MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_007604	ACC	2	6	1010276	1010281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299809
19003	NC_007604	CGCCT	2	10	1010308	1010317	0 %	20 %	20 %	60 %	81299809
19004	NC_007604	CAG	2	6	1010379	1010384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299809
19005	NC_007604	CGGTAT	2	12	1010385	1010396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81299809
19006	NC_007604	GCC	2	6	1010443	1010448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299809
19007	NC_007604	CCA	2	6	1010495	1010500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299809
19008	NC_007604	CAA	2	6	1010611	1010616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299809
19009	NC_007604	ATT	2	6	1010641	1010646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299809
19010	NC_007604	TGC	2	6	1010682	1010687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299809
19011	NC_007604	GCA	2	6	1010745	1010750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299809
19012	NC_007604	AGT	2	6	1010763	1010768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299809
19013	NC_007604	GAG	2	6	1010847	1010852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299809
19014	NC_007604	CCCA	2	8	1010869	1010876	25 %	0 %	0 %	75 %	81299809
19015	NC_007604	GGAG	2	8	1010967	1010974	25 %	0 %	75 %	0 %	81299809
19016	NC_007604	CAC	2	6	1011082	1011087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299809
19017	NC_007604	GCCA	2	8	1011261	1011268	25 %	0 %	25 %	50 %	81299809
19018	NC_007604	TAA	2	6	1011348	1011353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299809
19019	NC_007604	TCTG	2	8	1011371	1011378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19020	NC_007604	TGAG	2	8	1011440	1011447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_007604	GCTCT	2	10	1011471	1011480	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19022	NC_007604	AGC	2	6	1011481	1011486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_007604	ATCCG	2	10	1011542	1011551	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19024	NC_007604	AGGA	2	8	1011675	1011682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_007604	CAT	2	6	1011713	1011718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_007604	TGT	2	6	1011741	1011746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_007604	AACT	2	8	1011791	1011798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19028	NC_007604	AGGC	2	8	1011888	1011895	25 %	0 %	50 %	25 %	81299810
19029	NC_007604	TGGC	2	8	1011962	1011969	0 %	25 %	50 %	25 %	81299810
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19032	NC_007604	GCC	2	6	1012166	1012171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299810
19033	NC_007604	GCC	2	6	1012307	1012312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299810
19034	NC_007604	CGC	2	6	1012374	1012379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299810
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19036	NC_007604	CA	3	6	1012495	1012500	50 %	0 %	0 %	50 %	81299810
19037	NC_007604	ATC	2	6	1012526	1012531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299810
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19040	NC_007604	CGC	2	6	1012605	1012610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299810
19041	NC_007604	TGT	2	6	1012643	1012648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299810
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19054	NC_007604	GC	3	6	1013385	1013390	0 %	0 %	50 %	50 %	81299810
19055	NC_007604	CAG	2	6	1013470	1013475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299810
19056	NC_007604	CAG	2	6	1013527	1013532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299810
19057	NC_007604	CAG	2	6	1013583	1013588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299810
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19060	NC_007604	CAG	2	6	1013691	1013696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299810
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19065	NC_007604	AGCA	2	8	1014078	1014085	50 %	0 %	25 %	25 %	81299811
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19081	NC_007604	ATCG	2	8	1015248	1015255	25 %	25 %	25 %	25 %	81299812
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19088	NC_007604	TGC	2	6	1015650	1015655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299812
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19091	NC_007604	CTA	2	6	1015765	1015770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299812
19092	NC_007604	GAT	2	6	1015813	1015818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299812
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19096	NC_007604	GCCA	2	8	1015994	1016001	25 %	0 %	25 %	50 %	81299813
19097	NC_007604	GGA	2	6	1016009	1016014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299813
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19101	NC_007604	GAAT	2	8	1016238	1016245	50 %	25 %	25 %	0 %	81299813
19102	NC_007604	ACG	2	6	1016334	1016339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299814
19103	NC_007604	CAT	2	6	1016341	1016346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299814
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19105	NC_007604	TGGACT	2	12	1016370	1016381	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81299814
19106	NC_007604	GAA	2	6	1016405	1016410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299814
19107	NC_007604	CAGC	2	8	1016440	1016447	25 %	0 %	25 %	50 %	81299814
19108	NC_007604	CAA	2	6	1016450	1016455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299814
19109	NC_007604	TGA	2	6	1016467	1016472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299814
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19112	NC_007604	CCAT	2	8	1016664	1016671	25 %	25 %	0 %	50 %	81299814
19113	NC_007604	AAG	2	6	1016673	1016678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299814
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19117	NC_007604	TCA	2	6	1016815	1016820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299814
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19122	NC_007604	TGCT	2	8	1017045	1017052	0 %	50 %	25 %	25 %	81299815
