MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007604	TC	3	6	26978	26983	0 %	50 %	0 %	50 %	81298836
502	NC_007604	ACCT	2	8	26994	27001	25 %	25 %	0 %	50 %	81298836
503	NC_007604	AAGCC	2	10	27011	27020	40 %	0 %	20 %	40 %	81298836
504	NC_007604	GCG	3	9	27039	27047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298836
505	NC_007604	CTG	2	6	27075	27080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298836
506	NC_007604	AGC	2	6	27088	27093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298836
507	NC_007604	GCC	2	6	27095	27100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298836
508	NC_007604	CGCC	2	8	27107	27114	0 %	0 %	25 %	75 %	81298836
509	NC_007604	CTGAG	2	10	27119	27128	20 %	20 %	40 %	20 %	81298836
510	NC_007604	TGC	2	6	27292	27297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298837
511	NC_007604	CAG	2	6	27307	27312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298837
512	NC_007604	GCG	2	6	27467	27472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298837
513	NC_007604	ACG	2	6	27493	27498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298837
514	NC_007604	GCT	2	6	27635	27640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298837
515	NC_007604	A	6	6	27671	27676	100 %	0 %	0 %	0 %	81298837
516	NC_007604	GCGG	2	8	27677	27684	0 %	0 %	75 %	25 %	81298837
517	NC_007604	TGC	2	6	27762	27767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298837
518	NC_007604	CAG	2	6	27876	27881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298837
519	NC_007604	A	6	6	27887	27892	100 %	0 %	0 %	0 %	81298837
520	NC_007604	GCG	2	6	27902	27907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298837
521	NC_007604	GTC	2	6	27923	27928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298837
522	NC_007604	TCG	2	6	27941	27946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298837
523	NC_007604	CCCAAG	2	12	27981	27992	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	81298837
524	NC_007604	GCT	2	6	28063	28068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_007604	ATGG	2	8	28096	28103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_007604	CTGT	2	8	28108	28115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
527	NC_007604	TCGGTG	2	12	28167	28178	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
528	NC_007604	GGA	2	6	28222	28227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81298838
529	NC_007604	ATCGA	2	10	28249	28258	40 %	20 %	20 %	20 %	81298838
530	NC_007604	CAG	2	6	28330	28335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
531	NC_007604	GCG	2	6	28379	28384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298838
532	NC_007604	GCG	2	6	28396	28401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298838
533	NC_007604	GAA	2	6	28466	28471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81298838
534	NC_007604	TCAG	2	8	28485	28492	25 %	25 %	25 %	25 %	81298838
535	NC_007604	GCG	2	6	28499	28504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298838
536	NC_007604	AACGC	2	10	28532	28541	40 %	0 %	20 %	40 %	81298838
537	NC_007604	TGC	2	6	28542	28547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298838
538	NC_007604	ACA	2	6	28596	28601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298838
539	NC_007604	GGC	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298838
540	NC_007604	GCA	2	6	28684	28689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
541	NC_007604	ATGG	2	8	28739	28746	25 %	25 %	50 %	0 %	81298838
542	NC_007604	GAT	2	6	28811	28816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298838
543	NC_007604	GT	3	6	28830	28835	0 %	50 %	50 %	0 %	81298838
544	NC_007604	TGG	2	6	28932	28937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298838
545	NC_007604	ACG	2	6	28991	28996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
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548	NC_007604	GCA	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
549	NC_007604	GCT	2	6	29158	29163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298838
550	NC_007604	GCTTTG	2	12	29183	29194	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	81298838
551	NC_007604	GCA	2	6	29210	29215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298838
552	NC_007604	TAGCGA	2	12	29223	29234	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	81298838
553	NC_007604	GCC	2	6	29239	29244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81298838
554	NC_007604	ATC	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298838
555	NC_007604	TGAG	2	8	29331	29338	25 %	25 %	50 %	0 %	81298838
556	NC_007604	GGCTGG	2	12	29377	29388	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	81298839
557	NC_007604	CAG	2	6	29549	29554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298839
558	NC_007604	TGG	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298839
559	NC_007604	TTG	2	6	29583	29588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81298839
560	NC_007604	ATC	2	6	29606	29611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298839
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564	NC_007604	TGC	2	6	29825	29830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298839
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568	NC_007604	GCT	2	6	30054	30059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298840
569	NC_007604	GCTG	2	8	30251	30258	0 %	25 %	50 %	25 %	81298840
570	NC_007604	TGGA	2	8	30307	30314	25 %	25 %	50 %	0 %	81298840
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574	NC_007604	CAG	2	6	30573	30578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298840
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589	NC_007604	AGCC	2	8	31702	31709	25 %	0 %	25 %	50 %	81298842
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593	NC_007604	TGG	2	6	31983	31988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298842
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597	NC_007604	GCG	2	6	32064	32069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298842
598	NC_007604	CAA	2	6	32133	32138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81298842
599	NC_007604	GGC	2	6	32141	32146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81298842
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607	NC_007604	TAG	2	6	32788	32793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007604	TC	3	6	32835	32840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_007604	ATC	2	6	32954	32959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81298843
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611	NC_007604	ATGT	2	8	33138	33145	25 %	50 %	25 %	0 %	81298843
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613	NC_007604	AGT	2	6	33242	33247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81298844
614	NC_007604	TTCG	2	8	33486	33493	0 %	50 %	25 %	25 %	81298844
615	NC_007604	TTAA	2	8	33536	33543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007604	CTA	2	6	33560	33565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_007604	TCAC	2	8	33587	33594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_007604	CT	3	6	33710	33715	0 %	50 %	0 %	50 %	81298845
619	NC_007604	TGC	2	6	33765	33770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81298845
620	NC_007604	A	7	7	33847	33853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007604	AGT	2	6	33865	33870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007604	CTA	2	6	33883	33888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_007604	CTT	2	6	33911	33916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_007604	TTG	2	6	33975	33980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007604	TAG	2	6	33997	34002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007604	TGC	2	6	34010	34015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_007604	CTT	2	6	34040	34045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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629	NC_007604	ATA	2	6	34086	34091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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761	NC_007604	GCTG	2	8	40193	40200	0 %	25 %	50 %	25 %	81298852
762	NC_007604	GCA	2	6	40209	40214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81298852
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879	NC_007604	TGGC	2	8	48483	48490	0 %	25 %	50 %	25 %	81298858
880	NC_007604	GTG	2	6	48600	48605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298858
881	NC_007604	TGG	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81298858
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