MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_007604	CGG	2	6	795996	796001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299613
15003	NC_007604	CTG	2	6	796004	796009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299613
15004	NC_007604	GAG	3	9	796028	796036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299613
15005	NC_007604	GCCT	2	8	796079	796086	0 %	25 %	25 %	50 %	81299613
15006	NC_007604	GAT	2	6	796124	796129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299613
15007	NC_007604	CGA	2	6	796132	796137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299613
15008	NC_007604	TGGG	2	8	796194	796201	0 %	25 %	75 %	0 %	81299613
15009	NC_007604	TTG	2	6	796243	796248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299613
15010	NC_007604	GCA	2	6	796280	796285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299613
15011	NC_007604	ACGCC	2	10	796299	796308	20 %	0 %	20 %	60 %	81299613
15012	NC_007604	CGT	2	6	796330	796335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299613
15013	NC_007604	GAA	2	6	796340	796345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299613
15014	NC_007604	TTA	2	6	796388	796393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299613
15015	NC_007604	CCA	2	6	796415	796420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299613
15016	NC_007604	AG	3	6	796558	796563	50 %	0 %	50 %	0 %	81299614
15017	NC_007604	AG	3	6	796597	796602	50 %	0 %	50 %	0 %	81299614
15018	NC_007604	GCG	2	6	796615	796620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299614
15019	NC_007604	CGG	2	6	796635	796640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299614
15020	NC_007604	CCA	2	6	796731	796736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299614
15021	NC_007604	CAT	2	6	796795	796800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299614
15022	NC_007604	AGC	2	6	796865	796870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299614
15023	NC_007604	AGC	2	6	796988	796993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299614
15024	NC_007604	CGA	2	6	797025	797030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299614
15025	NC_007604	TTG	2	6	797033	797038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299614
15026	NC_007604	AGA	2	6	797148	797153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299614
15027	NC_007604	ACC	2	6	797182	797187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299614
15028	NC_007604	ACT	2	6	797191	797196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299614
15029	NC_007604	GAG	2	6	797206	797211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299614
15030	NC_007604	CCG	2	6	797235	797240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299614
15031	NC_007604	CTT	2	6	797399	797404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299615
15032	NC_007604	CTG	2	6	797440	797445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15033	NC_007604	CTG	2	6	797493	797498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15034	NC_007604	GAC	2	6	797512	797517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15035	NC_007604	TCC	2	6	797524	797529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299615
15036	NC_007604	GCG	2	6	797565	797570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299615
15037	NC_007604	GCTG	2	8	797704	797711	0 %	25 %	50 %	25 %	81299615
15038	NC_007604	GCT	2	6	797714	797719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15039	NC_007604	TGT	2	6	797739	797744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299615
15040	NC_007604	CGAC	2	8	797903	797910	25 %	0 %	25 %	50 %	81299615
15041	NC_007604	GATCGC	2	12	797911	797922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15042	NC_007604	GCG	2	6	797940	797945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299615
15043	NC_007604	GCC	2	6	797952	797957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299615
15044	NC_007604	AGCG	2	8	798084	798091	25 %	0 %	50 %	25 %	81299615
15045	NC_007604	ACG	2	6	798182	798187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299615
15046	NC_007604	CACGG	2	10	798221	798230	20 %	0 %	40 %	40 %	81299615
15047	NC_007604	GGC	2	6	798277	798282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299615
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15050	NC_007604	CTG	2	6	798406	798411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299616
15051	NC_007604	TGGT	2	8	798421	798428	0 %	50 %	50 %	0 %	81299616
15052	NC_007604	T	6	6	798460	798465	0 %	100 %	0 %	0 %	81299616
15053	NC_007604	CGAT	2	8	798503	798510	25 %	25 %	25 %	25 %	81299616
15054	NC_007604	GCA	2	6	798575	798580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299616
15055	NC_007604	TCGC	2	8	798614	798621	0 %	25 %	25 %	50 %	81299616
15056	NC_007604	CCA	2	6	798695	798700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299616
15057	NC_007604	CTAC	2	8	798732	798739	25 %	25 %	0 %	50 %	81299616
15058	NC_007604	CTA	2	6	798768	798773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299616
15059	NC_007604	CTG	2	6	798818	798823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299616
15060	NC_007604	ATC	2	6	798868	798873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299616
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15062	NC_007604	CAA	2	6	798972	798977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299616
15063	NC_007604	CGG	2	6	799162	799167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299617
15064	NC_007604	GGC	2	6	799239	799244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299617
15065	NC_007604	GCGATC	2	12	799264	799275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299617
15066	NC_007604	GCC	2	6	799307	799312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299617
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15070	NC_007604	TGG	2	6	799901	799906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299618
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15085	NC_007604	AAG	2	6	800504	800509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299618
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15088	NC_007604	A	6	6	800694	800699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_007604	TC	3	6	800719	800724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15090	NC_007604	CGT	2	6	800729	800734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_007604	GCA	2	6	800815	800820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_007604	A	6	6	800866	800871	100 %	0 %	0 %	0 %	81299619
