MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_007604	GGCT	2	8	688107	688114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13002	NC_007604	CGG	2	6	688160	688165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_007604	AATC	2	8	688278	688285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13004	NC_007604	TCT	2	6	688306	688311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_007604	GCT	2	6	688359	688364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299506
13006	NC_007604	TCA	2	6	688380	688385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299506
13007	NC_007604	TGC	2	6	688497	688502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299506
13008	NC_007604	GCTGC	2	10	688544	688553	0 %	20 %	40 %	40 %	81299506
13009	NC_007604	CGA	2	6	688576	688581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299506
13010	NC_007604	GCTGA	2	10	688594	688603	20 %	20 %	40 %	20 %	81299506
13011	NC_007604	T	6	6	688612	688617	0 %	100 %	0 %	0 %	81299506
13012	NC_007604	GCA	2	6	688639	688644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299506
13013	NC_007604	GGT	2	6	688721	688726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299506
13014	NC_007604	CCG	2	6	688760	688765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299506
13015	NC_007604	GAC	2	6	688819	688824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299506
13016	NC_007604	GAC	2	6	688899	688904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_007604	AAC	2	6	688958	688963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_007604	AAC	2	6	688977	688982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_007604	GGT	2	6	689066	689071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299507
13020	NC_007604	GAA	2	6	689089	689094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299507
13021	NC_007604	AACGAA	2	12	689113	689124	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	81299507
13022	NC_007604	AGA	3	9	689359	689367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299508
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13024	NC_007604	TTC	2	6	689493	689498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299508
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13027	NC_007604	GTCA	2	8	689633	689640	25 %	25 %	25 %	25 %	81299508
13028	NC_007604	GAA	2	6	689660	689665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299508
13029	NC_007604	GACG	2	8	689677	689684	25 %	0 %	50 %	25 %	81299508
13030	NC_007604	AGCC	2	8	689727	689734	25 %	0 %	25 %	50 %	81299508
13031	NC_007604	CGG	2	6	689889	689894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299508
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13033	NC_007604	GAA	2	6	690008	690013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299508
13034	NC_007604	CTG	2	6	690016	690021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299508
13035	NC_007604	G	6	6	690083	690088	0 %	0 %	100 %	0 %	81299508
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13037	NC_007604	CCGAAG	2	12	690288	690299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299508
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13039	NC_007604	CTG	2	6	690415	690420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299508
13040	NC_007604	CAG	2	6	690428	690433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299508
13041	NC_007604	CGG	2	6	690493	690498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299508
13042	NC_007604	GCC	2	6	690577	690582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299508
13043	NC_007604	GTC	2	6	690694	690699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299508
13044	NC_007604	GAC	2	6	690713	690718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299508
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13047	NC_007604	GA	3	6	690925	690930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_007604	ATTT	2	8	691044	691051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_007604	CGG	2	6	691189	691194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299509
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13052	NC_007604	TCG	2	6	691239	691244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299509
13053	NC_007604	TC	3	6	691267	691272	0 %	50 %	0 %	50 %	81299509
13054	NC_007604	GAG	2	6	691289	691294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299509
13055	NC_007604	TGCC	2	8	691330	691337	0 %	25 %	25 %	50 %	81299509
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13057	NC_007604	GCC	2	6	691447	691452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299509
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13059	NC_007604	G	6	6	691546	691551	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_007604	GGT	2	6	691565	691570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_007604	GAA	2	6	691576	691581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_007604	CTA	2	6	691597	691602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13076	NC_007604	ATCG	2	8	692214	692221	25 %	25 %	25 %	25 %	81299511
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13082	NC_007604	ATG	2	6	692359	692364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299511
13083	NC_007604	GACA	2	8	692396	692403	50 %	0 %	25 %	25 %	81299511
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13090	NC_007604	CTT	2	6	692744	692749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299511
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13092	NC_007604	GA	4	8	692763	692770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_007604	CTG	2	6	692803	692808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299512
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13095	NC_007604	TGGCT	2	10	692911	692920	0 %	40 %	40 %	20 %	81299512
13096	NC_007604	AGA	2	6	692921	692926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299512
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13101	NC_007604	TTC	2	6	693187	693192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299512
