MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_007604	CTG	2	6	662372	662377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12502	NC_007604	GCT	2	6	662391	662396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12503	NC_007604	GCGGT	2	10	662414	662423	0 %	20 %	60 %	20 %	81299476
12504	NC_007604	TTGA	2	8	662425	662432	25 %	50 %	25 %	0 %	81299476
12505	NC_007604	TCCT	2	8	662484	662491	0 %	50 %	0 %	50 %	81299476
12506	NC_007604	GCG	2	6	662583	662588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299476
12507	NC_007604	GCC	2	6	662643	662648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299476
12508	NC_007604	TGA	2	6	662657	662662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299476
12509	NC_007604	CTG	2	6	662695	662700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12510	NC_007604	GCA	2	6	662720	662725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12511	NC_007604	TCG	2	6	662792	662797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12512	NC_007604	TG	3	6	662812	662817	0 %	50 %	50 %	0 %	81299476
12513	NC_007604	TGC	2	6	662887	662892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299476
12514	NC_007604	GAT	2	6	662910	662915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299476
12515	NC_007604	ATA	2	6	663006	663011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_007604	CCGC	2	8	663019	663026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12517	NC_007604	CT	3	6	663091	663096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12518	NC_007604	GTG	2	6	663112	663117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_007604	GGAT	2	8	663139	663146	25 %	25 %	50 %	0 %	81299477
12520	NC_007604	TGC	3	9	663166	663174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12521	NC_007604	TGA	2	6	663191	663196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299477
12522	NC_007604	GCT	2	6	663336	663341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12523	NC_007604	GCT	2	6	663360	663365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12524	NC_007604	TGG	2	6	663377	663382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299477
12525	NC_007604	GTG	2	6	663396	663401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299477
12526	NC_007604	CGG	2	6	663402	663407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299477
12527	NC_007604	GGC	2	6	663422	663427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299477
12528	NC_007604	CCG	2	6	663444	663449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299477
12529	NC_007604	TGC	3	9	663466	663474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12530	NC_007604	CGA	2	6	663507	663512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12531	NC_007604	CTG	2	6	663534	663539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12532	NC_007604	GTT	2	6	663540	663545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299477
12533	NC_007604	ACT	2	6	663551	663556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299477
12534	NC_007604	CAG	2	6	663558	663563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299477
12535	NC_007604	TAC	2	6	663606	663611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299477
12536	NC_007604	CAA	2	6	663621	663626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299477
12537	NC_007604	CGCC	2	8	663653	663660	0 %	0 %	25 %	75 %	81299477
12538	NC_007604	AG	3	6	663822	663827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_007604	CGCTG	2	10	663843	663852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12540	NC_007604	CAT	2	6	663871	663876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_007604	GAA	2	6	664126	664131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299478
12542	NC_007604	GAA	2	6	664150	664155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299478
12543	NC_007604	AGA	2	6	664236	664241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299478
12544	NC_007604	GTG	2	6	664274	664279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299478
12545	NC_007604	TGCCGT	2	12	664317	664328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299479
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12548	NC_007604	GGCG	2	8	664515	664522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12549	NC_007604	GCG	2	6	664534	664539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_007604	TTG	2	6	664540	664545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299480
12551	NC_007604	TTG	2	6	664564	664569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299480
12552	NC_007604	GCT	2	6	664607	664612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299480
12553	NC_007604	CGT	2	6	664708	664713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299480
12554	NC_007604	AGC	2	6	664809	664814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299480
12555	NC_007604	ATCG	2	8	664912	664919	25 %	25 %	25 %	25 %	81299480
12556	NC_007604	CTGG	2	8	664935	664942	0 %	25 %	50 %	25 %	81299480
12557	NC_007604	GAC	2	6	665001	665006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299480
12558	NC_007604	GAG	2	6	665024	665029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299480
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12560	NC_007604	GCAGAA	2	12	665092	665103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	81299480
12561	NC_007604	GCG	2	6	665199	665204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299481
12562	NC_007604	GCG	2	6	665225	665230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299481
12563	NC_007604	TAA	2	6	665231	665236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299481
12564	NC_007604	A	6	6	665235	665240	100 %	0 %	0 %	0 %	81299481
12565	NC_007604	GGT	2	6	665261	665266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299481
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12568	NC_007604	GCA	2	6	665302	665307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299481
12569	NC_007604	GGC	2	6	665318	665323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299481
12570	NC_007604	CAG	2	6	665360	665365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299481
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12573	NC_007604	TCG	2	6	665641	665646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299481
12574	NC_007604	CGG	2	6	665695	665700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299481
12575	NC_007604	TGA	2	6	665851	665856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299481
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12578	NC_007604	CG	3	6	665935	665940	0 %	0 %	50 %	50 %	81299481
12579	NC_007604	GCCA	2	8	665956	665963	25 %	0 %	25 %	50 %	81299481
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12585	NC_007604	TGC	2	6	666328	666333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299482
12586	NC_007604	GTG	2	6	666347	666352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299482
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12588	NC_007604	GCG	2	6	666395	666400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299482
12589	NC_007604	TGCCC	2	10	666539	666548	0 %	20 %	20 %	60 %	81299482
12590	NC_007604	TGG	2	6	666583	666588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299482
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12592	NC_007604	GAAA	2	8	666793	666800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_007604	CCAG	2	8	666826	666833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12594	NC_007604	TCG	2	6	666857	666862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_007604	ACCT	2	8	666926	666933	25 %	25 %	0 %	50 %	81299483
12596	NC_007604	CTG	2	6	666956	666961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299483
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12598	NC_007604	GACA	2	8	667026	667033	50 %	0 %	25 %	25 %	81299483
12599	NC_007604	AGA	2	6	667042	667047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299483
12600	NC_007604	GCGATC	2	12	667050	667061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81299483
12601	NC_007604	GCA	3	9	667082	667090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299483
12602	NC_007604	TCGA	2	8	667097	667104	25 %	25 %	25 %	25 %	81299483
12603	NC_007604	A	6	6	667190	667195	100 %	0 %	0 %	0 %	81299483
12604	NC_007604	AAG	2	6	667233	667238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299483
12605	NC_007604	GCG	2	6	667257	667262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299483
12606	NC_007604	TGG	2	6	667313	667318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299483
12607	NC_007604	CAA	2	6	667396	667401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299483
12608	NC_007604	CAG	2	6	667430	667435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299483
12609	NC_007604	TGC	2	6	667465	667470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299483
12610	NC_007604	ACG	2	6	667598	667603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299483
12611	NC_007604	ATCG	2	8	667643	667650	25 %	25 %	25 %	25 %	81299483
12612	NC_007604	TGA	2	6	667722	667727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299483
12613	NC_007604	GCTA	2	8	667841	667848	25 %	25 %	25 %	25 %	81299483
12614	NC_007604	CGG	2	6	667856	667861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299484
12615	NC_007604	GCG	2	6	667878	667883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299484
12616	NC_007604	GCT	2	6	667887	667892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299484
12617	NC_007604	GCA	2	6	667905	667910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299484
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12619	NC_007604	TGC	2	6	667973	667978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299484
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12986	NC_007604	TGACTT	2	12	687312	687323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	81299505
12987	NC_007604	CATTGA	2	12	687327	687338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	81299505
12988	NC_007604	TG	3	6	687345	687350	0 %	50 %	50 %	0 %	81299505
12989	NC_007604	CGA	3	9	687453	687461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299505
12990	NC_007604	TTC	2	6	687568	687573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299505
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