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19236	NC_007604	TGG	2	6	1022836	1022841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299820
19237	NC_007604	CGA	2	6	1022846	1022851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19238	NC_007604	GCT	3	9	1022902	1022910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19239	NC_007604	ATCGGC	2	12	1022964	1022975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19240	NC_007604	CGT	3	9	1022987	1022995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19241	NC_007604	CGC	2	6	1023017	1023022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299820
19242	NC_007604	GCC	2	6	1023048	1023053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299820
19243	NC_007604	CAG	2	6	1023210	1023215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19244	NC_007604	CAG	2	6	1023282	1023287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299820
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19247	NC_007604	GTG	2	6	1023542	1023547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299820
19248	NC_007604	G	6	6	1023608	1023613	0 %	0 %	100 %	0 %	81299820
19249	NC_007604	GCC	2	6	1023619	1023624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299820
19250	NC_007604	CCA	2	6	1023635	1023640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299820
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19253	NC_007604	GAC	2	6	1023680	1023685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299820
19254	NC_007604	GGT	2	6	1023697	1023702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299820
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19256	NC_007604	TCT	2	6	1023784	1023789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299820
19257	NC_007604	GCGATC	2	12	1023795	1023806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299820
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19262	NC_007604	CG	3	6	1024124	1024129	0 %	0 %	50 %	50 %	81299821
19263	NC_007604	TAA	2	6	1024164	1024169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299821
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19272	NC_007604	CCA	2	6	1024625	1024630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299821
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19277	NC_007604	AG	3	6	1024858	1024863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19278	NC_007604	CTG	2	6	1024942	1024947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19280	NC_007604	TTGG	2	8	1025054	1025061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19281	NC_007604	ACC	2	6	1025113	1025118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19282	NC_007604	GCTC	2	8	1025124	1025131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19283	NC_007604	ACC	3	9	1025149	1025157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19284	NC_007604	ATG	2	6	1025197	1025202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19286	NC_007604	CAC	2	6	1025253	1025258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19345	NC_007604	CTT	2	6	1028979	1028984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299824
19346	NC_007604	GTT	2	6	1028995	1029000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299824
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19349	NC_007604	TCA	2	6	1029143	1029148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299824
19350	NC_007604	GCG	2	6	1029169	1029174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299824
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19352	NC_007604	TGC	2	6	1029258	1029263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19353	NC_007604	CGT	2	6	1029392	1029397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19354	NC_007604	CAG	2	6	1029399	1029404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19355	NC_007604	TGC	2	6	1029436	1029441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19356	NC_007604	GGT	2	6	1029447	1029452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299824
19357	NC_007604	CAT	2	6	1029530	1029535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299824
19358	NC_007604	CTG	2	6	1029582	1029587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19359	NC_007604	CAG	2	6	1029609	1029614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19360	NC_007604	CTGCAG	2	12	1029642	1029653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299824
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19362	NC_007604	CAGCCA	2	12	1029677	1029688	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	81299824
19363	NC_007604	GCCA	2	8	1029743	1029750	25 %	0 %	25 %	50 %	81299824
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19366	NC_007604	CTG	2	6	1029812	1029817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
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19372	NC_007604	GGCT	2	8	1030122	1030129	0 %	25 %	50 %	25 %	81299824
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19375	NC_007604	CTG	2	6	1030319	1030324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299824
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19382	NC_007604	GCA	2	6	1030793	1030798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299824
19383	NC_007604	AGCT	2	8	1030842	1030849	25 %	25 %	25 %	25 %	81299824
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19385	NC_007604	GCCC	2	8	1031008	1031015	0 %	0 %	25 %	75 %	81299825
19386	NC_007604	AACCA	2	10	1031098	1031107	60 %	0 %	0 %	40 %	81299825
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19462	NC_007604	TTGG	2	8	1035613	1035620	0 %	50 %	50 %	0 %	81299829
19463	NC_007604	GAT	2	6	1035699	1035704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299829
19464	NC_007604	GCA	2	6	1035720	1035725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299829
19465	NC_007604	CTG	2	6	1035757	1035762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299830
19466	NC_007604	AGC	2	6	1035816	1035821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299830
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19468	NC_007604	GGC	3	9	1035951	1035959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299830
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19472	NC_007604	GCCT	2	8	1036197	1036204	0 %	25 %	25 %	50 %	81299830
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