13102	NC_007604	CG	3	6	693224	693229	0 %	0 %	50 %	50 %	81299512
13103	NC_007604	CTG	2	6	693266	693271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299513
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13107	NC_007604	ACT	2	6	693606	693611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299513
13108	NC_007604	GATC	2	8	693715	693722	25 %	25 %	25 %	25 %	81299513
13109	NC_007604	CGAT	2	8	693795	693802	25 %	25 %	25 %	25 %	81299513
13110	NC_007604	GCT	2	6	693922	693927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299513
13111	NC_007604	GCA	2	6	693982	693987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299513
13112	NC_007604	AGC	2	6	693994	693999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299513
13113	NC_007604	GGGC	2	8	694031	694038	0 %	0 %	75 %	25 %	81299513
13114	NC_007604	TCTG	2	8	694053	694060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_007604	GCT	2	6	694066	694071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_007604	CTTG	2	8	694077	694084	0 %	50 %	25 %	25 %	81299514
13117	NC_007604	CGG	2	6	694207	694212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299514
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13123	NC_007604	CCAG	2	8	694332	694339	25 %	0 %	25 %	50 %	81299514
13124	NC_007604	AGC	2	6	694352	694357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299514
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13126	NC_007604	TAC	2	6	694447	694452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299514
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13128	NC_007604	GTC	2	6	694535	694540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299514
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13130	NC_007604	CCG	2	6	694696	694701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299514
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13132	NC_007604	CAT	2	6	694809	694814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299514
13133	NC_007604	GAAT	2	8	694890	694897	50 %	25 %	25 %	0 %	81299514
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13140	NC_007604	TCA	2	6	695371	695376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299515
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13155	NC_007604	TTGG	2	8	696311	696318	0 %	50 %	50 %	0 %	81299516
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13231	NC_007604	TC	3	6	700401	700406	0 %	50 %	0 %	50 %	81299519
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13234	NC_007604	TGC	2	6	700558	700563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299520
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13239	NC_007604	GCG	2	6	700927	700932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299521
13240	NC_007604	T	6	6	700969	700974	0 %	100 %	0 %	0 %	81299521
13241	NC_007604	CG	3	6	701068	701073	0 %	0 %	50 %	50 %	81299521
13242	NC_007604	TCA	2	6	701075	701080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299521
13243	NC_007604	CTT	2	6	701091	701096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299521
13244	NC_007604	TGT	2	6	701112	701117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299521
13245	NC_007604	T	6	6	701117	701122	0 %	100 %	0 %	0 %	81299521
13246	NC_007604	AGCAAC	2	12	701165	701176	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	81299521
13247	NC_007604	GCC	2	6	701209	701214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299521
13248	NC_007604	CAT	2	6	701262	701267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299521
13249	NC_007604	CAG	2	6	701296	701301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299521
13250	NC_007604	GATC	2	8	701340	701347	25 %	25 %	25 %	25 %	81299521
13251	NC_007604	TCG	2	6	701360	701365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299521
13252	NC_007604	TTC	2	6	701374	701379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299521
13253	NC_007604	GCA	2	6	701448	701453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299521
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13256	NC_007604	CTG	2	6	701634	701639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13257	NC_007604	GGT	2	6	701732	701737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299522
13258	NC_007604	GACC	2	8	701768	701775	25 %	0 %	25 %	50 %	81299522
13259	NC_007604	CTG	2	6	701859	701864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13260	NC_007604	CGA	2	6	701866	701871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13261	NC_007604	GGT	2	6	701874	701879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299522
13262	NC_007604	CAA	2	6	702050	702055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299522
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13264	NC_007604	AAG	2	6	702160	702165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299522
13265	NC_007604	GGAA	2	8	702244	702251	50 %	0 %	50 %	0 %	81299522
13266	NC_007604	ATC	2	6	702294	702299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299522
13267	NC_007604	TCGA	2	8	702303	702310	25 %	25 %	25 %	25 %	81299522
13268	NC_007604	ATC	2	6	702417	702422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299522
13269	NC_007604	CGG	2	6	702443	702448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299522
13270	NC_007604	CGTGAT	2	12	702488	702499	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	81299522
13271	NC_007604	CGC	2	6	702572	702577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299522
13272	NC_007604	GAA	2	6	702611	702616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299522
13273	NC_007604	CCT	2	6	702640	702645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299522
13274	NC_007604	CGA	2	6	702652	702657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13275	NC_007604	CGT	2	6	702665	702670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13276	NC_007604	GAT	2	6	702731	702736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299522
