	75 %	81298973

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