MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_007604	TGAT	2	8	530159	530166	25 %	50 %	25 %	0 %	81299358
10002	NC_007604	GACT	2	8	530238	530245	25 %	25 %	25 %	25 %	81299358
10003	NC_007604	CT	3	6	530244	530249	0 %	50 %	0 %	50 %	81299358
10004	NC_007604	CAG	2	6	530294	530299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299358
10005	NC_007604	ACA	2	6	530406	530411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299358
10006	NC_007604	ATCG	2	8	530454	530461	25 %	25 %	25 %	25 %	81299358
10007	NC_007604	AAT	2	6	530495	530500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299358
10008	NC_007604	TGC	2	6	530513	530518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299358
10009	NC_007604	TAA	2	6	530536	530541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299358
10010	NC_007604	GTC	2	6	530557	530562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299358
10011	NC_007604	TC	4	8	530577	530584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_007604	CAGCA	2	10	530600	530609	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10013	NC_007604	ACGGC	2	10	530628	530637	20 %	0 %	40 %	40 %	81299359
10014	NC_007604	GCT	2	6	530641	530646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10015	NC_007604	G	6	6	530647	530652	0 %	0 %	100 %	0 %	81299359
10016	NC_007604	AAT	2	6	530670	530675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299359
10017	NC_007604	GAG	2	6	530686	530691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299359
10018	NC_007604	GTC	2	6	530699	530704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10019	NC_007604	CTG	2	6	530707	530712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10020	NC_007604	GAT	2	6	530742	530747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299359
10021	NC_007604	GCT	2	6	530823	530828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10022	NC_007604	CGGTTC	2	12	530914	530925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10023	NC_007604	TCG	2	6	530934	530939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
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10025	NC_007604	GCA	2	6	531045	531050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299359
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10027	NC_007604	GTTCTG	2	12	531273	531284	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	81299359
10028	NC_007604	GGA	2	6	531338	531343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299359
10029	NC_007604	GGCG	2	8	531492	531499	0 %	0 %	75 %	25 %	81299359
10030	NC_007604	TCC	2	6	531503	531508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299359
10031	NC_007604	CTT	2	6	531510	531515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299359
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10033	NC_007604	GCAC	2	8	531575	531582	25 %	0 %	25 %	50 %	81299359
10034	NC_007604	CTG	2	6	531640	531645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299359
10035	NC_007604	GAT	2	6	531702	531707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299359
10036	NC_007604	TGA	2	6	531740	531745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299359
10037	NC_007604	CCCG	2	8	531834	531841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10038	NC_007604	GCT	2	6	531890	531895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299360
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10042	NC_007604	CTG	2	6	531965	531970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299360
10043	NC_007604	CG	4	8	532033	532040	0 %	0 %	50 %	50 %	81299360
10044	NC_007604	AGC	2	6	532056	532061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299360
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10053	NC_007604	GCT	2	6	532592	532597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299360
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10055	NC_007604	AGC	2	6	532866	532871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299361
10056	NC_007604	GCTGT	2	10	532961	532970	0 %	40 %	40 %	20 %	81299361
10057	NC_007604	ACG	2	6	533045	533050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_007604	CTC	2	6	533063	533068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_007604	CAG	2	6	533091	533096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_007604	CAT	2	6	533193	533198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_007604	TTTC	2	8	533199	533206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10062	NC_007604	AGAA	2	8	533207	533214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_007604	AGA	2	6	533245	533250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_007604	ACC	2	6	533323	533328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10065	NC_007604	TGC	2	6	533348	533353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10067	NC_007604	CAGCT	2	10	533577	533586	20 %	20 %	20 %	40 %	81299362
10068	NC_007604	GTCC	2	8	533587	533594	0 %	25 %	25 %	50 %	81299362
10069	NC_007604	GTTT	2	8	533654	533661	0 %	75 %	25 %	0 %	81299362
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10073	NC_007604	TGG	2	6	533779	533784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299362
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10078	NC_007604	TGGG	2	8	534042	534049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_007604	CAG	2	6	534151	534156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299363
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10092	NC_007604	ATTG	2	8	535023	535030	25 %	50 %	25 %	0 %	81299363
10093	NC_007604	AAG	2	6	535055	535060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299363
10094	NC_007604	GCC	2	6	535084	535089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299363
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10102	NC_007604	CTT	2	6	535853	535858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299364
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10105	NC_007604	CTG	2	6	536028	536033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299364
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10107	NC_007604	TTG	2	6	536058	536063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299364
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10112	NC_007604	GCA	2	6	536411	536416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299364
10113	NC_007604	CCA	2	6	536418	536423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299364
10114	NC_007604	CGAG	2	8	536555	536562	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_007604	GTAGA	2	10	536580	536589	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_007604	TTG	2	6	536610	536615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299365
