MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus elongatus PCC 7942 chromosome

Total Repeats: 50389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_007604	GCTG	2	8	346578	346585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_007604	ACA	2	6	346630	346635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_007604	ATT	2	6	346765	346770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_007604	GAAG	2	8	346799	346806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_007604	ATTG	2	8	346878	346885	25 %	50 %	25 %	0 %	81299165
6506	NC_007604	TGC	2	6	346965	346970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6507	NC_007604	TG	3	6	347016	347021	0 %	50 %	50 %	0 %	81299165
6508	NC_007604	CAA	2	6	347033	347038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81299165
6509	NC_007604	GCT	3	9	347193	347201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6510	NC_007604	CGA	2	6	347239	347244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6511	NC_007604	CTG	2	6	347257	347262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6512	NC_007604	TTG	2	6	347282	347287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81299165
6513	NC_007604	GTAA	2	8	347471	347478	50 %	25 %	25 %	0 %	81299165
6514	NC_007604	CGC	2	6	347516	347521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299165
6515	NC_007604	CAG	2	6	347540	347545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6516	NC_007604	TGC	2	6	347576	347581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6517	NC_007604	GCG	2	6	347601	347606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299165
6518	NC_007604	CGC	2	6	347661	347666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299165
6519	NC_007604	CAG	2	6	347683	347688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299165
6520	NC_007604	GA	3	6	347730	347735	50 %	0 %	50 %	0 %	81299165
6521	NC_007604	TCA	2	6	347743	347748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81299165
6522	NC_007604	GCG	2	6	347763	347768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299165
6523	NC_007604	CG	3	6	347771	347776	0 %	0 %	50 %	50 %	81299165
6524	NC_007604	CGAT	2	8	347810	347817	25 %	25 %	25 %	25 %	81299165
6525	NC_007604	GGT	2	6	347888	347893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299165
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6527	NC_007604	CGT	2	6	347930	347935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
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6533	NC_007604	CTG	2	6	348196	348201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299165
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6548	NC_007604	CGA	2	6	348854	348859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299166
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6551	NC_007604	CAG	2	6	349087	349092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299167
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6555	NC_007604	AAAT	2	8	349322	349329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_007604	TTG	2	6	349433	349438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_007604	G	6	6	349440	349445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_007604	GAGTC	2	10	349453	349462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6560	NC_007604	GGT	2	6	349830	349835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_007604	TTG	2	6	349860	349865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_007604	T	6	6	349880	349885	0 %	100 %	0 %	0 %	81299168
6563	NC_007604	GGAG	2	8	349906	349913	25 %	0 %	75 %	0 %	81299168
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6588	NC_007604	CAG	2	6	350838	350843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299168
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6594	NC_007604	ACCAA	2	10	351152	351161	60 %	0 %	0 %	40 %	81299168
6595	NC_007604	GCTG	2	8	351164	351171	0 %	25 %	50 %	25 %	81299168
6596	NC_007604	CTG	2	6	351217	351222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81299168
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6602	NC_007604	CCG	2	6	351446	351451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81299169
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6995	NC_007604	GGC	2	6	371114	371119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81299187
6996	NC_007604	AGC	2	6	371161	371166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81299187
6997	NC_007604	CCGCT	2	10	371259	371268	0 %	20 %	20 %	60 %	81299187
6998	NC_007604	TGCTG	2	10	371293	371302	0 %	40 %	40 %	20 %	81299187
6999	NC_007604	GGT	2	6	371319	371324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299187
7000	NC_007604	GTG	2	6	371338	371343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81299187

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