MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_007604	GAT	2	6	850824	850829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299663
16003	NC_007604	GCT	3	9	850916	850924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16004	NC_007604	GCA	2	6	851106	851111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16005	NC_007604	CTT	2	6	851255	851260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299663
16006	NC_007604	CGC	2	6	851291	851296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299663
16007	NC_007604	ACG	2	6	851314	851319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16008	NC_007604	GCT	2	6	851337	851342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16009	NC_007604	CAA	2	6	851346	851351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299663
16010	NC_007604	GGC	2	6	851427	851432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299663
16011	NC_007604	CAG	2	6	851443	851448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16012	NC_007604	GCT	2	6	851546	851551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16013	NC_007604	ACTG	2	8	851825	851832	25 %	25 %	25 %	25 %	81299663
16014	NC_007604	CTG	2	6	851861	851866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16015	NC_007604	TGA	2	6	851960	851965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299663
16016	NC_007604	GCT	2	6	852024	852029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16017	NC_007604	CAG	2	6	852058	852063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16018	NC_007604	CCG	2	6	852231	852236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299663
16019	NC_007604	GCTT	2	8	852285	852292	0 %	50 %	25 %	25 %	81299663
16020	NC_007604	CTG	2	6	852333	852338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16021	NC_007604	TGC	2	6	852410	852415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16022	NC_007604	TGC	2	6	852424	852429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299663
16023	NC_007604	CTAA	2	8	852591	852598	50 %	25 %	0 %	25 %	81299663
16024	NC_007604	CAA	2	6	852615	852620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299663
16025	NC_007604	AGT	2	6	852721	852726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_007604	AAT	2	6	852735	852740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_007604	CCT	2	6	852741	852746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_007604	AAT	2	6	852781	852786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_007604	CTTGT	2	10	852866	852875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16030	NC_007604	TGC	2	6	852986	852991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_007604	GTT	2	6	853011	853016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_007604	CT	3	6	853109	853114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16033	NC_007604	CAA	2	6	853167	853172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16034	NC_007604	TTC	2	6	853258	853263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_007604	TCCA	2	8	853307	853314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16036	NC_007604	A	6	6	853404	853409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_007604	GCA	2	6	853430	853435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16038	NC_007604	CCA	2	6	853468	853473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16039	NC_007604	GAA	2	6	853475	853480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_007604	ATGA	2	8	853625	853632	50 %	25 %	25 %	0 %	81299664
16041	NC_007604	GATC	2	8	853674	853681	25 %	25 %	25 %	25 %	81299664
16042	NC_007604	CAG	2	6	853684	853689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299664
16043	NC_007604	AGCT	2	8	853717	853724	25 %	25 %	25 %	25 %	81299664
16044	NC_007604	CAG	2	6	853899	853904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299664
16045	NC_007604	AAG	2	6	853927	853932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299664
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16047	NC_007604	TCAT	2	8	854314	854321	25 %	50 %	0 %	25 %	81299664
16048	NC_007604	AAG	2	6	854365	854370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299664
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16050	NC_007604	AG	3	6	854385	854390	50 %	0 %	50 %	0 %	81299664
16051	NC_007604	CTT	2	6	854491	854496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299664
16052	NC_007604	TTGT	2	8	854527	854534	0 %	75 %	25 %	0 %	81299664
16053	NC_007604	GAC	2	6	854538	854543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299664
16054	NC_007604	ATC	2	6	854550	854555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299664
16055	NC_007604	GAGC	2	8	854558	854565	25 %	0 %	50 %	25 %	81299664
16056	NC_007604	ATT	2	6	854607	854612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299664
16057	NC_007604	ATC	2	6	854748	854753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299664
16058	NC_007604	GATC	2	8	854777	854784	25 %	25 %	25 %	25 %	81299664
16059	NC_007604	GACT	2	8	854810	854817	25 %	25 %	25 %	25 %	81299664
16060	NC_007604	AGG	2	6	854839	854844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299664