13277	NC_007604	GGTG	2	8	702743	702750	0 %	25 %	75 %	0 %	81299522
13278	NC_007604	GGCGAT	2	12	702752	702763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	81299522
13279	NC_007604	TGC	2	6	702928	702933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13280	NC_007604	GC	3	6	703031	703036	0 %	0 %	50 %	50 %	81299522
13281	NC_007604	AGC	2	6	703078	703083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
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13283	NC_007604	GCG	2	6	703145	703150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299522
13284	NC_007604	GCA	2	6	703151	703156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13285	NC_007604	TAC	2	6	703227	703232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299522
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13287	NC_007604	GAC	2	6	703277	703282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
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13290	NC_007604	GCT	2	6	703384	703389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13291	NC_007604	GACT	2	8	703463	703470	25 %	25 %	25 %	25 %	81299522
13292	NC_007604	ATC	2	6	703557	703562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299522
13293	NC_007604	GGC	2	6	703569	703574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299522
13294	NC_007604	CGC	2	6	703579	703584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299522
13295	NC_007604	TCGA	2	8	703671	703678	25 %	25 %	25 %	25 %	81299522
13296	NC_007604	CGG	2	6	703681	703686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299522
13297	NC_007604	GGT	2	6	703805	703810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299522
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13300	NC_007604	TGA	2	6	704146	704151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299522
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13302	NC_007604	TGC	2	6	704353	704358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13303	NC_007604	CT	3	6	704386	704391	0 %	50 %	0 %	50 %	81299522
13304	NC_007604	AGC	2	6	704471	704476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13305	NC_007604	AGC	2	6	704620	704625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
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13307	NC_007604	ATC	2	6	704709	704714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299522
13308	NC_007604	CGCC	2	8	704719	704726	0 %	0 %	25 %	75 %	81299522
13309	NC_007604	GAC	2	6	704745	704750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
13310	NC_007604	GCA	2	6	704766	704771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299522
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13312	NC_007604	GCTA	2	8	704893	704900	25 %	25 %	25 %	25 %	81299522
13313	NC_007604	TCA	2	6	705026	705031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13314	NC_007604	GCA	2	6	705034	705039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13315	NC_007604	CAA	2	6	705204	705209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299523
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13318	NC_007604	CGCTAG	2	12	705393	705404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299523
13319	NC_007604	CCA	2	6	705417	705422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299523
13320	NC_007604	ACG	2	6	705425	705430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299523
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13323	NC_007604	TGGAT	2	10	705565	705574	20 %	40 %	40 %	0 %	81299523
13324	NC_007604	TTTC	2	8	705765	705772	0 %	75 %	0 %	25 %	81299523
13325	NC_007604	CGG	2	6	705776	705781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299523
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13332	NC_007604	CGGTTC	2	12	706459	706470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299524
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13335	NC_007604	GTCC	2	8	706721	706728	0 %	25 %	25 %	50 %	81299524
13336	NC_007604	AGC	2	6	706865	706870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299524
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13343	NC_007604	TTGC	2	8	707221	707228	0 %	50 %	25 %	25 %	81299524
13344	NC_007604	TTC	2	6	707242	707247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299524
13345	NC_007604	GT	3	6	707250	707255	0 %	50 %	50 %	0 %	81299524
13346	NC_007604	ACCG	2	8	707422	707429	25 %	0 %	25 %	50 %	81299524
13347	NC_007604	GGC	2	6	707490	707495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299524
13348	NC_007604	ATC	2	6	707540	707545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299524
13349	NC_007604	ACG	2	6	707555	707560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299524
13350	NC_007604	GGC	2	6	707565	707570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299524
13351	NC_007604	CTT	2	6	707697	707702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13352	NC_007604	GGGTC	2	10	707888	707897	0 %	20 %	60 %	20 %	81299525
13353	NC_007604	AGG	2	6	707926	707931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299525
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13355	NC_007604	TCA	2	6	708129	708134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299525
13356	NC_007604	GCT	2	6	708166	708171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299525
13357	NC_007604	GCA	2	6	708184	708189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299525
13358	NC_007604	AGAT	2	8	708279	708286	50 %	25 %	25 %	0 %	81299525
13359	NC_007604	TGC	2	6	708306	708311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299525
13360	NC_007604	CGG	2	6	708332	708337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299525
13361	NC_007604	CGT	2	6	708367	708372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299525
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13363	NC_007604	TGT	2	6	708543	708548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299525
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