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10119	NC_007604	GGCT	2	8	536742	536749	0 %	25 %	50 %	25 %	81299365
10120	NC_007604	TCG	2	6	536802	536807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299365
10121	NC_007604	GCCA	2	8	536831	536838	25 %	0 %	25 %	50 %	81299365
10122	NC_007604	GGT	2	6	536899	536904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299365
10123	NC_007604	GCT	2	6	536907	536912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299365
10124	NC_007604	TGA	3	9	536914	536922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299365
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10128	NC_007604	CG	3	6	537121	537126	0 %	0 %	50 %	50 %	81299365
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10131	NC_007604	ATC	2	6	537296	537301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299365
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10155	NC_007604	GCTG	3	12	538828	538839	0 %	25 %	50 %	25 %	81299367
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10239	NC_007604	TCAG	2	8	543338	543345	25 %	25 %	25 %	25 %	81299373
10240	NC_007604	GCC	2	6	543366	543371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299373
10241	NC_007604	GCT	2	6	543418	543423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299373
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10244	NC_007604	GAC	2	6	543582	543587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299373
10245	NC_007604	CCA	2	6	543665	543670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299374
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10249	NC_007604	TGAC	2	8	543808	543815	25 %	25 %	25 %	25 %	81299374
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10252	NC_007604	TGT	2	6	543911	543916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299374
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10258	NC_007604	TTCG	2	8	544205	544212	0 %	50 %	25 %	25 %	81299374
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10282	NC_007604	AAT	2	6	545025	545030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81299374
10283	NC_007604	TGC	2	6	545184	545189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299374
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10360	NC_007604	CAG	2	6	549470	549475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299379
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10362	NC_007604	GCA	2	6	549582	549587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299379
10363	NC_007604	GAT	2	6	549604	549609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299379
10364	NC_007604	TGT	2	6	549688	549693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299379
10365	NC_007604	GTAG	2	8	549787	549794	25 %	25 %	50 %	0 %	81299379
10366	NC_007604	CGC	2	6	549830	549835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299379
10367	NC_007604	ACA	2	6	549890	549895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299379
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10369	NC_007604	GCA	2	6	549939	549944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299379
10370	NC_007604	GCA	2	6	549952	549957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299379
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10375	NC_007604	TGGG	2	8	550515	550522	0 %	25 %	75 %	0 %	81299379
10376	NC_007604	GATC	2	8	550558	550565	25 %	25 %	25 %	25 %	81299379
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10385	NC_007604	CGT	2	6	550852	550857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299380
10386	NC_007604	CTG	2	6	550883	550888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299380
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10388	NC_007604	AAG	2	6	550998	551003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299380
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10391	NC_007604	TGA	2	6	551139	551144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299380
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10393	NC_007604	CCA	2	6	551255	551260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81299380
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10395	NC_007604	CTT	2	6	551335	551340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299380
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10399	NC_007604	CAA	2	6	551495	551500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299380
10400	NC_007604	CAT	2	6	551504	551509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299380
10401	NC_007604	GAG	2	6	551552	551557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81299380
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10403	NC_007604	CGCT	2	8	551657	551664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10404	NC_007604	ACA	2	6	551702	551707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10405	NC_007604	TTG	2	6	551786	551791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10406	NC_007604	TAG	2	6	551796	551801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10410	NC_007604	CCT	2	6	551943	551948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	81299381
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10445	NC_007604	ATAA	2	8	553538	553545	75 %	25 %	0 %	0 %	81299382
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10450	NC_007604	AACA	2	8	553741	553748	75 %	0 %	0 %	25 %	81299382
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10455	NC_007604	CGA	2	6	554084	554089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299382
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10472	NC_007604	GCA	2	6	555149	555154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10473	NC_007604	CGC	2	6	555191	555196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10474	NC_007604	TTAGT	2	10	555224	555233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10475	NC_007604	ATG	2	6	555259	555264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10476	NC_007604	C	6	6	555326	555331	0 %	0 %	0 %	100 %	81299384
10477	NC_007604	TGC	2	6	555391	555396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299384
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10480	NC_007604	GTT	2	6	555538	555543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10481	NC_007604	TTGC	2	8	555629	555636	0 %	50 %	25 %	25 %	81299385
10482	NC_007604	AGC	2	6	555703	555708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299385
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