MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_007604	GCA	2	6	477019	477024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299300
9002	NC_007604	CAG	2	6	477035	477040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299300
9003	NC_007604	GCA	2	6	477046	477051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_007604	CTTT	2	8	477082	477089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_007604	CTT	2	6	477132	477137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_007604	AG	3	6	477205	477210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_007604	GCT	2	6	477233	477238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_007604	A	6	6	477329	477334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_007604	TTC	2	6	477423	477428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299301
9010	NC_007604	TTAC	2	8	477451	477458	25 %	50 %	0 %	25 %	81299301
9011	NC_007604	GCT	2	6	477512	477517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299301
9012	NC_007604	CTA	2	6	477532	477537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299301
9013	NC_007604	T	7	7	477585	477591	0 %	100 %	0 %	0 %	81299301
9014	NC_007604	GCTTTC	2	12	477605	477616	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	81299301
9015	NC_007604	TCTG	2	8	477649	477656	0 %	50 %	25 %	25 %	81299301
9016	NC_007604	TGT	2	6	477670	477675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299301
9017	NC_007604	TTG	2	6	477687	477692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299301
9018	NC_007604	A	7	7	477747	477753	100 %	0 %	0 %	0 %	81299301
9019	NC_007604	CTT	2	6	477843	477848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81299301
9020	NC_007604	GAA	2	6	477965	477970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81299301
9021	NC_007604	CAA	2	6	478124	478129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299301
9022	NC_007604	GA	3	6	478135	478140	50 %	0 %	50 %	0 %	81299301
9023	NC_007604	GAGC	2	8	478142	478149	25 %	0 %	50 %	25 %	81299301
9024	NC_007604	TGAT	2	8	478176	478183	25 %	50 %	25 %	0 %	81299301
9025	NC_007604	TACA	2	8	478358	478365	50 %	25 %	0 %	25 %	81299301
9026	NC_007604	GCA	2	6	478514	478519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299301
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9030	NC_007604	GAT	2	6	478865	478870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299301
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9033	NC_007604	TGG	2	6	479188	479193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299301
9034	NC_007604	TGA	2	6	479194	479199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299301
9035	NC_007604	AGT	2	6	479242	479247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299301
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9037	NC_007604	CAG	2	6	479476	479481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_007604	A	6	6	479533	479538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_007604	GAC	2	6	479539	479544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_007604	TGA	2	6	479591	479596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_007604	ATC	2	6	479674	479679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9042	NC_007604	GTT	3	9	479680	479688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_007604	CAT	2	6	479720	479725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299302
9044	NC_007604	GCA	2	6	479785	479790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299302
9045	NC_007604	CTG	2	6	479796	479801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299302
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9047	NC_007604	GCC	2	6	479871	479876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9048	NC_007604	CAAGC	2	10	479878	479887	40 %	0 %	20 %	40 %	81299303
9049	NC_007604	TGC	2	6	479941	479946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299303
9050	NC_007604	GCA	2	6	479993	479998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299303
9051	NC_007604	GCA	2	6	480008	480013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299303
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9057	NC_007604	GCT	2	6	480339	480344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299303
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9060	NC_007604	GCA	2	6	480590	480595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299303
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9062	NC_007604	TGGGGG	2	12	480655	480666	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	81299303
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9093	NC_007604	CGC	2	6	482436	482441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299304
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9096	NC_007604	CTC	2	6	482592	482597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9110	NC_007604	CCAT	2	8	483527	483534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9111	NC_007604	GCA	2	6	483572	483577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_007604	GCT	2	6	483590	483595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9119	NC_007604	TGA	2	6	483813	483818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81299307
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9493	NC_007604	GTG	2	6	503803	503808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299328
9494	NC_007604	GCA	2	6	503850	503855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299328
9495	NC_007604	CTG	2	6	504027	504032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299328
9496	NC_007604	C	6	6	504060	504065	0 %	0 %	0 %	100 %	81299328
9497	NC_007604	CG	3	6	504110	504115	0 %	0 %	50 %	50 %	81299328
9498	NC_007604	CCAT	2	8	504122	504129	25 %	25 %	0 %	50 %	81299328
9499	NC_007604	GA	3	6	504190	504195	50 %	0 %	50 %	0 %	81299328
9500	NC_007604	CTG	2	6	504274	504279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299328

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