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15099	NC_007604	ATCA	2	8	801586	801593	50 %	25 %	0 %	25 %	81299619
15100	NC_007604	ACG	3	9	801625	801633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299619
15101	NC_007604	GATCGC	2	12	801741	801752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299619
15102	NC_007604	CAG	2	6	801754	801759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299619
15103	NC_007604	GCC	2	6	801844	801849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299619
15104	NC_007604	CCA	2	6	801861	801866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299619
15105	NC_007604	CGC	2	6	801873	801878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299619
15106	NC_007604	CCG	2	6	801941	801946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299619
15107	NC_007604	CAT	2	6	801978	801983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299619
15108	NC_007604	GGC	2	6	802098	802103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299619
15109	NC_007604	T	6	6	802129	802134	0 %	100 %	0 %	0 %	81299619
15110	NC_007604	AAC	2	6	802264	802269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299619
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15112	NC_007604	CTG	2	6	802384	802389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299619
15113	NC_007604	TGAG	2	8	802415	802422	25 %	25 %	50 %	0 %	81299619
15114	NC_007604	TCC	2	6	802430	802435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299619
15115	NC_007604	T	6	6	802505	802510	0 %	100 %	0 %	0 %	81299619
15116	NC_007604	CAG	2	6	802570	802575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299619
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15119	NC_007604	TGA	2	6	802812	802817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299619
15120	NC_007604	TTG	2	6	802825	802830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299619
15121	NC_007604	CCG	2	6	802886	802891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299619
15122	NC_007604	GCA	2	6	802929	802934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299619
15123	NC_007604	TCCGA	2	10	803020	803029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15124	NC_007604	GGTGG	2	10	803033	803042	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_007604	CGCGAT	2	12	803117	803128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299620
15126	NC_007604	CTG	3	9	803139	803147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299620
15127	NC_007604	TGG	2	6	803164	803169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299620
15128	NC_007604	CTC	2	6	803183	803188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299620
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15130	NC_007604	TGG	2	6	803274	803279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299620
15131	NC_007604	CAC	2	6	803354	803359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299620
15132	NC_007604	GGC	2	6	803456	803461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299620
15133	NC_007604	TCG	2	6	803743	803748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299620
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15136	NC_007604	CAGC	2	8	803858	803865	25 %	0 %	25 %	50 %	81299620
15137	NC_007604	GCT	2	6	804011	804016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299620
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15139	NC_007604	TAC	2	6	804057	804062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299620
15140	NC_007604	GCA	2	6	804096	804101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299620
15141	NC_007604	TGAGCT	2	12	804103	804114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81299620
15142	NC_007604	GGGCT	2	10	804318	804327	0 %	20 %	60 %	20 %	81299620
15143	NC_007604	CAA	2	6	804360	804365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299620
15144	NC_007604	TGGC	2	8	804395	804402	0 %	25 %	50 %	25 %	81299620
15145	NC_007604	CTG	2	6	804447	804452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299620
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15147	NC_007604	CGAT	2	8	804538	804545	25 %	25 %	25 %	25 %	81299620
15148	NC_007604	TCA	2	6	804563	804568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299620
15149	NC_007604	GCA	2	6	804695	804700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299620
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15151	NC_007604	TTC	2	6	804831	804836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15152	NC_007604	GGC	3	9	804953	804961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299621
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15154	NC_007604	GCTG	2	8	805123	805130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15155	NC_007604	AAT	2	6	805153	805158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_007604	AC	5	10	805174	805183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15157	NC_007604	T	8	8	805240	805247	0 %	100 %	0 %	0 %	81299622
15158	NC_007604	GTC	2	6	805255	805260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299622
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15160	NC_007604	TC	3	6	805395	805400	0 %	50 %	0 %	50 %	81299622
15161	NC_007604	GCC	2	6	805410	805415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299622
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15168	NC_007604	GCT	2	6	805860	805865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299622
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15175	NC_007604	GTTG	2	8	806226	806233	0 %	50 %	50 %	0 %	81299622
15176	NC_007604	TGG	2	6	806239	806244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299622
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15180	NC_007604	TGC	3	9	806471	806479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299622
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15185	NC_007604	C	6	6	806749	806754	0 %	0 %	0 %	100 %	81299622
15186	NC_007604	CGC	2	6	806857	806862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15187	NC_007604	CGG	2	6	806867	806872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15188	NC_007604	CGA	2	6	806928	806933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299623