16061	NC_007604	AGT	2	6	854878	854883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299664
16062	NC_007604	TTC	2	6	854896	854901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_007604	AGC	2	6	854925	854930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_007604	AGTAC	2	10	854936	854945	40 %	20 %	20 %	20 %	81299665
16065	NC_007604	TTG	2	6	854946	854951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299665
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16072	NC_007604	GCT	2	6	855354	855359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299666
16073	NC_007604	T	6	6	855377	855382	0 %	100 %	0 %	0 %	81299666
16074	NC_007604	TAC	2	6	855401	855406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299666
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16077	NC_007604	ATGCTG	2	12	855567	855578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81299666
16078	NC_007604	TGT	2	6	855596	855601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299666
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16080	NC_007604	CCT	2	6	855709	855714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299666
16081	NC_007604	GCT	2	6	855733	855738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299666
16082	NC_007604	GTT	3	9	855755	855763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299666
16083	NC_007604	TGC	3	9	855773	855781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299666
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16085	NC_007604	CCA	2	6	855897	855902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299667
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16088	NC_007604	GC	3	6	856043	856048	0 %	0 %	50 %	50 %	81299667
16089	NC_007604	CTCAAG	2	12	856055	856066	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	81299667
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16092	NC_007604	CTCTG	2	10	856227	856236	0 %	40 %	20 %	40 %	81299667
16093	NC_007604	GCT	2	6	856277	856282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299667
16094	NC_007604	GTTGCC	2	12	856358	856369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299667
16095	NC_007604	CAA	2	6	856469	856474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299667
16096	NC_007604	TGAC	2	8	856545	856552	25 %	25 %	25 %	25 %	81299667
16097	NC_007604	TGA	2	6	856621	856626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299667
16098	NC_007604	ATC	2	6	856643	856648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299667
16099	NC_007604	TGA	2	6	856696	856701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299667
16100	NC_007604	CGGGT	2	10	856740	856749	0 %	20 %	60 %	20 %	81299667
16101	NC_007604	ATG	2	6	856770	856775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299667
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16104	NC_007604	CA	3	6	856945	856950	50 %	0 %	0 %	50 %	81299667
16105	NC_007604	CG	4	8	856968	856975	0 %	0 %	50 %	50 %	81299667
16106	NC_007604	AGC	2	6	856986	856991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299667
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16110	NC_007604	TGT	2	6	857203	857208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299667
16111	NC_007604	GAC	2	6	857213	857218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299667
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16115	NC_007604	CCA	2	6	857398	857403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299667
16116	NC_007604	GCA	2	6	857425	857430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299667
16117	NC_007604	CA	3	6	857461	857466	50 %	0 %	0 %	50 %	81299667
16118	NC_007604	CG	4	8	857486	857493	0 %	0 %	50 %	50 %	81299667
16119	NC_007604	CTT	2	6	857494	857499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299667
16120	NC_007604	AGTT	2	8	857556	857563	25 %	50 %	25 %	0 %	81299667
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16234	NC_007604	TGA	2	6	863826	863831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299669
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16487	NC_007604	GCA	2	6	876825	876830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299683
16488	NC_007604	GCT	2	6	876909	876914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299683
16489	NC_007604	GAT	2	6	877089	877094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299683
16490	NC_007604	CCG	2	6	877098	877103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299683
16491	NC_007604	GCCA	2	8	877121	877128	25 %	0 %	25 %	50 %	81299683
16492	NC_007604	AGC	2	6	877181	877186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299683
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16495	NC_007604	CTG	2	6	877362	877367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299683
16496	NC_007604	AGCC	2	8	877424	877431	25 %	0 %	25 %	50 %	81299683
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16499	NC_007604	CG	3	6	877490	877495	0 %	0 %	50 %	50 %	81299684
16500	NC_007604	CAG	2	6	877531	877536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299684

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