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15193	NC_007604	CATG	2	8	807204	807211	25 %	25 %	25 %	25 %	81299623
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15201	NC_007604	GCA	2	6	807630	807635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299623
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15235	NC_007604	TTGC	2	8	809198	809205	0 %	50 %	25 %	25 %	81299625
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15240	NC_007604	CGG	2	6	809456	809461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299626
15241	NC_007604	GCA	2	6	809549	809554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299626
15242	NC_007604	GTC	2	6	809579	809584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299626
15243	NC_007604	CGG	2	6	809787	809792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299626
15244	NC_007604	GGC	2	6	809826	809831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299626
15245	NC_007604	CAG	2	6	809864	809869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299626
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15248	NC_007604	CAC	2	6	809931	809936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299626
15249	NC_007604	TGG	2	6	809945	809950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299626
15250	NC_007604	CGT	2	6	809962	809967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299626
15251	NC_007604	CTT	2	6	810040	810045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299626
15252	NC_007604	GAT	2	6	810046	810051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299626
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15254	NC_007604	TGC	2	6	810116	810121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15255	NC_007604	CTG	2	6	810242	810247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299627
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15261	NC_007604	CGAT	2	8	810419	810426	25 %	25 %	25 %	25 %	81299627
15262	NC_007604	GCA	2	6	810542	810547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299627
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15272	NC_007604	CTT	2	6	811194	811199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299627
15273	NC_007604	CGC	2	6	811277	811282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299627
15274	NC_007604	GCA	2	6	811331	811336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299627
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15277	NC_007604	GTT	3	9	811479	811487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299627
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15279	NC_007604	CTG	2	6	811525	811530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299627
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15282	NC_007604	TTCT	2	8	811603	811610	0 %	75 %	0 %	25 %	81299627
15283	NC_007604	CAA	2	6	811719	811724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299627
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15285	NC_007604	ATT	2	6	811789	811794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81299627
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15293	NC_007604	CTG	2	6	812277	812282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15294	NC_007604	GTC	2	6	812296	812301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15299	NC_007604	CGAT	2	8	812583	812590	25 %	25 %	25 %	25 %	81299628
15300	NC_007604	CTGTTG	2	12	812613	812624	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	81299628
15301	NC_007604	AAG	2	6	812773	812778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15302	NC_007604	AGT	2	6	812791	812796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15324	NC_007604	ACC	2	6	814365	814370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299631
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15326	NC_007604	TGCGTC	2	12	814477	814488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299632
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15330	NC_007604	TGG	2	6	814582	814587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299632
15331	NC_007604	CCG	2	6	814618	814623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299632
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15333	NC_007604	GCG	2	6	814812	814817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299632
15334	NC_007604	TC	3	6	814828	814833	0 %	50 %	0 %	50 %	81299632
15335	NC_007604	TCA	2	6	814843	814848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299632
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15346	NC_007604	CAA	2	6	815483	815488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299632
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15348	NC_007604	CAG	2	6	815619	815624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299632
15349	NC_007604	CTGCAG	2	12	815646	815657	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299632
15350	NC_007604	ACT	2	6	815752	815757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299632
15351	NC_007604	GCA	2	6	815792	815797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299632
15352	NC_007604	GCA	2	6	815812	815817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299632
15353	NC_007604	CTA	2	6	815819	815824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299632
15354	NC_007604	CTA	2	6	815837	815842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299632
15355	NC_007604	CCAA	2	8	815854	815861	50 %	0 %	0 %	50 %	81299632
15356	NC_007604	CAA	2	6	815868	815873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299632
15357	NC_007604	TCAG	2	8	815986	815993	25 %	25 %	25 %	25 %	81299632
15358	NC_007604	CG	3	6	816068	816073	0 %	0 %	50 %	50 %	81299632
15359	NC_007604	CTG	2	6	816094	816099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299633
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15362	NC_007604	CGATC	2	10	816177	816186	20 %	20 %	20 %	40 %	81299633
15363	NC_007604	CGG	2	6	816212	816217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299633
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15484	NC_007604	GGC	2	6	823707	823712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299640
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